DEEL 1 Genetica Thema 3 Modificaties en mutaties 1 Interactie tussen genen en omgeving: begrippen 1.1 Nature / nurture Nature: natuurlijke aanleg, genen Nurture: omgevingsinvloeden 1.2 Genetica / epigenetica Genetica erfelijke informatie in de DNA-basenvolgorde Epigenetica erfelijke aanpassingen in de genexpressie • genen ‘aan en uit’ zetten door veranderingen op het DNA of chromatine 1.3 Modificatie / mutatie Modificatie verandering in fenotype door omgevingsinvloeden • Niet erfelijke modificatie • Epigenetische modificatie kan erfelijk zijn Mutatie verandering in genotype door wijziging in DNA 2 Voorbeelden van nieterfelijke modificaties 2.1 Proef van Bonnier Modificatie verschillend fenotype Niet erfelijk 2.2 Niet-erfelijke modificaties in de natuur Voorbeeld: pijlkruid (Sagittaria sagittifolia) ondiep, stilstaand water diep, stromend water Voorbeeld: ontwikkeling van werkster en koningin bij honingbijen 3 Epigenetische modificaties 3.1 Verandering op DNA: DNA-methylering Genen kunnen niet tot expressie komen vb: methylering van 1 X-chromosoom Barr-lichaampje 3.2 Verandering van chromatinestructuur Histonacetylering euchromatine 4 Oorzaken van mutaties 4.1 Spontane mutaties Sequentie van de basen kan wijzigen (A en G of C en T kunnen onderling verwisseld worden) Structuur van een base kan veranderen: cytosine wordt soms spontaan omgevormd tot uracil (puntmutatie) 4.2 Geïnduceerde mutaties Gevolg van milieufactoren mutagene factoren 4.2.1 Stralingen Röntgen en radioactieve straling Ontstaan van vrije radicalen (deeltjes met ongepaarde elektronen) basen kunnen veranderen Kunnen breuken in suiker-fosfaatruggengraad doen ontstaan Ultraviolette straling Ontstaan van thyminedimeren (T-T) Bij reparatie kan DNA breken mutatie 4.2.2 Chemische stoffen Tabaksrook, drugs, asbest, zware metalen, pesticiden, … 4.3 DNA-herstelmechanisme Werking van specifieke herstelenzymen Controle en opsporen van fouten Verwijderen van gemuteerde DNA-streng rond de fout Synthese nieuw DNA met niet-gemuteerde streng als matrijs Verbinden van de nieuwe DNA-streng met de originele streng 5 Soorten mutaties Mutaties kunnen op verschillende manieren ingedeeld worden: Naargelang ze optreden in lichaamscellen of kiemcellen: somatische mutaties en germinale mutaties Naargelang de omvang van het betrokken DNA: genmutatie, chromosoommutatie of genoommutatie Naargelang de gevolgen voor de proteïne (fenotype): verliesmutatie, stille mutatie of winstmutatie 5.1 Soorten mutaties volgens de cellen waarin ze zich voordoen 5.1.1 Somatische mutaties in lichaamscellen niet erfelijk kanker 5.1.2 Germinale mutaties in kiemcellen of gameten kiembaanmutaties erfelijk bv. bepaalde vormen van borstkanker 5.2 Soorten mutaties volgens de omvang van het gewijzigde DNA Genmutaties Chromosoommutatie Genoommutatie De basensequentie van een gen is veranderd. De structuur van de afzonderlijke chromosomen is veranderd. Het aantal chromosomen is veranderd. Cri-du-chat syndroom: deletie op chromosoom 5 Syndroom van Down: trisomie 21 Witte tijger: geen pigment voor rood en geel door puntmutatie 5.2.1 Genmutaties Veranderingen in het DNA in slechts één of enkele basenparen vormen van genmutaties Transversie Een basenpaar wordt omgekeerd. Transitie Een basenpaar wordt vervangen door een ander. Deletie Eén of meer nucleotiden vallen weg. insertie Eén of meer nucleotiden worden ingevoegd. Transversie en transitie zijn puntmutaties Genmutaties kunnen ernstige fenotypische gevolgen hebben • Transversie: voorbeeld sikkelcelanemie Oorzaak: puntmutatie in het hemoglobinegen op chromosoom 11 AT wordt TA basensequentie in het hemoglobinegen normaal na transversie ---- G A A ------- C T T ---- ---- G T A ------- C A T ---- transcriptie basensequentie in mRNA ---- G A A ---- ---- G U A ---- translatie aminozuursequentie Val - His - Leu - Thr - Pro - Glu - Val - His - Leu - Thr - Pro - Val - Wordt autosomaal codominant overgeërfd 3 fenotypen AA normale RBC AS symptoomloos met normale RBC en sikkelcellen maar voordeel tegen malaria SS sikkelcelanemie • Transitie: voorbeeld methemoglobinemie Oorzaak: milieufactoren of puntmutatie in het hemoglobinegen CG wordt TA basensequentie in het hemoglobinegen normaal na transitie ---- C A T ------- G T A ---- ---- T A T------- A T A ---- transcriptie basensequentie in mRNA ---- C A U ---- ---- U A U ---- translatie aminozuursequentie ---- His ---- ---- Tyr ---- Wordt autosomaal recessief overgeërfd 2 fenotypen AA normaal hemoglobine Aa normaal hemoglobine aa methemoglobinemie • Deletie: voorbeeld mucoviscidose Oorzaak: deletie van 3 basen in CFTR-gen op chromosoom 7 leesraamverschuiving basensequentie in het CFRT-gen normaal na deletie -TAGTAGAAACCACAA - ATCAT CT T TGGTGTT - -TAGTAACCACAA - ATCAT TGGTGTT - transcriptie basensequentie in mRNA - AUCAUCUUUGGUGUU - - AUCAUUGGUGUU - translatie aminozuursequentie - Ile - Ile - Phe - Gly - Val - - Ile - Ile - Gly - Val - Wordt autosomaal recessief overgeërfd 2 fenotypen AA normaal hemoglobine Aa normaal hemoglobine aa mucoviscidose • Insertie: voorbeeld ziekte van Huntington Oorzaak: invoeging van extra basenherhalingen (-CAG-) in het Huntington-gen op chromosoom 4 (meer dan 40 ipv minder dan 27) basensequentie in het Huntington-gen (5’ 3’) normaal na insertie < 27 herhalingen CAG > 40 herhalingen CAG transcriptie basensequentie in mRNA < 27 herhalingen CAG > 40 herhalingen CAG translatie aminozuursequentie < 27 herhalingen Gln > 40 herhalingen Gln Wordt autosomaal dominant overgeërfd 2 fenotypen aa gezond Aa ziekte van Huntington AA ziekte van Huntington 5.2.2 Chromosoommutaties chromosoommutaties Deletie Een losgekomen chromosoomstuk gaat verloren. Inversie Duplicatie Een losgekomen Een chromosoomstuk chromosoomstuk verdubbelt zich. voegt zich omgekeerd weer in in hetzelfde chromosoom. translocatie Verplaatsing van chromosoomstukken tussen 2 niethomologe chromosomen. • Deletie: voorbeeld cri-du-chatsyndroom Oorzaak: verlies van het eindstuk van de parm van chromosoom 5 (1/50 000) Deletie van een tussenstuk is ook mogelijk • Inversie: meestal geen afwijking Oorzaak: omgekeerd invoegen van losgekomen stuk DNA Bij de mens meestal op chromosoom 9 Niet schadelijk maar wel verhoogd risico op miskraam • Duplicatie: voorbeeld ontstaan van α- en ß-keten bij hemoglobine Oorzaak: verdubbeling van een gen als 2 homologe chromosomen breken op niet-homologe plaatsen Oorspronkelijk 1 gen voor hemoglobine; nu gen voor α-keten en gen voor ß-keten • translocatie: voorbeeld Philadelphiasyndroom Oorzaak: verplaatsing van chromosoomstukken tussen 2 niet-homologe chromosomen Philadelphiachromosoom: stuk van chromosoom 9 wisselt met stuk van chromosoom 22 fusie-gen op chromosoom 22 vorm van leukemie • Fragiele-X-syndroom Zo genoemd omdat het laatste stukje van het chromosoom gemakkelijk een breuk vertoont. Het is verantwoordelijk voor de meest voorkomende vorm van mentale achterstand. Dit syndroom komt voor bij ongeveer 1 op 4000 personen. De afwijking wordt zowel bij mannen als bij vrouwen aangetroffen, maar bij mannen komt het meer voor en is de mentale achterstand altijd ernstiger want het Y-chromosoom draagt geen gen dat het defecte gen op het Xchromosoom kan compenseren. Nonkel en neef met fragiele-X 5.2.3 Genoommutaties Veranderingen in aantal chromosomen Zijn een gevolg van non-disjunctie in meiose 1 of 2+ Homologe chromosomen (meiose 1) of zusterchromatiden (meiose 2) worden niet gesplitst trisomie of monosomie Uitleg over de symbolische voorstelling van mutaties 46,XY betekent 46 chromosomen (= een normaal aantal), XY duidt op een mannelijk geslacht. 47,XX,+21 betekent 47 chromosomen (1 teveel dus), XX = vrouwelijk geslacht, +21 betekent dat chromosoom nummer 21 extra aanwezig is. Dit komt voor bij personen met mongolisme (trisomie 21, syndroom van Down genoemd). 46,XX/46,XY is een voorbeeld van een mozaïek- of chimeer-individu. Er zijn in het lichaam cellen aanwezig met 46,XX en tevens cellen met 46,XY. Hierdoor ontstaat mozaïek- of chimeerhermafroditisme (tweeslachtigheid). (Mozaïek- individu stamt af van 1 zygoot; chimeer-individu stamt af van meer dan 1 zygoot) MOZAÏEK 46,XY 45,X 46,XY Indien nu bepaalde cellen 46,XY hun Y-chromosoom 46,XY 45,X verliezen. 45,X X Eicel 45,X Y 46,XY 45,X Zaadcel 45,X/46,XY Uit 1 bevruchte eicel ontstaan door deling lichaamscellen met verschillende erfelijke samenstelling. Deze cellen liggen door elkaar en komen voor over heel het lichaam. CHIMEER 2 bevruchte eicellen 46,XX 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XX 46,XX X X Eicel met twee kernen 46,XX 46,XX 46,XX 46,XX 46,XX Zaadcel met X Zaadcel met Y 46,XX 46,XX/46,XY Hermafroditisme CHIMEER 2 bevruchte eicellen die bij elkaar blijven 46,XX 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XY 46,XX 46,XX 46,XX 46,XX 46,XX 46,XX 46,XX 46,XY 2 ovulaties. 1 eicel wordt bevrucht met een zaadcel met X, de andere eicel met zaadcel met Y 46,XY 46,XX 46,XX 46,XX/46,XY Hermafroditisme Bepaalde delen van het lichaam bezitten een andere erfelijke samenstelling dan andere delen van het lichaam. CHIMEER En ik dan? Dit dier ontstond door combinatie van schapenembryocellen met geitenembryocellen. Dit “gaapje” of “scheitje” bezit bepaalde delen met kenmerken van een schaap en andere delen met kenmerken van een geit. Zo is ook een chimeer bekend van een kwartel en een kip, de “kwip” genaamd. • Trisomie 21 of syndroom van Down 1/800 47, XX (of XY), +21 Non-disjunctie meestal bij oögenese hoe ouder de moeder, hoe meer kans 20 j: 1/1600, 30 j: 1/900, 35 j: 1/300, 40 j: 1/110, 44 j: 1/35. • Trisomie 9 Zeldzaam 47,XY(of XX),+9. Andere oorvorm, vergroeiing van beenderen en vingers, onvolledig ontwikkelde geslachtsorganen, mentale en psychomotorische achterstand (lopen op 5 j, eerste woorden op 6 jaar). Enkel levensvatbaar als mozaïek Bv. 47,XY,+9/46,XY • Trisomie 13 (Patau syndroom) 47,XY(of XX),+13. Zes vingers en zes tenen. Nog veel andere ernstige misvormingen. Overlijden kort voor of na de geboorte (max. 6 maand) 1/19000 • Trisomie en monosomie van geslachtschromosomen Syndroom van Klinefelter (47,XXY) Jongens. Niet-ontwikkelde teelballen (steriel) Vrouwelijke kenmerken (borstontwikkeling 1/3). 1 Barr-lichaampje. Ook mozaïek mogelijk 1/1000 Syndroom van Turner (45,X) (monosomie X) Meisjes. Nekvliezen. Misvormde oorschelpen. 1/10000 Geen Barr-lichaampje in de kernen van de cellen. Slechts 1 tot 2% wordt levend geboren incidentie dus hoger dan 1/10000 Vertraagde lengtegroei. Onvolledig ontwikkelde voortplantingsorganen en achterblijven van normale secundaire geslachtskenmerken. Mozaïek komt voor: 46,XX/45,X 47,XXX/45,X 47,XXX/46,XX/45,X 5.3 Soorten mutaties volgens de effecten op de proteïne 5.3.1 Verliesmutaties Mutaties in coderend DNA proteïnedefect Gevolg: ziekten of afwijkingen Voorbeelden: muco, Huntington, sikkelcelanemie, … 5.3.2 Stille mutaties Mutaties in coderend DNA zonder effect op AZ-sequentie (de meeste AZ hebben meer dan één codon). 5.3.3 Winstmutaties Mutaties in coderend DNA waarbij een beter functionerend gen ontstaat. 6 Mutaties en het ontstaan van kanker 6.1 Carcinogenese Mutaties in groeiregelende genen kanker Kankercel ontstaat pas na meerdere mutaties 6.2 Carcinogene factoren Stralingen Bepaalde chemische stoffen (bv. tabaksrook) Sommige virussen (bv. humaan papillomavirus) 6.3 Kanker, een ziekte van genen Proto-oncogenen: coderen voor groeifactoren stimuleren de celdeling Tumorsuppressorgenen: rol in remming van de celdeling Vele kankercellen kunnen onvoldoende adhesiemoleculen (glycoproteïnen) vormen losse kankercellen metastaseren uitzaaiingen 6.4 Genrepressie bij bestrijding van kanker 6.4.1 Telomerasegen Telomeren: uiteinden van chromosomen DNA-repeats: mens (TTAGGG)n Elke replicatie verkorting telomeren beperkt aantal celdelingen (bij somatische cellen) Telomerase kan verkorte telomeren herstellen, maar het gen wordt in somatische cellen onderdrukt In kankercellen wordt telomerasegen niet onderdrukt blijven delen Repressie van het telomerasegen zou kanker kunnen helpen bestrijden onderzoek 6.4.2 Angiogenese Vorming van nieuwe bloedvaten Zorgt voor betere doorbloeding van weefsels Kankerweefsel produceert veel angiogene factoren krijgt veel O2 en voedingsstoffen kan blijven groeien Repressie van genen voor angiogene factoren zou groei van kankergezwel kunnen afremmen / stoppen / krimpen onderzoek