Studiefiche - studiegids UGent

Studiefiche
Vanaf academiejaar 2016-2017
Metabolische engineering (C002717)
Cursusomvang
(nominale waarden; effectieve waarden kunnen verschillen per opleiding)
Studiepunten 3.0
Studietijd 80 u
Contacturen
25.0 u
Aanbodsessies en werkvormen in academiejaar 2016-2017
A (semester 1)
hoorcollege
15.0 u
werkcollege
10.0 u
Lesgevers in academiejaar 2016-2017
Goossens, Alain
WE09
Aangeboden in onderstaande opleidingen in 2016-2017
Master of Science in Bioinformatics (afstudeerrichting Systems
Biology)
Master of Science in Biochemistry and Biotechnology
Master of Science in de biochemie en de biotechnologie
Uitwisselingsprogramma Biochemie en biotechnologie (niveau
master)
Uitwisselingsprogramma Bioinformatics (niveau master)
Verantwoordelijk lesgever
stptn
3
aanbodsessie
A
3
3
3
A
A
A
3
A
Onderwijstalen
Engels
Trefwoorden
Natuurproducten, biosynthese, biotechnologie, genetisch engineeren, metabolisme,
planten, micro-organismen
Situering
Deze cursus beoogt via hoor- en werkcolleges de student (1) een theoretisch inzicht te
geven in de organisatie van het metabolisme in planten en micro-organismen, en (2)
een praktisch inzicht te laten verwerven in de biotechnologie van complexe
biosynthesewegen in levende organismen.
Deze cursus wordt gegeven in het tweede masterjaar in de major/minor biochemie en
structurele biologie en de major/minor microbiële biotechnologie. Deze cursus sluit aan
bij de cursussen Enzymologie en Protein engineering/Molecular design uit masterjaar 1
uit dezelfde major/minor. Deze cursus sluit tevens in zekere mate aan bij de cursus
Toegepaste Plantenbiotechnologie uit het tweede masterjaar van de major/minor
Plantenbiotechnologie en de cursussen Bacteriële biotechnologie en Fungale
biotechnologie uit het tweede masterjaar van de major/minor microbiële biotechnologie.
Dit opleidingsonderdeel sluit aan bij volgende opleidingscompetenties: Ma.WE.BB.1.1;
Ma.WE.BB. 1.2; Ma.WE.BB. 1.8; Ma.WE.BB. 1.9; Ma.WE.BB.2.1; MA.WE.BB.2.2.; Ma.
WE.BB.2.7; Ma.WE.BB.3.1; Ma.WE.BB.3.4; Ma.WE.BB.3.5; Ma.WE.BB.4.3; Ma.WE.
BB.5.1; Ma.WE.BB.6.2.
Inhoud
De volgende aspecten en begrippen van het metabolisme in planten en microorganismen en het metabolisch engineeren daarvan zullen behandeld worden:
• Definities, classificaties, functies, eigenschappen en toepassingen van secundaire
• metabolieten uit micro-organismen en planten.
• Biosynthesewegen van secundaire metabolieten en hun regulatie in micro• organismen en planten (fysiologisch, biochemisch en moleculair-genetisch).
• Functioneel-genomische benaderingen om (secundair) metabolisme te bestuderen
• (bio-informatica en genoom-, transcriptoom-, proteoom- en
• metaboloomprofileringen): theorie en praktische voorbeelden.
• Synthetische biologie: theorie en praktische voorbeelden.
(Goedgekeurd)
1
• Metabolisch engineeren in micro-organismen en planten: theorie en praktische
• voorbeelden.
• Metabolisch engineeren in vitro: theorie en praktische voorbeelden.
• Combinatorische biochemie: theorie en praktische voorbeelden.
• Biotransformatie & Mutasynthese: theorie en praktische voorbeelden.
• Natuurlijke diversiteit, metagenomics en `directed evolution´
• Metagenomics: theorie en praktische voorbeelden
• Metabolisch modelleren
Begincompetenties
Basis wetenschappelijke kennis moleculaire biologie, biotechnologie en biochemie
Eindcompetenties
Theoretisch en praktisch inzicht in de biotechnologie van complexe biosynthesewegen
in planten en micro-organismen.
Creditcontractvoorwaarde
Toelating tot dit opleidingsonderdeel via creditcontract is mogelijk mits gunstige beoordeling
van de competenties
Examencontractvoorwaarde
Dit opleidingsonderdeel kan niet via examencontract gevolgd worden
Didactische werkvormen
Hoorcollege, werkcollege
Toelichtingen bij de didactische werkvormen
De werkcolleges bestaan uit een sessie met een begeleide oefening en een sessie met
PC-klasoefeningen. Aanwezigheid bij de werkcolleges en de laatste twee hoorcolleges
(verbonden aan de begeleide oefening) is verplicht.
Leermateriaal
Powerpoint voorstellingen, artikels uit wetenschappelijke tijdschriften
Geraamde totaalprijs: 5 EUR
Referenties
X
Vakinhoudelijke studiebegeleiding
Interactieve ondersteuning via Minerva, e-mails
Evaluatiemomenten
periodegebonden evaluatie
Evaluatievormen bij periodegebonden evaluatie in de eerste examenperiode
Schriftelijk examen, mondeling examen
Evaluatievormen bij periodegebonden evaluatie in de tweede examenperiode
Schriftelijk examen, mondeling examen
Evaluatievormen bij niet-periodegebonden evaluatie
Tweede examenkans in geval van niet-periodegebonden evaluatie
Niet van toepassing
Toelichtingen bij de evaluatievormen
Mondeling examen met schriftelijke voorbereiding
Eindscoreberekening
Op basis van examen
(Goedgekeurd)
2