Module CELLEN PERIODE ONTWIKKELINGSBIOLOGIE EN MOLECULAIRE BIOLOGIE Rudolf Steinercollege Haarlem. Augustus 2015. Module: Cellen 1 Module CELLEN WELKOM!!! Bij deze periode. • Veel theorie en veel practica! • Iedereen kan meedoen; ook de mensen die geen Bio hebben • Huiswerk is verslagen + vragen (zie handleiding en site) • Afsluiting is digitale verslagenbundel + SO en telt beiden mee! • Wij werken met laptops/smartphone / tablet. www.rshbiologie.nl is dé site waarop alles staat! • We werken in drie weken zes modulen door: www.rshbiologie.nl Module: Cellen 2 Module CELLEN AFSPRAKEN. • We beginnen om 8:30 en stoppen om 9:55. • Opruimen gezamenlijk. (we hebben soms veel troep) • Zorg dat je thuis de verslagen bijhoudt: We doen al veel in de lessen. • De leerlinghandleiding (site->module overzicht) vertelt precies wat je wel/niet moet doen/weten. • • • • Dagje gemist? Kijk op de site. Alle info staat daar! Vooruit spieken? Kan… Zinvol? Ja! Soms wel. Planning is wel strak, maar niet heilig. Neem ELKE dag laptop/smartphone/ tablet mee (+ earphones graag!) Module: Cellen 3 Module CELLEN Inhoud. Cellen en Celstructuren: CELLEN Klassieke Genetica: GENCLASSIC Mol. Biologie: MOLGEN1 Mol Bio/ Technieken: MOLGEN2 Planten en ziekten: SOLANUM1 PRAKTICUM Solanum: DNALAB1 Module: Cellen 4 Module CELLEN. Welke verslagen zijn er? Module Practicum Inhoud Verslagvorm CELLEN Ui maken eigen preparaten van de rokken van (rode) ui. kort CELLEN tulp maken van stengelcoupes van de tulp kort CELLEN mos,alg, schimmel Bekijken van mos,alg en schimmel kort GENCLASSIC1 drosophila-1 Bekijken balsempreparaten fruitvlieg kort GENCLASSIC1 Bacteriën Maken van bacterie-kweken , reinstrijk uitgebreid GENCLASSIC1 drosophila-1 Ontwikkelstadia bekijken vanuit de kweekbuizen. kort MOLGEN1 DNA-isolatie Isolatie DNA uit kiwi kort MOLGEN2 Gel Maken van een gel voor electroforese kort MOLGEN2 ICT Ict opdracht: Nagaan genoom kort SOLANUM1 ICT Ict-opdracht: Genoomanalyse Solanum uitgebreid: 11 uitgewerkte opdrachten. DNA1 DNA Gen-detectie met PCR en gelelectroforese uitgebreid Module: Cellen 5 Module CELLEN Wat is KORT?? Of UITGEBREID? KORT (dit verslag past op 1 A4-tje (excl. tekeningen)) korte omschrijving van het practicum in max 20 zinnen. korte beschrijving wat de resultaten waren (Max 10 zinnen) tekeningen. (Zie URL: tekenregels met namen) Eigen visie getuigend van begrip van het practicum (max 6 zinnen) (Wat gebeurde er, wat was er te zien, waarom, wat ging er mis… etc) UITGEBREID (dit verslag eist minimaal 2-3 A4-tjes (excl. tekeningen)) uitvoerigere omschrijving van het practicum in max 50 zinnen betekenis van het practicum: waarom doen we dit, wat moet er uit komen, welke materialen hebben we gebruikt, welke techniek. beschrijving wat de resultaten waren (ca 20 zinnen) tekeningen. (Zie URL: tekenregels met namen) Eigen visie getuigend van begrip van het practicum (max 6 zinnen) Module: Cellen 6 Module CELLEN • Je zal moeten wennen aan deze TOTAAL ANDERE manier van werken. • Maak gebruik van de site, internet om dingen op te zoeken, te beluisteren ed. • Leer Internet niet te kopieeren (leer je niks) maar als bron te gebruiken. • Eerst even kijken op de site: www.rshbiologie.nl en lees de leerling handleiding!!!!!!!!! • Pfff… dan gaan we verder met de eerste module: CELLEN. Module: Cellen 7 Module CELLEN DE CEL: • • Hoe ziet het eruit? • Wat kan je onder de microscoop zien? • • Hoe denkt men er NU over? Is er verschil tussen planten en dieren? http://www.ted.com/talks/drew_be rry_animations_of_unseeable_biolog y.html Module: Cellen 8 Module CELLEN De Cel • Makkelijk te bestuderen plantencellen: • • • • • Verschillen/Kenmerken: Chloroplasten Stevige celwand (grote) Vacuolen Celorganellen: Kern Mitochondrien ER, RER Lysosomen Cytoskelet Chloroplasten Golgi etc.. Module: Cellen 9 Module CELLEN De Cel • Diercellen zien er anders uit: • • • • Verschillen/kenmerken: Geen chloroplasten Geen stevige celwand Mechanismen om andere cellen te verbinden: desmosomen, junctions etc Filmpje: https://www.youtube.com/watch?v=gF uEo2ccTPA Module: Cellen 10 Module CELLEN De Cel in het algemeen Eerst even dit: http://www.youtube.com/watch?v=TYxDoP9ABHc Later bekijken: http://www.youtube.com/watch?v=GigxU1UXZXo En deze: http://www.ted.com/talks/david_bolinsky_animates_a_cell.html https://www.youtube.com/watch?v=uUEGPEBSfYM 1. In ons onderwijs wordt de cel voorgesteld door een stilstaand plaatje. Microscopen tonen dezelfde dode wereld! (helaas) 2. Cellen leven, delen, groeien en sterven bij duizenden per minuut in je lichaam. 3. 4. Bamboe groeit 30 cm/dag.. Imagine! 5. In deze module proberen we het leven in de cellen te zien! Een DNA molecuul is heeeeel dun (2 nm) en 2 meter lang en past toch in elke cel! Module: Cellen 11 Module CELLEN De Cel in het algemeen • Bevat de stoffen om suikers om te zetten in Energie (metabolische afbraak) • Plant: mbv Chloroplasten wordt met zonlicht juist E gemaakt. (syntheseprocessen). • Celmetabolisme staat onder besturing van een enorme reeks biochemische gekatalyseerde processen • Elke cel bevat DNA dat middels transcriptie en translatie de cel voorziet van allerlei soorten eiwitten: Structuureiwitten (collageen, celmembraaneiwitten ed) Enzymen (=katalysator van biochem processen) Antistoffen(Afweer), celmembraanproteinen, glycoproteinen, Lipoproteinen. Module: Cellen 12 Module CELLEN De Celtypen • • Bij de mens: ca 200 celtypen Bij planten minstens zoveel: zie plantenblad: 6 celtypen: Epidermis (onder en boven) Bladmoescellen (palissadenparenchym en sponsparenchym) Huidmondjes (Openingen voor gasuitwisseling) Haren/stekels (bescherming, luchtturbulentie) • Plantenstengel: (doorsnede): epidermiscellen, xyleem, floeem, • In practicum zien we cellen in de stengel van de tulp en cellen van de (rode) ui. • Ook komen we eencelligen tegen (makkelijk te halen uit slootwater of oud bloemenwater). sklerenchym, parenchym, kurkcellen, lenticellen, cambiumcellen, etc… Module: Cellen 13 Module CELLEN Module: Cellen Opbouw plantencellen 14 Module CELLEN Stengels En Vaten. Module: Cellen 15 Module CELLEN Celtypen: vaten. Module: Cellen 16 Module CELLEN Module: Cellen 17 Module CELLEN Meer zinvolle plaatjes? Kijk op de site van de RadboudUniversiteit: http://www.vcbio.science.ru.nl/virtuallessons/stemgrowthslides/ Deze link staat ook op onze site bij bronnen! Module: Cellen 18 Module CELLEN In het practicum maak je verder kennis met de diverse cellen van de plant. We hebben Rode Ui en (als het gelukt is: Tulp). --------------------------------------------------------NU: CELDELINGEN (MITOSE-PROCES) Module: Cellen 19 Module CELLEN De Celdelingen (mens, dier) • • Na bevruchting van de eicel, ontstaat een zygote. • Het bolletje cellen dat nu ontstaat, wordt hol (gastrulastadium) • • Er ontstaat een “boven” en “onder” polariteit. Deze gaat zich in de eerste instantie vermeerderen tot een 2,4,8,16,32 cellig stadium. Cellen gaan zich langzaam differentieren vanuit stamcellen in celtypen: Epidermale cellen (huid, bekleding van darm, mond, bloedvat, nier) Zenuwcellen, Bot en kraakbeencellen, Spiercellen, Bloedcellen, etc Module: Cellen 20 Module CELLEN De Celdeling Waarom? Groei Onderhoud Herstel na beschadiging (regeneratie) Hoe? Cel bereidt de deling voor, door: DNA verdubbeling DNA wordt compact in chromosomen Chromosomen worden ruimtelijk netjes verdeeld Chromosomenuiteen Cel deelt zich: diercellen snoeren in, plantencellen laten een tussenwand ontstaan. Gewone celdeling: MITOSE Vorming geslachtscellen: MEIOSE (I en II) Module: Cellen 21 Module CELLEN De Gewone celdeling • Mitoseproces kost enkele uren • • Chromosoomsamenstelling Aantal chromosomen gevolg van evolutie en zegt niks over de complexiteit van dat organisme. Mens: 23 paar Duif: 16 paar Enkele planten; soms meer dan 100! Fruitvlieg: 4 paar. Module: Cellen 22 Module CELLEN De Celdeling: Mitose De mitose 1. 2. 3. 4. Duurt enkele uren Meeste tijd =DNA-verdubbeling De deling zelf is in 30 minuten klaar. In dit voorbeeld heeft elke cel 2 verschillende chromosomen. Kort en lang. Elk in duplo met elke partner eigen kleur. Module: Cellen 23 Module CELLEN De Celdeling Zo ziet dat er onder de microscoop uit…. Pas op: dit preparaat Is wel gekleurd! Module: Cellen 24 Module CELLEN De Celdeling: Mitose Wat kan er mis gaan in dit proces? Gevolgen? Dus is het proces STRAK gereguleerd! Hierover later veel meer… Module: Cellen 25 Module CELLEN De Celdeling: MEIOSE • Als je een zaadcel met een eicel wilt laten versmelten, moet er geen dubbele hoeveel DNA aanwezig zijn. • • Dus eerst de hoeveelheid DNA halveren • Elke cel is bij hogere organismen voorzien van een dubbele portie erfelijke informatie (DNA) • Bij de vorming van geslachtscellen wordt die hoeveelheid gehalveerd tot een enkelvoudige portie. • Na bevruchting ontstaat een zygote uit twee cellen (ei, zaad) die samen weer een cel geven die de dubbele hoeveelheid bevat. Blijkbaar bezit elke cel dus al dubbele informatie, anders zo deze halvering leiden tot sterk informatieverlies! Module: Cellen 26 Module CELLEN De Cel MEIOSE-PROCES • Dus eerst de vorming van cellen met de halve info: Dan volgt nog een mitose-achtig proces: vermeerdering van geslachtscellen Module: Cellen 27 Module CELLEN Nog eens anders getekend: Module: Cellen 28 Module CELLEN De Celdelingen (enkele filmpjes) Filmpjes staan NIET bij de bronnen!! MITOSE (filmpje) MITOSE én MEIOSE (Spaanse versie!) MEIOSE (heel duidelijk filmpje!!) (en ook een Deense versie (beetje humor)) Module: Cellen 29 Module CELLEN De “inhoud” van de chromosomen: • • • Wat wordt er nu feitelijk verdeeld? • DNA bestaat uit gebieden die informatie bevatten die moet leiden tot de productie van een eiwit: coding regions • DNA bevat veel grote lege gebieden die geen codingfunctie hebben, mogelijk wel een besturende rol vervullen • DNA wordt vertaalbaar gemaakt middels methylering (Epigentica) en vormt een deel van de besturing • Gregor Mendel wist niets van DNA trouwens…. Chromosomen: slim opgerold/verpakt DNA DNA-streng bij mens per cel 2000 millimeter lang en maar 0.0000002 mm breed… Module: Cellen 30 Module CELLEN De Cel en de erfelijkheid • Erfelijkheid is de overdracht van kenmerken van het organismen op zijn nageslacht. Met geslachtelijke voortplanting (zaad, ei, bevruchting) of ongeslachtelijk (kloneren, stekken, uitlopers: Aardbei etc) • Bij de meiose worden dus geslachtscellen (gemeten) gevormd die over een enkele hoeveelheid erffactoren beschikken • Stel: je oogkleur wordt bepaald door de factor A. A zorgt voor bruine ogen en a voor blauwe. • • Blijkbaar zijn er twee typen van dit gen: allelen genaamd. • Zo bevat jou erfinfo ook een gen voor haarkleur: B en b. Het allel A (bruine ogen) geschreven met een hoofdletter want dominant over a (blauwe ogen) en is recessief. Module: Cellen 31 Module CELLEN De Kenmerken: oogkleur bij de mens • Er zijn nu meer mogelijkheden: Een persoon met Bruine ogen zal in zijn cellen dus AA zijn of Aa. In beide gevallen heeft deze persoon bruine ogen; het verschil is niet zichtbaar. Een ander persoon met blauwe ogen is genetisch alleen aa. (Waarom?) Bedenk dat ELKE cel in je lichaam deze info over oogkleur heeft; alleen de cellen van je iris (oog) doen er iets mee. Je levercellen benutten deze informatie niet; daar staat dit kenmerk uitgeschakeld. In de lever staan andere genen aan, die in het oog weer uit staan… Module: Cellen 32 Module CELLEN De Meiose nog eens: Let op waar een erffactor terecht kan komen.. In de meiose wordt het DNA eerst verdubbeld en daarna twee keer verdeeld: 2n -> 2x 2n -> 4 x n… (tel het aantal gekleurde streepjes maar) Module: Cellen 33 Module CELLEN De Erfelijkheid: In de volgende module meer over de klassieke genetica: GENCLASSIC In de modulen MOLGEN1 gaan we in op de moleculaire achtergrond van de genetica. In MOLGEN2 maken we kennis met de DNA-technieken uit het lab. Module: Cellen 34 Module CELLEN Het practicum • • Laat je de diversiteit van celtypen zien. • • Leert je op de juiste wijze tekenen. (zie bronnen -> site) • 1. 2. 3. Kijk nu on-line in de leerling-handleiding: Leert je zelf de cellen te isoleren middels het maken van een coupe. Opdracht : Maak van deze les een korte samenvatting, evenals het practicum. Cellen van de rode ui Cellen van de tulp Cellen van schimmel en mos en alg. ======================= einde===================== Module: Cellen 35