Farmaceutische wetenschappen BSc

Farmaceutische wetenschappen BSc
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
I
De opleiding Farmaceutische Wetenschappen richt zich op de bestudering van medicijnen, op het doen van
wetenschappelijk onderzoek hiernaar en op de toepassing van de verworven kennis. Het is een combinatie van
Scheikunde, Biologie en Medische Vakken.
Binnen de bacheloropleiding doe je kennis op van alle gebieden binnen de Farmaceutische Wetenschappen:
Biomolecular Drug Analysis, Computational MEdicinal Chemistry and Toxicology, Drug Design and Synthesis,
Molecular Pharmacology en Molecular Toxicology.
Met de opleiding wordt beoogd zodanige kennis, vaardigheid en inzicht bij te brengen op het gebied van de
Farmaceutische Wetenschappen dat de afgestudeerde in aanmerking kan komen voor een masteropleiding in de
Farmaceutische Wetenschappen. Dit kan een onderzoeksrichting zijn, maar ook een opleiding op het gebied van
Communicatie en Educatie of een meer maatschappijgerichte opleiding.
Eveneens is het essentieel dat de afgestudeerde zich bekwaamd heeft in het verantwoord kiezen in
wetenschappelijke problematieken. Om deze doelstellingen te bereiken is in de eerste plaats een brede
basisopleiding nodig met daarin ook aandacht voor algemene academische vorming. Daarnaast is het noodzakelijk
dat de student gedurende enige tijd actief deelneemt aan het farmaceutisch onderzoek.
Meer opleidingsinformatie is te vinden op de de FEW-website.
Een complete beschrijving van deze opleiding is te vinden in de Onderwijs- en Examenregeling op de FEW-website.
Klik op de onderstaande links om informatie over de vakken te bekijken. Voor meer informatie voer de opleiding zelf
kun je terecht bij je studieadviseur.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
II
Inhoudsopgave
Honours programma
1
Eerste jaar bachelor FAR
1
FAR vervallen vakken per 1-9-2011
1
Verplichte vakken
1
Verplichte algemene onderdelen
2
Tweede jaar bachelor FAR
2
Verplichte keuze 1 uit 2
3
Verplichte vakken
3
Verplichte vakken Open House
3
Derde jaar bachelor FAR
3
Individuele vakken
4
Bachelor project
4
Keuze ruimte
6
Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy
6
Verdiepingsvakken Farmacochemie
7
Verdiepingsvakken Fysische chemie
7
Verdiepingsvakken Organische chemie
7
Verdiepingsvakken Theoretische chemie
8
Keuze vakken
8
Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant
8
Minor Ondernemerschap en Innovatie
8
Verplichte vakken
9
Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken
9
Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken
10
Vak: Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken
10
Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA
11
Vak: Bachelorproject Farmacochemie BMA
12
Vak: Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S
12
Vak: Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S
13
Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie
14
Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie
15
Vak: Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie
16
Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.
17
Vak: Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.
17
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.
17
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.
18
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.
18
Vak: Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.
18
Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken
19
Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken
19
Vak: Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken
20
Vak: Bachelorproject Ondernemerschap en innovatie
21
Vak: Bachelorproject Organometaal synthese
21
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
III
Vak: Bachelorproject Organometaal synthese
22
Vak: Bachelorproject Organometaal synthese
22
Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken
23
Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken
24
Vak: Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken
24
Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse
25
Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse
26
Vak: Bachelorproject Synthese en structuuranalyse
27
Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry
28
Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry
28
Vak: Bachelorproject Theoretical Chemistry
29
Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie
30
Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie
31
Vak: Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie
32
Vak: Basispracticum farmacochemie
33
Vak: Basiswiskunde
34
Vak: Bioanalyse eiwitten
35
Vak: Biochemie
36
Vak: Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.
37
Vak: Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1
37
Vak: Business Administration in the Service Industry
37
Vak: Calculus 1
38
Vak: Computational (Pharmaco)Chemistry
39
Vak: Computationele organische chemie
40
Vak: Current Topics in Medicinal Chemistry
41
Vak: Current Topics in Medicinal Chemistry
42
Vak: Farmaceutische toxicologie
42
Vak: Farmacochemie in context
43
Vak: Farmacokinetiek en ADME processen
43
Vak: From Molecule to Medicine
44
Vak: Fysica en medische fysica 1
45
Vak: Geschiedenis van de natuurwetenschappen
46
Vak: Heterologe expressie van biotransformatie enzymen
47
Vak: Identificatietechnieken
48
Vak: Inleiding bioinformatica 1
49
Vak: Inleiding computergebruik
50
Vak: Innovatieproject geneesmiddelen
50
Vak: Integrated Practical Course
52
Vak: Introduction Entrepreneurship
53
Vak: Kernspinresonantie (NMR)
54
Vak: Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie
54
Vak: Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken
55
Vak: Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology
56
Vak: Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology
57
Vak: Keuzevak Farmacochemie - Medicinal Chemistry, DDTF
58
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
IV
Vak: Keuzevak Fysische Chemie
58
Vak: Keuzevak Fysische Chemie
59
Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction
59
Vak: Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction
60
Vak: Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.
61
Vak: Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken
61
Vak: Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek
62
Vak: Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek
63
Vak: Keuzevak Theoretische Chemie
63
Vak: Keuzevak Theoretische Chemie
63
Vak: Levende chemie
64
Vak: Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen
65
Vak: Macromoleculen en katalyse
66
Vak: Mathematische methoden
66
Vak: Medische (patho)fysiologie 2
67
Vak: Medische fysiologie 1
68
Vak: Mentoraat / Tutoraat
69
Vak: Modern Developments in Pharmacochemistry
70
Vak: Moleculaire Modeling voor Farmacochemici
71
Vak: Natuurstoffen
72
Vak: Organische chemie 1
73
Vak: Organische chemie 2
74
Vak: Organische chemie 3
74
Vak: Organometaalchemie
75
Vak: Oriëntatie op de M-variant
76
Vak: Oriëntatie science educatie
77
Vak: Practicum Moderne synthetische methoden
78
Vak: Project Bio-analytische chemie
79
Vak: Statistiek
80
Vak: Studie en loopbaan
81
Vak: Synthese practicum
81
Vak: Thermodynamics for SBI and F
82
Vak: Van atoom tot (bio)molecuul
83
Vak: Van gen tot geneesmiddel
84
Vak: Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min
85
Vak: Voorlichting door studentendecanen en CSL
85
Vak: Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers
85
Vak: Why Chemical Reactions Happen
86
Vak: Wijsgerige vorming 2: Wetenschapsfilosofie
87
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
V
Honours programma
Eerste jaar bachelor FAR
Eerste jaar voor studenten gestart in 2011/2010
In het eerste jaar zijn alle vakken verplicht, er zijn geen keuzevakken.
Het programma in het eerste jaar vormt een basis; het geeft een eerste
overzicht van de Farmaceutische Wetenschappen en is bedoeld als een
verbreding van de kennis op diverse terreinen.
Het eerste jaar van de bachelor heeft een oriënterende en selecterende
functie. De student kan zich tijdens het eerste studiejaar oriënteren op
de gekozen opleiding, dat wil zeggen: voldoet de opleiding aan de
verwachting en is men er geschikt voor. Het programma van het eerste
jaar geeft een eerste overzicht van de opleiding en geeft een verbreding
van de kennis.
De selecterende functie komt vooral tot uiting in de studieresultaten.
De studieresultaten worden gevolgd door de studieadviseur. Als het nodig
is worden studenten opgeroepen voor een gesprek. Op grond van de cijfers
wordt aan het eind van het eerste jaar aan elke eerstejaars een (nietbindend) schriftelijk studieadvies gestuurd.
Opleidingsdelen:
- FAR vervallen vakken per 1-9-2011
- Verplichte vakken
- Verplichte algemene onderdelen
FAR vervallen vakken per 1-9-2011
Verplichte vakken
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Basispracticum
farmacochemie
Periode 1
3.0
X_430561
Basiswiskunde
Periode 1
3.0
X_401069
Biochemie
Periode 4, Zomerperiode
3.0
X_430562
Calculus 1
Periode 2
3.0
X_400300
Farmacochemie in context
Periode 4
3.0
X_430566
Farmacokinetiek en ADME
processen
Periode 5
3.0
X_435084
From Molecule to Medicine
Periode 4
3.0
X_430581
Identificatietechnieken
Periode 5
6.0
X_435081
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 1 van 88
Innovatieproject
geneesmiddelen
Periode 3
6.0
X_435095
Levende chemie
Periode 2
3.0
X_430569
Medische fysiologie 1
Periode 1
3.0
X_430059
Organische chemie 1
Periode 5
3.0
X_435091
Project Bio-analytische
chemie
Periode 6
6.0
X_430577
Van atoom tot (bio)molecuul Periode 1+2
6.0
X_430580
Van gen tot geneesmiddel
Periode 2
3.0
X_435107
Why Chemical Reactions
Happen
Periode 4
3.0
X_435088
Verplichte algemene onderdelen
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Blusinstructie: Praktijk
S&F/N&S/SBI incl MNW.
Periode 1
0.0
X_000002
Blusinstructie: Theorie:
Periode 1
S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig
in Q1
0.0
X_000003
Inleiding computergebruik
Periode 1
0.0
X_000004
Mentoraat / Tutoraat
Semester 1
0.0
X_000008
Veiligheidsinstructie S, F,
MNW en SBI 30min
Periode 1
0.0
X_000019
Voorlichting door
studentendecanen en CSL
Periode 1
0.0
X_000007
Tweede jaar bachelor FAR
Tweede jaar voor studenten gestart in 2010/2011
In het tweede studiejaar wordt beoogd een verdieping van kennis, inzicht
en vaardigheden op deelgebieden van de farmaceutische Wetenschappen tot
stand te
brengen. Dit vormt de basis voor de differentiatie in het derde jaar.
In periode 4 is er een verplichte keuze tussen de vakken
Maatschappelijke aspecten van
natuurwetenschappen en Geschiedenis van de natuurwetenschappen.
Daarnaast volg je het verplichte onderdeel Studie en Loopbaan in periode
4. Tijdens deze cursus wordt er expliciet aandacht besteed aan jouw
competenties en vaardigheden, zodat jij je bewust wordt van jouw sterke
punten. Daarnaast krijg je meer inzicht in keuzemogelijkheden binnen de
opleiding en mogelijkheden na de bacheloropleiding.
Opleidingsdelen:
- Verplichte keuze 1 uit 2
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 2 van 88
- Verplichte vakken
- Verplichte vakken Open House
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Studie en loopbaan
Periode 4
0.0
X_000018
Verplichte keuze 1 uit 2
Verplichte keuze van 1 uit 2
Deze keuze vervalt per 1-9-2012 voor 2S.
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Geschiedenis van de
natuurwetenschappen
Periode 4
3.0
X_420148
Maatschappelijke aspecten
van de
natuurwetenschappen
Periode 4
3.0
X_420153
Naam
Periode
Credits
Code
Bioanalyse eiwitten
Periode 1
3.0
X_435099
Farmaceutische toxicologie Periode 1
3.0
X_430103
Fysica en medische fysica 1 Periode 4
3.0
X_430060
Integrated Practical Course Periode 5
12.0
X_430516
Mathematische methoden
Periode 4
6.0
X_401022
Medische (patho)fysiologie
2
Periode 2
6.0
X_436503
Moleculaire Modeling voor
Farmacochemici
Periode 6
6.0
X_435103
Organische chemie 2
Periode 1
3.0
X_435007
Statistiek
Periode 1+2
6.0
X_420223
Synthese practicum
Periode 2, Periode 3
6.0
X_435192
Thermodynamics for SBI
and F
Periode 2
3.0
X_430513
Verplichte vakken
Vakken:
Verplichte vakken Open House
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 3 van 88
Derde jaar bachelor FAR
Derde jaar voor studenten gestart in 2009/2010
Het derde jaar start met de minor van 30 EC. Je kunt je verdiepen in de
farmaceutische wetenschappen (Advanced Molecular Pharmaceutical
Sciences), maar ook juist een verbredende minor kiezen zoals Molecular
Chemistry of Ondernemerschap & Innovatie. Daarnaast is er in het tweede
semester 18 EC keuzeruimte. Wanneer je een verbredende minor hebt
gedaan, moet je deze keuzeruimte gebruiken om een eindproject binnen de
farmaceutische wetenschappen te doen. Wanneer je de verdiepende minor
hebt gedaan, kun je deze keuzeruimte invullen met
keuzevakken.Bijvoorbeeld de cursussen oriëntatie op de C-, E-, en Mvariant zijn in het tweede semester geprogrammeerd.
Opleidingsdelen:
-
Individuele vakken
Bachelor project
Keuze ruimte
Minor Ondernemerschap en Innovatie
Verplichte vakken
Individuele vakken
Bachelor project
Verplichte keuze van 1 project van minimaal 18 ects en max 24 ects in
het gebied van de Farmaceutische Wetenschappen (X_430524, X_430525, X_
430527, X_430528, X_430530, X_430531, X_430533, X_430534, X_430536 en X_
430537). Binnen een project van
24 ects is een combinatie van twee verschillende disciplines mogelijk.
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Bachelorproject Bioanalytische
screeningstechnieken
Ac. Jaar (september)
18.0
X_435117
Bachelorproject Bioanalytische
screeningstechnieken
Ac. Jaar (september)
24.0
X_435118
Bachelorproject Bioanalytische
screeningstechnieken
Ac. Jaar (september)
12.0
X_435460
Bachelorproject
Farmacochemie BMA
Ac. Jaar (september)
18.0
X_430524
Bachelorproject
Farmacochemie BMA
Ac. Jaar (september)
24.0
X_430525
Bachelorproject
Farmacochemie Medicinal
Chemistry, DD&S
Ac. Jaar (september)
18.0
X_430527
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 4 van 88
Bachelorproject
Farmacochemie Medicinal
Chemistry, DD&S
Ac. Jaar (september)
24.0
X_430528
Bachelorproject Imaging en Ac. Jaar (september)
Laser Control van FotoChemie
12.0
X_435052
Bachelorproject Imaging en Ac. Jaar (september)
Laser Control van FotoChemie
18.0
X_435114
Bachelorproject Imaging en Ac. Jaar (september)
Laser Control van FotoChemie
24.0
X_435116
Bachelorproject Med.
Ac. Jaar (september)
Chem., Drug Disc. & Target
Find.
18.0
X_430530
Bachelorproject Med.
Ac. Jaar (september)
Chem., Drug Disc. & Target
Find.
24.0
X_430531
Bachelorproject Mol. Tox.,
Comp. Med. Chem. & Tox.
Ac. Jaar (september)
18.0
X_430533
Bachelorproject Mol. Tox.,
Comp. Med. Chem. & Tox.
Ac. Jaar (september)
24.0
X_430534
Bachelorproject Mol. Tox.,
Drug, Disp. and Saf.
Assessm.
Ac. Jaar (september)
18.0
X_430536
Bachelorproject Mol. Tox.,
Drug, Disp. and Saf.
Assessm.
Ac. Jaar (september)
24.0
X_430537
Bachelorproject
Multidimensionale
scheidingstechnieken
Ac. Jaar (september)
18.0
X_435122
Bachelorproject
Multidimensionale
scheidingstechnieken
Ac. Jaar (september)
24.0
X_435123
Bachelorproject
Multidimensionale
scheidingstechnieken
Ac. Jaar (september)
12.0
X_435490
Bachelorproject
Organometaal synthese
Ac. Jaar (september)
12.0
X_435104
Bachelorproject
Organometaal synthese
Ac. Jaar (september)
18.0
X_435133
Bachelorproject
Organometaal synthese
Ac. Jaar (september)
24.0
X_435134
Bachelorproject
Spectroscopische detectieen identificatietechnieken
Ac. Jaar (september)
18.0
X_435119
Bachelorproject
Spectroscopische detectieen identificatietechnieken
Ac. Jaar (september)
24.0
X_435121
Bachelorproject
Spectroscopische detectieen identificatietechnieken
Ac. Jaar (september)
12.0
X_435470
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 5 van 88
Bachelorproject Synthese
en structuuranalyse
Ac. Jaar (september)
18.0
X_435128
Bachelorproject Synthese
en structuuranalyse
Ac. Jaar (september)
24.0
X_435129
Bachelorproject Synthese
en structuuranalyse
Ac. Jaar (september)
12.0
X_435550
Bachelorproject Theoretical Ac. Jaar (september)
Chemistry
12.0
X_430517
Bachelorproject Theoretical Ac. Jaar (september)
Chemistry
18.0
X_435126
Bachelorproject Theoretical Ac. Jaar (september)
Chemistry
24.0
X_435127
Bachelorproject Toegepaste Ac. Jaar (september)
theoretische chemie
18.0
X_435131
Bachelorproject Toegepaste Ac. Jaar (september)
theoretische chemie
24.0
X_435132
Bachelorproject Toegepaste Ac. Jaar (september)
theoretische chemie
12.0
X_435570
Keuze ruimte
De keuzeruimte van 24, 18 of 12 ec kan worden ingevuld met een keuze uit
onderstaande vakken.
Voor de invulling van de keuzeonderdelen is de goedkeuring van de
examencommissie vereist.
Opleidingsdelen:
-
Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy
Verdiepingsvakken Farmacochemie
Verdiepingsvakken Fysische chemie
Verdiepingsvakken Organische chemie
Verdiepingsvakken Theoretische chemie
Keuze vakken
Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant
Verdiepingsvakken Analytical chemistry and applied Spectroscopy
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Keuzevak BioAnalytische
massaspectrometrie
Ac. Jaar (september)
3.0
X_435026
Keuzevak BioAnalytische
screeningstechnieken
Ac. Jaar (september)
3.0
X_435028
Keuzevak Luminescence
Spectr. and Mol-Mol
interaction
Ac. Jaar (september)
3.0
X_435032
Keuzevak Luminescence
Spectr. and Mol-Mol
interaction
Ac. Jaar (september)
6.0
X_435033
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 6 van 88
Keuzevak Multidimensionale Ac. Jaar (september)
scheidingstechnieken
3.0
X_435037
Keuzevak Spectroscopische Ac. Jaar (september)
detectie- en
identificatietechniek
3.0
X_435039
Keuzevak Spectroscopische Ac. Jaar (september)
detectie- en
identificatietechniek
6.0
X_430568
Credits
Code
Current Topics in Medicinal Ac. Jaar (september)
Chemistry
3.0
X_430542
Current Topics in Medicinal Ac. Jaar (september)
Chemistry
6.0
X_430543
Heterologe expressie van
biotransformatie enzymen
Ac. Jaar (september)
6.0
X_430549
Keuzevak Computational
Medicinal Chemistry and
Toxicology
Ac. Jaar (september)
3.0
X_430546
Keuzevak Computational
Medicinal Chemistry and
Toxicology
Ac. Jaar (september)
6.0
X_430547
Keuzevak Farmacochemie - Ac. Jaar (september)
Medicinal Chemistry, DDTF
3.0
X_430544
Keuzevak Med. Chem.,
Drug Disc. & Target Find.
6.0
X_430545
Credits
Code
Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september)
3.0
X_430540
Keuzevak Fysische Chemie Ac. Jaar (september)
6.0
X_430541
Credits
Code
Verdiepingsvakken Farmacochemie
Vakken:
Naam
Periode
Ac. Jaar (september)
Verdiepingsvakken Fysische chemie
Vakken:
Naam
Periode
Verdiepingsvakken Organische chemie
Vakken:
Naam
Periode
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 7 van 88
Computationele organische Ac. Jaar (september)
chemie
9.0
X_435017
Macromoleculen en katalyse Ac. Jaar (september)
6.0
X_435450
Natuurstoffen
Ac. Jaar (september)
6.0
X_435440
Organische chemie 3
Periode 1
3.0
X_435109
Organometaalchemie
Ac. Jaar (september)
3.0
X_435018
Practicum Moderne
synthetische methoden
Ac. Jaar (september)
9.0
X_435016
Verdiepingsvakken Theoretische chemie
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Keuzevak Theoretische
Chemie
Ac. Jaar (september)
3.0
X_430538
Keuzevak Theoretische
Chemie
Ac. Jaar (september)
6.0
X_430539
Naam
Periode
Credits
Code
Inleiding bioinformatica 1
Periode 3
3.0
X_401036
Kernspinresonantie (NMR)
Periode 2
3.0
X_435012
Keuze vakken
Vakken:
Derde jaar bachelor FAR keuzevakken CEM Orientatie op de C/E/M-variant
Vakken:
Naam
Periode
Credits
Code
Oriëntatie op de M-variant
Periode 4
6.0
X_400375
Oriëntatie science educatie
Semester 2
6.0
O_ORIBETA
6.0
AB_470185
Credits
Code
Wetenschapscommunicatie Periode 5
voor Bèta-onderzoekers
Minor Ondernemerschap en Innovatie
Vakken:
Naam
Periode
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 8 van 88
Bachelorproject
Ondernemerschap en
innovatie
Ac. Jaar (september)
12.0
X_432740
Business Administration in
the Service Industry
Periode 1
6.0
E_BK1_BASI
Introduction
Entrepreneurship
Period 1
6.0
S_INTROE
Naam
Periode
Credits
Code
Computational
(Pharmaco)Chemistry
Periode 4
6.0
X_435350
Modern Developments in
Pharmacochemistry
Periode 6
3.0
X_430515
Wijsgerige vorming 2:
Wetenschapsfilosofie
Periode 4
3.0
X_428002
Verplichte vakken
Vakken:
Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken
Vakcode
X_435117 (435117)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald
thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een
onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische
systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd
kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds
belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen
analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van
geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats
inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en
massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van
methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Literatuur
Praktische handleidingen en basisliteratuur.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 9 van 88
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten
(vakcode 435118).
Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken
Vakcode
X_435118 (435118)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald
thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een
onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische
systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd
kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds
belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen
analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van
geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats
inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en
massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van
methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Literatuur
Praktische handleidingen en basisliteratuur.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten
(vakcode 435118).
Bachelorproject Bio-analytische screeningstechnieken
Vakcode
X_435460 (435460)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 10 van 88
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent een bepaald
thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van een
onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete bioanalytische
systemen waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd
kan worden. Bovendien wordt het in de industrie en de kliniek steeds
belangrijker om grote aantallen monsters in een korte tijd te kunnen
analyseren, vandaar dat de ontwikkeling en optimalisering van
geautomatiseerde multidimensionale systemen een belangrijke plaats
inneemt. Het gaat hierbij om toepassing van biospecifieke en
massaspectrometrische technieken. Centraal staan de ontwikkeling van
methoden voor peptiden, eiwitten en metabolieten in een complexe matrix.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Literatuur
Praktische handleidingen en basisliteratuur.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435460) kan in overleg met de coördinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435117) of 24 studiepunten
(vakcode 435118).
Bachelorproject Farmacochemie BMA
Vakcode
X_430524 (430524)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten
(vakcode 430525).
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 11 van 88
Bachelorproject Farmacochemie BMA
Vakcode
X_430525 (430525)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. M.H. Siderius
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430523) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430524) of 24 studiepunten
(vakcode 430525).
Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S
Vakcode
X_430527 (430527)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. M. Wijtmans
Doel vak
In dit vak zullen studenten kennis maken met de spannende aspecten van
onderzoek dat zich richt op het bedenken en maken van chemische stoffen
met een bepaalde biologische activiteit.
Inhoud vak
Als de ziekte bestudeerd is en de biologische targets bepaald zijn
moeten er stoffen gevonden worden die de biologische targets op de
juiste manier moduleren en daarmee de ziekte kunnen genezen. Dit
eindproject geeft de studenten de kans om zelfstandig onderzoek te
verrichten naar moderne technieken om tot de design en synthese van deze
nieuwe liganden te komen. Bij design gaat het om Computer-Aided Drug
Design (CADD) benaderingen, waarbij met de computer bestaande informatie
van liganden en biologische targets wordt verzameld en omgezet wordt in
modellen die leiden tot een beter begrip van ligand-receptor interactie.
Deze kunnen gebruikt worden om nieuwe liganden te zoeken of om ideeen
voor synthese te genereren. In de organische synthese laboratoria wordt
gebruik gemaakt van de modernste synthese technologieen, waaronder
parallele chemie, geautomatiseerde labreactors, microwave chemistry en
geautomatiseerde kolomchromatografie, om interessante moleculen te
synthetiseren. Afhankelijk van de interesse van de student kan een
project gedefinieerd worden dat alleen bestaat uit design, of alleen uit
synthese, of uit een combinatie van deze twee disciplines. Ook is een
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 12 van 88
nauwe samenwerking met Drug Discovery en Target Finding mogelijk, dit is
de onderzoeksgroep waar de biologische activiteiten van de nieuwe
verbindingen getest worden.
Onderwijsvorm
Dit eindproject bestaat uit een onderzoeksfase, waarbij de student een
eigen project krijgt dat past binnen een actief onderzoeksprogramma van
de afdeling. Over de stage wordt een verslag gemaakt en een presentatie
gehouden.
Literatuur
Wetenschappelijke literatuur en handouts worden door de begeleiders
aangeboden. De eerste 1 - 2 weken worden besteed aan het uitgebreid
inlezen in de achtergrond van het onderzoeksproject.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Neem tiidig contact op met de coördinator ([email protected]) voor het
bespreken van de mogelijkheden.
Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 18
studiepunten (vakcode 430527) kan in overleg met de coördinator worden
uitgebreid naar 24 studiepunten (vakcode 430528).
Afhankelijk van de interesse van de student kan een project gedefinieerd
worden dat alleen bestaat uit organische synthese, of alleen uit design,
of uit een combinatie van deze twee disciplines.
Bachelorproject Farmacochemie Medicinal Chemistry, DD&S
Vakcode
X_430528 (430528)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. M. Wijtmans
Doel vak
In dit vak zullen studenten kennis maken met de spannende aspecten van
onderzoek dat zich richt op het bedenken en maken van chemische stoffen
met een bepaalde biologische activiteit.
Inhoud vak
Als de ziekte bestudeerd is en de biologische targets bepaald zijn
moeten er stoffen gevonden worden die de biologische targets op de
juiste manier moduleren en daarmee de ziekte kunnen genezen. Dit
eindproject geeft de studenten de kans om zelfstandig onderzoek te
verrichten naar moderne technieken om tot de design en synthese van deze
nieuwe liganden te komen. Bij design gaat het om Computer-Aided Drug
Design (CADD) benaderingen, waarbij met de computer bestaande informatie
van liganden en biologische targets wordt verzameld en omgezet wordt in
modellen die leiden tot een beter begrip van ligand-receptor interactie.
Deze kunnen gebruikt worden om nieuwe liganden te zoeken of om ideeen
voor synthese te genereren. In de organische synthese laboratoria wordt
gebruik gemaakt van de modernste synthese technologieen, waaronder
parallele chemie, geautomatiseerde labreactors, microwave chemistry en
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 13 van 88
geautomatiseerde kolomchromatografie, om interessante moleculen te
synthetiseren. Afhankelijk van de interesse van de student kan een
project gedefinieerd worden dat alleen bestaat uit design, of alleen uit
synthese, of uit een combinatie van deze twee disciplines. Ook is een
nauwe samenwerking met Drug Discovery en Target Finding mogelijk, dit is
de onderzoeksgroep waar de biologische activiteiten van de nieuwe
verbindingen getest worden.
Onderwijsvorm
Dit eindproject bestaat uit een onderzoeksfase, waarbij de student een
eigen project krijgt dat past binnen een actief onderzoeksprogramma van
de afdeling. Over de stage wordt een verslag gemaakt en een presentatie
gehouden.
Toetsvorm
Verslag, Presentatie en praktische uitvoering
Literatuur
Wetenschappelijke literatuur en handouts worden door de begeleiders
aangeboden. De eerste 1 - 2 weken worden besteed aan het uitgebreid
inlezen in de achtergrond van het onderzoeksproject.
Vereiste voorkennis
Alle vakken van het eerste jaar afgerond.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Neem tiidig contact op met de coördinator ([email protected]) voor het
bespreken van de mogelijkheden.
Dit bachelorproject bestaat in twee varianten. De basisvariant van 18
studiepunten (vakcode 430527) kan in overleg met de coördinator worden
uitgebreid naar 24 studiepunten (vakcode 430528).
Afhankelijk van de interesse van de student kan een project gedefinieerd
worden dat alleen bestaat uit organische synthese, of alleen uit design,
of uit een combinatie van deze twee disciplines.
Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie
Vakcode
X_435052 (435052)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. M.H.M. Janssen
Doel vak
Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische
processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in
de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een
chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het
gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde
imaging detectoren.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 14 van 88
Inhoud vak
Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden
uitgevoerd:
- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp
van ultrasnelle femtoseconde lasers.
- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.
Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt
verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage
('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het
uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken
met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het
onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.
Literatuur
Praktische handleidingen, boeken en literatuur.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten
(vakcode 435116).
Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie
Vakcode
X_435114 (435114)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. M.H.M. Janssen
Doel vak
Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische
processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in
de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een
chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het
gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde
imaging detectoren.
Inhoud vak
Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden
uitgevoerd:
- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp
van ultrasnelle femtoseconde lasers.
- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.
Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt
verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage
('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het
uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken
met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het
onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 15 van 88
Literatuur
Praktische handleidingen, boeken en literatuur.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten
(vakcode 435116).
Bachelorproject Imaging en Laser Control van Foto-Chemie
Vakcode
X_435116 (435116)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. M.H.M. Janssen
Doel vak
Verkrijgen van inzicht in het verloop van elementaire chemische
processen, met name laser geinduceerde foto-chemische processen, en in
de krachten die een rol spelen bij het vormen en breken van een
chemische binding. Kennismaking met experimentele technieken op het
gebied van (ultrasnelle) lasers, moleculaire bundels en geavanceerde
imaging detectoren.
Inhoud vak
Er zijn twee onderzoeksthema's waarbinnen een eindproject kan worden
uitgevoerd:
- Tijdoplgeloste fotodynamica, coherent control en imaging met behulp
van ultrasnelle femtoseconde lasers.
- Fotodynamica van niet-adiabatische chemie.
Voor een globale omschrijving van deze twee onderzoeksthema's wordt
verwezen naar de beschrijving van de onderzoeksstage
('Laserspectroscopie') in de masterfase. Belangrijke aspecten bij het
uitvoeren van het eindproject zijn dat nadat het onderwerp is besproken
met de begeleider, de student zelf een onderzoeksplan opstelt, het
onderzoek uitvoert en hiervan verslag doet.
Literatuur
Praktische handleidingen, boeken en literatuur.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435052) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435114) of 24 studiepunten
(vakcode 435116).
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 16 van 88
Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.
Vakcode
X_430530 (430530)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. M.H. Siderius
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430529) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430530) of 24 studiepunten
(vakcode 430531).
Bachelorproject Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.
Vakcode
X_430531 (430531)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430529) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430530) of 24 studiepunten
(vakcode 430531).
Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.
Vakcode
X_430533 (430533)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. C. de Graaf
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 17 van 88
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430532) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430533) of 24 studiepunten
(vakcode 430534).
Bachelorproject Mol. Tox., Comp. Med. Chem. & Tox.
Vakcode
X_430534 (430534)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. C. de Graaf
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430532) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430533) of 24 studiepunten
(vakcode 430534).
Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.
Vakcode
X_430536 (430536)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten
(vakcode 430537).
Bachelorproject Mol. Tox., Drug, Disp. and Saf. Assessm.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 18 van 88
Vakcode
X_430537 (430537)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Inhoud vak
De inhoud van het bachelorproject wordt in overleg met de docent
bepaald. Dit geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken
studiemateriaal. Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430535) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 430536) of 24 studiepunten
(vakcode 430537).
Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken
Vakcode
X_435122 (435122)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een
bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van
een onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen,
waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan
worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde
multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type
onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of
vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende
detectiesystemen.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten
(vakcode 435123).
Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 19 van 88
Vakcode
X_435123 (435123)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een
bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van
een onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen,
waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan
worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde
multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type
onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of
vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende
detectiesystemen.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten
(vakcode 435123).
Bachelorproject Multidimensionale scheidingstechnieken
Vakcode
X_435490 (435490)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht over een
bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren van
een onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het primaire doel is het ontwikkelen van complete analytische systemen,
waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan
worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde
multi-dimensionale systemen neemt een centrale plaats in bij dit type
onderzoek. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische of
vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 20 van 88
detectiesystemen.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435490) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435122) of 24 studiepunten
(vakcode 435123).
Bachelorproject Ondernemerschap en innovatie
Vakcode
X_432740 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.C. Slootweg
Bachelorproject Organometaal synthese
Vakcode
X_435104 (435104)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.C. Slootweg
Doel vak
Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.
Inhoud vak
In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de
organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend
onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,
katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die
de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en
vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt
verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische
methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,
indien relvevant, X-ray structuren gemeten.
Onderwijsvorm
Practicumverslag
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie I & II, practicum organische synthese.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 21 van 88
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten
(vakcode 435134).
Bachelorproject Organometaal synthese
Vakcode
X_435133 (435133)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.C. Slootweg
Doel vak
Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.
Inhoud vak
In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de
organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend
onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,
katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die
de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en
vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt
verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische
methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,
indien relvevant, X-ray structuren gemeten.
Onderwijsvorm
Practicumverslag
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie I & II, practicum organische synthese.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten
(vakcode 435134).
Bachelorproject Organometaal synthese
Vakcode
X_435134 (435134)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 22 van 88
Coördinator
dr. J.C. Slootweg
Doel vak
Kennismaken met geavanceerde experimentele organometaalchemie.
Inhoud vak
In dit vak maak je kennis met synthetische technieken in de
organometaal chemie. In dit project dat nauw gelieerd is aan lopend
onderzoek werk je aan nieuwe organofosfor verbindingen en reagentia,
katalysatoren, en (macro)cyclische structuren. Je leert technieken die
de moderne chemicus tot zijn beschikking heeft om zuurstof en
vochtgevoelige verbindingen te synthetiseren, en je gebruikt
verschillende NMR methodes voor je analyses en chromatografische
methodes voor de scheiding van je verbindingen; van kristallen worden,
indien relvevant, X-ray structuren gemeten.
Onderwijsvorm
Practicumverslag
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie I & II, practicum organische synthese.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435104) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435133) of 24 studiepunten
(vakcode 435134).
Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken
Vakcode
X_435119 (435119)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Doel vak
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent
een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren
van een onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor
analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name
om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op
Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de
specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 23 van 88
Literatuur
Praktische handleidingen en basisliteratuur.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten
(vakcode 435121).
Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken
Vakcode
X_435121 (435121)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Doel vak
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent
een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren
van een onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor
analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name
om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op
Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de
specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Literatuur
Praktische handleidingen en basisliteratuur.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten
(vakcode 435121).
Bachelorproject Spectroscopische detectie- en identificatietechnieken
Vakcode
X_435470 (435470)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 24 van 88
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Doel vak
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent
een bepaald thema aan de hand van het zelfstandig opzetten en uitvoeren
van een onderzoeksproject.
Inhoud vak
Het ontwikkelen van nieuwe spectroscopische technieken die voor
analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met name
om laser detectiesystemen voor de chromatografie of electroforese en op
Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie systemen voor de
specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.
Onderwijsvorm
Zelfstandig opzetten en uitvoeren van een onderzoeksproject.
Literatuur
Praktische handleidingen en basisliteratuur.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435470) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435119) of 24 studiepunten
(vakcode 435121).
Bachelorproject Synthese en structuuranalyse
Vakcode
X_435128 (435128)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. ir. R.V.A. Orru
Doel vak
Zelfstandig onderzoek.
Inhoud vak
In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC
gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een
meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch
onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),
bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek
(kinetiek).
Onderwijsvorm
Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 25 van 88
Toetsvorm
Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge
verslaglegging (proeve van bekwaamheid).
Literatuur
Wordt per project aangegeven.
Aanbevolen voorkennis
435090: Organische chemie 1
435160: Organische chemie 2
435140: Anorganische chemie 1
435290: Anorganische chemie 2
435192: Practicum Synthese
Doelgroep
3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten
(vakcode 435129).
Bachelorproject Synthese en structuuranalyse
Vakcode
X_435129 (435129)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. ir. R.V.A. Orru
Doel vak
Zelfstandig onderzoek.
Inhoud vak
In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC
gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een
meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch
onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),
bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek
(kinetiek).
Onderwijsvorm
Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.
Toetsvorm
Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge
verslaglegging (proeve van bekwaamheid).
Literatuur
Wordt per project aangegeven.
Aanbevolen voorkennis
435090: Organische chemie 1
435160: Organische chemie 2
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 26 van 88
435140: Anorganische chemie 1
435290: Anorganische chemie 2
435192: Practicum Synthese
Doelgroep
3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten
(vakcode 435129).
Bachelorproject Synthese en structuuranalyse
Vakcode
X_435550 (435550)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. ir. R.V.A. Orru
Doel vak
Zelfstandig onderzoek.
Inhoud vak
In dit project zal op een geïntegreerde wijze binnen de sectie OAC
gewerkt gaan worden. Tijdens het praktisch werk aan een
meerstaps-synthese komt een aantal aspecten van organisch chemisch
onderzoek aan de orde: karakteriseren van verbindingen (spectroscopie),
bepalen van eigenschappen (rekenen) en mechanistisch onderzoek
(kinetiek).
Onderwijsvorm
Zelfstandig onderzoek binnen de sectie.
Toetsvorm
Het project wordt afgesloten met schriftelijke en mondelinge
verslaglegging (proeve van bekwaamheid).
Literatuur
Wordt per project aangegeven.
Aanbevolen voorkennis
435090: Organische chemie 1
435160: Organische chemie 2
435140: Anorganische chemie 1
435290: Anorganische chemie 2
435192: Practicum Synthese
Doelgroep
3S
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435550) kan in overleg met de coordinator worden
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 27 van 88
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435128) of 24 studiepunten
(vakcode 435129).
Bachelorproject Theoretical Chemistry
Vakcode
X_430517 (430517)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. L. Visscher
Doel vak
Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de
quantumtheoretische chemie.
Inhoud vak
Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in
moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer
weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder
gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe
deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software
(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent
ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod
kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio
moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van
f-elementen lanthanides, actinides).
Onderwijsvorm
De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan
de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de
nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen
onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een
onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de
promovendi en/of postdocs van de sectie.
Literatuur
Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford
University Press.
Selectie van recente review artikelen.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten
(vakcode 435127).
Bachelorproject Theoretical Chemistry
Vakcode
X_435126 (435126)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 28 van 88
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. L. Visscher
Doel vak
Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de
quantumtheoretische chemie.
Inhoud vak
Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in
moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer
weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder
gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe
deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software
(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent
ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod
kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio
moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van
f-elementen lanthanides, actinides).
Onderwijsvorm
De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan
de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de
nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen
onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een
onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de
promovendi en/of postdocs van de sectie.
Literatuur
Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford
University Press.
Selectie van recente review artikelen.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten
(vakcode 435127).
Bachelorproject Theoretical Chemistry
Vakcode
X_435127 (435127)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. L. Visscher
Doel vak
Het aanleren van de vaardigheden die gebruikt worden in de
quantumtheoretische chemie.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 29 van 88
Inhoud vak
Het doen van berekeningen om een beter inzicht te krijgen in
moleculaire structuur, reactiemechanismen of spectroscopie is niet meer
weg te denken uit de moderne chemie. In dit bachelorproject wordt onder
gekeken naar hoe de theorie achter deze methoden tot stand komt en hoe
deze theorie kan worden gebruikt in moderne quantumchemische software
(ADF, DIRAC). Daarnaast krijgt de toepassing en validatie van recent
ontwikkelde methoden veel aandacht. Actuele onderwerpen die aan bod
kunnen komen zijn subsysteem dichtheids-functionaaltheorie, ab initio
moleculaire dynamica, responstheorie, chemie en spectroscopie van
f-elementen lanthanides, actinides).
Onderwijsvorm
De student krijgt in de eerste weken een verdieping van de stof die aan
de orde is gekomen in de cursus Computational Chemistry. Hierbij zal de
nadruk liggen op technieken die relevant zijn voor het gekozen
onderzoeksproject. Daarna worden deze methoden toegepast in een
onderzoeksproject onder dagelijkse begeleiding van een van de
promovendi en/of postdocs van de sectie.
Literatuur
Atkins, P.W., Molecular Quantum Mechanics 3rd ed. Oxford: Oxford
University Press.
Selectie van recente review artikelen.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 430517) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435126) of 24 studiepunten
(vakcode 435127).
Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie
Vakcode
X_435131 (435131)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
18.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. F.M. Bickelhaupt
Doel vak
Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische
reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en
biologische chemie.
Inhoud vak
De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne
scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid
berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen
grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het
potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.
Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 30 van 88
sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door
"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om
nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de
achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook
als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.
Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de
berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus
is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een
chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde
Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)
model een centrale rol speelt.
Onderwijsvorm
De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de
eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student
deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.
Literatuur
Fragmenten uit:
Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions
in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.
Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional
Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational
Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:
Wiley-VCH, Vol. 15.
Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and
Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten
(vakcode 435132).
Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie
Vakcode
X_435132 (435132)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
24.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. F.M. Bickelhaupt
Doel vak
Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische
reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en
biologische chemie.
Inhoud vak
De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne
scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid
berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen
grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 31 van 88
potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.
Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in
sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door
"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om
nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de
achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook
als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.
Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de
berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus
is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een
chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde
Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)
model een centrale rol speelt.
Onderwijsvorm
De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de
eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student
deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.
Literatuur
Fragmenten uit:
Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions
in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.
Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional
Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational
Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:
Wiley-VCH, Vol. 15.
Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and
Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten
(vakcode 435132).
Bachelorproject Toegepaste theoretische chemie
Vakcode
X_435570 (435570)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. F.M. Bickelhaupt
Doel vak
Het begrijpen en voorspellen van moleculaire structuren en chemische
reactiviteit op het gebied van de organische, anorganische, fysische en
biologische chemie.
Inhoud vak
De theoretische chemie is niet meer weg te denken uit de moderne
scheikunde. Tal van eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 32 van 88
berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen
grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden. Toch is het
potentieel van de theoretische chemie hiermee nog lang niet uitgeput.
Om syntheses, katalysatoren of farmacologisch actieve moleculen in
sterkere mate langs rationele weg (en dus in mindere mate door
"uitproberen") te kunnen ontwerpen is het van cruciaal belang om
nauwkeurigheid te verbinden met gefundeerd en diepgaand inzicht in de
achterliggende mechanismen in de electronische structuur. Dit geldt ook
als het onderzoek in de vorm van computational chemistry geschiedt.
Inzicht kan hierbij verkregen worden d.m.v. nadere analyse van de
berekende golffunctie en bindingsenergie. Het doel van deze basiscursus
is het verwerven van de vaardigheden, die nodig zijn om de aard van een
chemisch fenomeen in detail te begrijpen, waarbij het in de zogenaamde
Kohn-Sham-dichtheidsfunctionaaltheorie besloten molecuul-orbitaal-(MO)
model een centrale rol speelt.
Onderwijsvorm
De cursus bestaat uit een intensieve theoretische inleiding in de
eerste week, gevolgd door een onderzoeksfase, waarbij de student
deelneemt aan een onderzoeksproject binnen de afdeling.
Literatuur
Fragmenten uit:
Albright, T.A., Burdett, J.K., and Whangbo, M.H., Orbital Interactions
in Chemistry, New York: Wiley-Interscience, 1985.
Bickelhaupt, F.M., and Baerends, E.J., Kohn-Sham Density Functional
Theory: Predicting and Understanding Chemistry. in Rev. Computational
Chemistry, Volume 15, Eds. Lipkowitz, K.B. and Boyd, D.B. New York:
Wiley-VCH, Vol. 15.
Cramer, C.J., Essentials of Computational Chemistry: Theories and
Models, Chichester: Wiley-VCH, 2002.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit bachelorproject bestaat in drie varianten. De basisvariant van 12
studiepunten (vakcode 435570) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 18 studiepunten (vakcode 435131) of 24 studiepunten
(vakcode 435132).
Basispracticum farmacochemie
Vakcode
X_430561 ()
Periode
Periode 1
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Docent(en)
dr. J.N.M. Commandeur
Lesmethode(n)
Practicum, Hoorcollege
Doel vak
Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren
van experimenten alsmede een eerste kennismaking met het onderzoek dat
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 33 van 88
wordt uitgevoerd bij de verschillende secties die betrokken zijn bij de
opleiding Farmaceutische Wetenschappen.
Inhoud vak
Het aanleren van basisvaardigheden die nodig zijn voor het uitvoeren
van experimenten alsmede de kennismaking met (experimentele)
technieken/methoden in de verschillende farmacochemische richtingen. Op
het practicum worden enkele experimenten/projecten uitgevoerd waarin
een aantal basisvaardigheden wordt geoefend. Deze vaardigheden worden
daarna gebruikt bij het uitvoeren van onderzoeksprojecten later in het
curriculum. Die vaardigheden betreffen o.a. het bestuderen van de
theorie/literatuuronderzoek, definiëren van een hypothese, opstellen
van een plan van aanpak, ontwerpen van een experiment, uitvoeren van
het experiment, bijhouden van een labjournaal, kritische beoordeling
van de resultaten, alsmede mondelingen en schriftelijke rapportage.
Onderwijsvorm
Het practicum wordt wordt uitgevoerd als projectmatig onderwijs,
waarbij de student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke
gegevens, de theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken
en het experiment zelf vormgeven.
Toetsvorm
Verslagen, Meetrapporten en Labjournaal
Literatuur
Tijdens het practicum zal voldoende literatuur aanwezig zijn om de
opdrachten te kunnen uitvoeren.
Doelgroep
1F
Overige informatie
Het met een voldoende afronden van het Basispracticum Farmacochemie is
alleen dan mogelijk, indien de brandblusinstructie en de
veiligheidsinstructie naar behoren zijn afgerond.
Basiswiskunde
Vakcode
X_401069 ()
Periode
Periode 1
Credits
3.0
Coördinator
drs. J.A. Los
Docent(en)
dr. ir. R.F. Swarttouw, drs. J.A. Los
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
Het doel van deze cursus is het ophalen en bijbrengen van wiskundige
basisvaardigheden die nodig zijn in vervolgcolleges zoals Calculus en
Statistiek.
Inhoud vak
De cursus begint met een herhaling van vwo stof. Sommige onderwerpen
zullen op wiskunde b niveau afgesloten worden. Ook komen een aantal
nieuwe onderwerpen aan bod (deels afhankelijk van je vwo-voorkennis):
integreren, goniometrie, limieten, complexe getallen en bewijzen met
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 34 van 88
volledige inductie.
Onderwijsvorm
Gemengd hoor- en werkcollege en huiswerkopgaven.
Toetsvorm
Een afsluitend schriftelijk tentamen en een tussentoets.
Literatuur
Basisboek wiskunde (tweede editie), Jan van de Craats en Rob Bosch,
Pearson, ISBN 978-90-430-1673-5. Aangevuld met een dictaat.
Doelgroep
1F, 1MNW, 1S, 1SBI
Bioanalyse eiwitten
Vakcode
X_435099 (435099)
Periode
Periode 1
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Docent(en)
dr. J. Kool, dr. H. Lingeman
Lesmethode(n)
Werkcollege
Doel vak
Het doel is het verwerven van theoretisch inzicht over de kwalitatieve
en kwantitatieve analyse van biologische macromoleculen (vooral
eiwitten) met behulp van ondermeer chromatografische, immunologische en
affiniteitstechnieken.
Inhoud vak
Allereerst zullen de verschillende (vloeistof)chromatografische
technieken (b.v. size-exclusion, ion-exchange, hydrophobic interaction,
reversed-phase) worden besproken waarmee de genoemde verbindingen van
elkaar kunnen worden gescheiden. Bijzondere aandacht zal hierbij worden
gegeven aan gradientelutie systemen en biospecifieke en
massaspectrometrische detectiesystemen. Verder zal het basisprincipe van
de immunoassays en affiniteitstechnieken worden geïntroduceerd. Hierbij
zal vooral worden gekeken naar de toepasbaarheid van deze technieken.
Onderwijsvorm
Het college begint met een theoretische inleiding gevolgd door enkele
werkcolleges. Vervolgens zullen de studenten in kleine groepjes aan een
casus werken. Over de casus wordt een verslag geschreven.
Toetsvorm
De beoordeling zal plaatsvinden aan de hand van een schriftelijk
tentamen en het verslag. Beiden tellen even zwaar mee voor de
eindbeoordeling.
Literatuur
Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Uitgebreide informatie
over de behandelde stof kan worden gevonden in K.M. Gooding, F.E.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 35 van 88
Regnier, HPLC of Biological Macromolecules, Chromatographic Science
Series, Volume 51, Dekker 1990 en D.S. Hage, Handbook of Affinity
Chromatography, Chromatographic Science Series, Volume 92, Dekker 2006.
Doelgroep
2F, mi-MPS
Biochemie
Vakcode
X_430562 ()
Periode
Periode 4, Zomerperiode
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
J.C. Vos
Docent(en)
dr. M.H. Siderius, J.C. Vos
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de
bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van
deze cellen en de manier waarop cellen energie winnen uit de afbraak
van voedingsstoffen en deze energie gebruiken voor groei en deling, als
ook basisprincipes van de moleculaire biologie van de levende cel, de
manier waarop genetische informatie in cellen wordt opgeslagen en de
verwerking van deze informatie tot de eiwitten van de cel. Ook de
belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.
Inhoud vak
Aandacht voor de genetische informatiestroom DNA -> RNA -> eiwit en de
manier waarop deze informatiestroom wordt gereguleerd. Tenslotte komen
de belangrijkste onderdelen van de recombinant DNA technologie aan de
orde (genetische modificatie, DNA volgorde analyse, PCR, etc.).
Vervolgens wordt bekeken op welke manier een cel zijn energie verkrijgt
uit voedsel. De afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen
(koolhydraten en vetten) worden besproken, gevolgd door de structuur en
functie van biologische membranen die een centrale rol spelen in de
omzetting van de zo gewonnen energie in een voor de cel bruikbare vorm
(ATP). Ook de fotosynthese komt aan bod.
Onderwijsvorm
Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden
vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen
toetsen.
Toetsvorm
Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het
eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,
bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit
alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de
hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,
genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en
energiehuishouding aan de orde komen.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 36 van 88
Literatuur
Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Voornamelijk de
hoofdstukken 7-9, 10-14, zoals aangegeven in de studiehandleiding bij
dit college.
Aanbevolen voorkennis
Levende Chemie
Doelgroep
1F, 1MNW, mBio
Blusinstructie: Praktijk S&F/N&S/SBI incl MNW.
Vakcode
X_000002 ()
Periode
Periode 1
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Lesmethode(n)
Practicum
Blusinstructie: Theorie: S&F/N&S/W/I/SBI gelijktijdig in Q1
Vakcode
X_000003 ()
Periode
Periode 1
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Business Administration in the Service Industry
Vakcode
E_BK1_BASI (61111030)
Periode
Periode 1
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Economische Wet. en Bedrijfsk.
Coördinator
dr. M.J. Flikkema
Docent(en)
dr. M.J. Flikkema, drs. G.H. Teusink, drs. F.E. Driessen,
drs. H.E.M. Binnendijk
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
Verkrijgen van inzicht in:
- het Bedrijfskundig model dat gedurende de bachelorfase wordt gebruikt
- de relatie tussen soorten bedrijven, stakeholders, bedrijfsprocessen
en bedrijfsfuncties
- de wijze waarop veranderingen in bedrijfsprocessen en
bedrijfsfuncties de relaties tussen dienstverleners en hun
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 37 van 88
stakeholders, in het bijzonder klanten, beïnvloeden
- de bijdragen die vanuit de verschillende bedrijfsfuncties worden
geleverd aan het veranderen van de strategische positie van een
dienstverlener
Inhoud vak
BASI is het introductievak Bedrijfskunde met bijzondere aandacht voor
dienstverlenende bedrijven. De introductie begint met spelregels en een
toelichting van het Bedrijfskundig model, aan de hand waarvan duidelijk
wordt hoe het bachelorprogramma van de studie Bedrijfskunde aan de VU
is opgebouwd en wat er van studenten wordt verwacht. Daarna wordt in
zeven hoorcolleges een overzicht gegeven van soorten bedrijven, soorten
stakeholders (bijvoorbeeld klanten en aandeelhouders) en hun onderlinge
relatie. De variatie tussen bedrijven blijkt groot, in het bijzonder
als we stilstaan bij de verschillende posities die bedrijven kunnen
innemen in de markt, in netwerken en in waardeketens. De grote
diversiteit aan stakeholders maakt duidelijk dat bij bedrijfskundige
vraagstukken vaak verschillende belangen tegen elkaar moeten worden
afgewogen.
Bedrijfsprocessen vormen belangrijke instrumenten voor het vormgeven en
veranderen van de relatie met stakeholders. Denk maar eens aan de
impact van thuisbankieren. Maar wat is nou precies een bedrijfsproces
en hoe kun je dat beschrijven, modeleren, analyseren en verbeteren?
Studenten zullen het niet alleen tijdens het hoorcollege, maar ook via
een spel, een VISIO workshop en een praktijkcase ervaren. Dan zal ook
duidelijk worden hoe bedrijfsprocessen, bedrijfsfuncties (zoals
marketing, logistiek, ICT, HRM, inkoop, verkoop en finance) en
afdelingen zich tot elkaar verhouden en hoe vanuit de verschillende
bedrijfsfuncties bijdragen worden geleverd aan het veranderen van
bedrijfsprocessen en de positie van de organisatie als geheel.
Onderwijsvorm
hoorcollege
werkcollege
Toetsvorm
schriftelijk tentamen (100 procent)
Literatuur
- Looy, B. van, R. van Dierdonck & P. Gemmel, Services Management: An
Integrated Approach. 2nd edition. London: Prentice Hall, 2003, ISBN
027367353 X.
Calculus 1
Vakcode
X_400300 ()
Periode
Periode 2
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Coördinator
drs. J.A. Los
Docent(en)
dr. C.M. Quant, drs. J.A. Los
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 38 van 88
Doel vak
Kunnen toepassen van basale calculustechnieken in vraagstukken. Vertalen
van een eenvoudige praktijkbeschrijving naar een calculusopgave.
Zelfstandig bestuderen van wiskundetekst in de Engelse taal.
Inhoud vak
Functies van één reële veranderlijke: limiet, continuteit, afgeleide
met toepassingen, l'Hospital, primitieve, substitutie en partiële
integratie, eenvoudige differentiaalvergelijkingen.
Onderwijsvorm
Hoorcollege met werkcollege en wekelijkse digitale opgaven.
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen en wekelijkse digitale opgaven. De precieze
regeling wordt via blackboard bekend gemaakt.
Literatuur
Adams, Robert A, Calculus: a complete course, 7th Edition, Pearson,
2010. Let er bij de eventuele aanschaf van een tweedehands exemplaar op
dat de kaart die toegang geeft tot de MathXL omgeving bij het boek
aanwezig is!
Aanbevolen voorkennis
Basiswiskunde
Doelgroep
1F, 1MNW, 1-SBI
Computational (Pharmaco)Chemistry
Vakcode
X_435350 (435350)
Periode
Periode 4
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. F.M. Bickelhaupt
Docent(en)
prof. dr. F.M. Bickelhaupt, dr. C. Fonseca Guerra, dr. D.P.
Geerke
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak
Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het
toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van chemische
problemen.
Inhoud vak
Computational chemistry is niet meer weg te denken uit de moderne
scheikunde. Tal van moleculaire eigenschappen kunnen met chemische
nauwkeurigheid berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet
te achterhalen grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden.
De experimentator kan hierdoor veel gerichter te werk gaan en het
beoogde doel sneller, met minder kosten en een lager verbruik aan
grondstoffen en energie bereiken.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 39 van 88
Eén van de hoofddoelen van de cursus is het leren van en werken met
state-of-the-art quantumchemische en moleculair mechanische methoden en
computersoftware. Hierbij komen naast de traditionele ab
initio-methoden (bijv. Hartree-Fock en post-Hartree-Fock-theorie) o.a.
dichtheidsfunctionaaltheorie (DFT), semieëmpirische en krachtveld
methoden aan de orde. Deze worden onder meer toegepast op het
voorspellen van structuren, het verkennen van potentiaaloppervlakken
(bijv. t.b.v. het verkrijgen van reactieprofielen), en moleculaire
dynamica (bijv. t.b.v. het onderzoeken van eiwitdynamica en
eiwitvouwing).
Een tweede hoofddoel is het verkrijgen van de vaardigheid
(experimenteel) chemische problemen te vertalen naar een computationele
aanpak, die tot een praktische oplossing leidt. Er zal voorts een begin
worden gemaakt met het interpreteren van berekende resultaten in termen
van modellen van de elektronische structuur. Een wezenlijk punt in deze
cursus is het unificerende karakter van computational chemistry:
dezelfde theoretische methoden dienen als gereedschap voor het oplossen
van diverse vraagstukken uit alle gebieden van de scheikunde, van
theoretische en organische chemie tot farmaco- en biochemie.
Onderwijsvorm
De cursus bestaat uit een hoorcollege en een practicum, waarin een kort
researchproject is opgenomen.
Toetsvorm
Tentamen en practicum (verslagen en presentatie). Zowel voor het
tentamen als voor het practicum moet een voldoende behaald worden.
Literatuur
Cramer, C.J. Essentials of Computational Chemistry: Theories and
Models. Chichester: Wiley-VCH, 2002.
Aanbevolen voorkennis
Moleculaire Modelling (voor 3F), Moleculaire Quantummechanica (voor 3S)
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
In verband met het verschil in voorkennis van de studenten S en F is er
voor een aantal colleges onderscheid gemaakt in verplichte en
vrijwillige college-uren.
De twee college-uren "Symmetrie en Hückel-theorie" zijn verplicht voor
3F studenten en vrijwillig voor 3S studenten.
De twee college-uren "Modeling" zijn verplicht voor 3S studenten en
vrijwillig voor 3F studenten.
Computationele organische chemie
Vakcode
X_435017 (435017)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
9.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. A.W. Ehlers
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 40 van 88
Doel vak
Kennismaken met moderne "computational chemistry" methoden om de
structuur, eigenschappen en de reactiviteit van organische moleculen te
onderzoeken.
Inhoud vak
In de eerste week van deze cursus word je vertrouwd gemaakt met de
methodes en de quantumchemische rekenprogramma's. Daarna ga je een
deelprobleem uit lopend onderzoek zelfstandig bestuderen onder
begeleiding van een promovendus en/of docent.
De nadruk ligt hierbij op de voorspellende waarde van theoretische
methoden t.o.v. experimenteel toegankelijke grootheden bij het
identificeren van organische verbindingen. Het berekenen van de te
verwachten NMR, IR of UV/vis spektra is hierbij van groot belang. Maar
ook de bepaling van de absolute configuratie van optisch actieve
stoffen met behulp van berekende VCD spectra behoort tot de mogelijke
opdrachten.
Onderwijsvorm
Practicumproject.
Literatuur
Foresman, J.B., and Frisch, A., Exploring Chemistry with Electronic
Structure Methods 2nd ed. Gaussian Inc. of in overleg met de docent.
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie I & II, Computational Chemistry.
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Current Topics in Medicinal Chemistry
Vakcode
X_430542 (430542)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. I.J.P. de Esch
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430542) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430543).
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 41 van 88
Current Topics in Medicinal Chemistry
Vakcode
X_430543 (430543)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. I.J.P. de Esch
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430542) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430543).
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Farmaceutische toxicologie
Vakcode
X_430103 (430103)
Periode
Periode 1
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Docent(en)
dr. J.N.M. Commandeur
Lesmethode(n)
Werkcollege
Doel vak
Het verkrijgen van inzicht in de wijze waarop de risicoschatting van
nieuwe (kandidaat)geneesmiddelen plaatsvindt op basis van pre-klinische
en klinische studies.
Inhoud vak
In dit vak zullen de basisprincipes worden behandeld van de
(moleculaire) mechanismen waarlangs (kandidaat)geneesmiddelen
schadelijk bijwerkingen kunnen veroorzaken in het lichaam.
Onderwerpen die aan bod zullen komen, zijn: dosis-toxiciteit relaties
en risicoschatting; orgaan-selectieve toxiciteit; genotoxiciteit;
carcinogeniteit; mechanismen van celdood (apoptose, necrose); in vivo
en in vitro methoden om verschillende vormen van (geno)toxiciteit te
kunnen vaststellen.
De wijze waarop informatie, verkregen met proefdierstudies en
mechanistische studies, kan worden gebruikt ter verbetering van de
risicoschatting.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 42 van 88
Onderwijsvorm
Hoorcolleges.
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen
Literatuur
Mulder, G.J., and Dencker, L., Pharmaceutical Toxicology: Safety
Sciences of Drugs, Pharmaceutical Press, 2007 (ISBN: 10-0-85369 593 8).
Aanbevolen voorkennis
Biochemie
Levende Chemie
Van Molecuul tot Medicijn
Doelgroep
2F, 3S, mi-MPS
Farmacochemie in context
Vakcode
X_430566 ()
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
D.M. Vredenburg-Maasdijk MSc
Docent(en)
dr. E. Ruijter, D.M. Vredenburg-Maasdijk MSc
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Onderwijsvorm
Hoor- en werkcolleges, groepsopdrachten en individuele opdrachten
Toetsvorm
opdrachten en verslagen
Literatuur
Artikelen
Doelgroep
1F
Overige informatie
Tutoraat FAR 1A is onderdeel van dit vak.
Student 1F moet de onderdelen van het vak Tutoraat FAR 1A hebben
afgerond voordat het cijfer van Farmacochemie in context mag worden
ingevoerd.
Farmacokinetiek en ADME processen
Vakcode
X_435084 (435084)
Periode
Periode 5
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 43 van 88
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Docent(en)
dr. J.N.M. Commandeur
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Het verkrijgen van kennis en inzicht in de onderliggende processen die
de lotgevallen van een geneesmiddel in het lichaam bepalen en de
mathematische beschrijving hiervan met behulp van compartimentmodellen.
Inhoud vak
Het toedienen van de juiste dosis van een geneesmiddel in de juiste
frequentie is zeer belangrijk om ervoor te zorgen dat het geneesmiddel
wel zijn gewenste werking uitoefent maar geen schadelijke bijwerkingen
vertoont. Met behulp van de farmacokinetiek wordt getracht het
tijdsverloop van de concentratie(s) van het geneesmiddel in het lichaam
mathematisch te beschrijven als functie van de dosis. Onderliggende
processen die de farmacokinetiek van een geneesmiddel bepalen zijn
absorptie, distributie, metabolisme en eliminatie, tesamen meestal
aangegeven met het acronym ADME. Daarnaast zijn toedieningsroute en
toedieningsvorm (formulering) zeer bepalend voor het farmacokinetisch
gedrag van een geneesmiddel.
In dit college zal worden behandeld hoe met behulp van
compartimentmodellen de farmacokinetiek van een geneesmiddel kan worden
beschreven voor verschillende toedieningsroutes (intraveneus, oraal en
infuus). Daarnaast zal aandacht worden besteedt aan de relatie tussen
de moleculaire eigenschappen van een geneesmiddel en de processen die
de farmacokinetiek van een geneesmiddel bepalen.
Onderwijsvorm
Hoorcolleges, werkcolleges.
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen
Literatuur
Shargel, L. e.a., Applied Biopharmaceutics and Pharmacokinetics 5th ed,
McGraw-Hill, 2005 (ISBN: 0-07-137550-3).
Aanbevolen voorkennis
Levende Chemie
Innovatieproject Geneesmiddelen
Calculus 1
Doelgroep
1F
From Molecule to Medicine
Vakcode
X_430581 ()
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 44 van 88
Coördinator
dr. I.J.P. de Esch
Docent(en)
dr. I.J.P. de Esch, drs. P. van Hoorn
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Dit vak geeft inzicht in de manieren waarop biologisch actieve moleculen
gevonden worden en hoe ze ontwikkeld worden tot medicijnen.
Inhoud vak
Er wordt aandacht besteed aan strategieën om de activiteit van
biologische targets (receptor, enzym of transporteiwit) te beïnvloeden
met geneesmiddelmoleculen. Daarbij zullen moleculaire herkenning, het
screenen van grote stoffenbibliotheken en rationele ontwerpmethodiek,
alsmede de relatie tussen de chemische structuur en de biologische
activiteit (SAR) aan de orde komen. Ook wordt aandacht besteed aan
diagnostiek en therapie, bijvoorbeeld door moleculen te binden aan een
specifiek biologisch target waardoor de werking van het biomolecuul
bestudeerd kan worden. Verschillende imaging technieken die gebruikt
worden om targets zichtbaar te maken, zullen worden besproken aan de
hand van cases uit de praktijk. Er zal een bezoek gebracht worden aan de
betrokken centra van het VU Medisch Centrum. Bij de kostbare
ontwikkeling van deze medicijnen en diagnostica is het essentieel om het
intellectueel eigendom (IP) te beschermen teneinde de enorme research
investeringen te kunnen terugverdienen. We zullen dan ook nadrukkelijk
aandacht besteden aan de rol en aanpak van patenten. Tot slot moeten de
medicijnen voor klinische testen en marktintroductie op grote schaal
worden gesynthetiseerd met behulp van proceschemie. De hiermee gepaard
gaande uitdagingen, bekende hordes in de race van molecuul tot medicijn,
zullen worden behandeld.
Onderwijsvorm
Hoorcolleges, werkcollege (gebruik CD Roms, opdrachten), bezoek aan
centra op de VU voor Diagnostiek & Therapie en zelfstudie.
Toetsvorm
Web-tussentoetsen
Schriftelijk tentamen
Literatuur
Patrick, G., An Introduction to Medicinal Chemistry 4th ed.
Oxford: Oxford University Press. 2009, ISBN: 0199234477
Handouts
Aanbevolen voorkennis
Van Atoom tot Biomolecuul
Van Gen tot Geneesmiddel
Innovatieproject Geneesmiddelen
Doelgroep
1F, 2-SBI
Fysica en medische fysica 1
Vakcode
X_430060 ()
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 45 van 88
Voertaal
Engels
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. R. Croce
Docent(en)
dr. R.N. Frese, prof. dr. R. Croce
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
Doelstelling van het college Fysica en medische fysica I is de
basisbegrippen van de natuurkunde te introduceren die ten grondslag
liggen aan de mechanische verschijnselen in de levende natuur.
Inhoud vak
Fysica is de wetenschap die de eigenschappen van de materie beschrijft
in termen van natuurwetten. De fysica speelt bij het begrijpen van de
eigenschappen van de levende materie en het menselijk lichaam een
essentiële rol. In dit college zullen eerst de wetten van Newton
behandeld worden waarmee de bewegingen van voorwerpen onder invloed van
krachten beschreven kunnen worden. Het gedrag van vloeistoffen en de
stabiliteit van vaste structuren en mechanische trillingen komen
vervolgens aan de orde. In een aantal voorbeelden worden diverse
toepassingen besproken.
Onderwijsvorm
Voorstudie, hoorcollege met demonstraties en discussie, werkcollege en
zelfstudie.
Toetsvorm
Schriftelijke tentamen. Het resultaat van het werkcollege moet voldoende
zijn.
Literatuur
Giancoli, D.C., Physics for Scientists and Engineers with Modern
Physics 4th ed. New Jersey: Prentice Hall.
Aanbevolen voorkennis
Het college sluit aan op Practicum Natuurkunde. Het college bereidt
voor op:
- Fysica en medische fysica II
- Natuurkunde en gezondheid, Structuur van de materie (MNW)
- Thermodynamica, Kernenergie en Duurzame energie (SBI)
Doelgroep
1MNW, 1SBI, 2F, 1IDS
Geschiedenis van de natuurwetenschappen
Vakcode
X_420148 (420148)
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. F.H. van Lunteren
Docent(en)
prof. dr. F.H. van Lunteren
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 46 van 88
Inhoud vak
Dit college behandelt aard en achtergronden van een aantal dramatische
omslagpunten in het onderzoek van de natuur in een periode lopend van de
klassieke Oudheid tot aan de 20ste eeuw. Behandeld worden onder meer de
klassieke tradities, de Arabische wetenschap, de copernicaanse
revolutie, de mechanisering van het wereldbeeld, de opkomst van het
experiment, Newton, Linnaeus, de achttiende-eeuwse chemische revolutie,
Darwin, Einstein en de twintigste-eeuwse revoluties in de fysica.
Onderwijsvorm
Hoorcollege; digitale leeromgeving
Toetsvorm
Tentamen.
Literatuur
Syllabus; collegestof op Blackboard
Doelgroep
2F, 2MNW, 2N, 2S
Overige informatie
Alle studenten N, S, F en MNW moeten kiezen tussen Geschiedenis van de
natuurwetenschappen of Maatschappelijke aspecten van wetenschap.
Inlichtingen bij de docent, afdeling Algemene Vorming, De Boelelaan
1081, kamer T-036b, email: [email protected], tel. (020) 598 7979.
Zie ook de website van de afdeling Algemene Vorming
http://www.few.vu.nl/nl/onderzoek/algemene-vorming/index.asp
Heterologe expressie van biotransformatie enzymen
Vakcode
X_430549 (430549)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Doel vak
Dit vak heeft tot doel de student zich te laten verdiepen in de
strategieën en experimentele benaderingen die worden gebruikt om
specifieke biotransformatie-enzymen (zoals P450s, glutathione
transferases, etc.) tot expressie te brengen in cellulaire organismen.
Inhoud vak
Biotransformatie, ook wel metabolisme genoemd, speelt een zeer
belangrijke rol in de verwerking van geneesmiddelen door het lichaam.
Aan de ene kant is biotransformatie vaak bepalend voor de
halfwaardetijd waarmee een geneesmiddel wordt geëlimineerd vanuit het
plasma. Aan de andere kant kunnen bij metabolisme reactieve
metabolieten ontstaan die met cellulair materiaal reageren, zoals
eiwitten, DNA of membranen. Het menselijke genoom codeert voor enkele
honderden enzymen die in meer of mindere mate bij het metabolisme van
geneesmiddelen betrokken kunnen zijn. Om de rol van de enzymen beter
te kunnen bestuderen, zijn voor de belangrijkste
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 47 van 88
biotransformatie-enzymen expressiesystemen ontwikkeld in verschillende
organismes, zoals Escherichia coli, gist, insectcellen, Salmonella
typhimurium, zoogdiercellen, etc. De keuze van het organisme hangt af
van het doel wat wordt beoogd, bijv. grote schaal expressie (mg-gram)
voor biocatalyse of kristallisatie, lage schaal expressie voor in vitro
(geno)toxiciteit experimenten.
Onderwijsvorm
Aan de hand van een lijst van opdrachten zal een literatuurstudie
worden uitgevoerd naar eigenschappen, expressie en mutagenese van een
specifiek biotransformatie-enzym. Op verschillende momenten zal de
voortgang worden besproken met de docenten.
Toetsvorm
Van de literatuurstudie wordt een rapport gemaakt, dat in een
nabespreking mondeling dient te worden toegelicht.
Aanbevolen voorkennis
Dit vak borduurt voort op theorie die is behandeld in de cursus
Biochemie (1e jaar) en de expressie-experimenten die zijn uitgevoerd in
het Geintegreerde practicum (2e jaar). Ter ondersteuning van de
literatuurstudie wordt aanbevolen het volgende boek aan te schaffen of
te lenen: Primrose and Twyman, Principles of Gene Manipulation and
Genomics 8th ed. Dit boek wordt later ook gebruikt voor het vak
'Chemistry of life' in de master Drug Discovery and Safety.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de
docent.Studenten die dit vak wensen te doen, dienen zich twee weken van
tevoren aan te melden bij dr. J.N.M. Commandeur
([email protected]). Het vak kan in voorkomende gevallen dienen
als voorbereiding op een bachelorproject.
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430548) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430549).
Identificatietechnieken
Vakcode
X_435081 (435081)
Periode
Periode 5
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Docent(en)
dr. F.J.J. de Kanter, dr. F. Ariese, dr. H. Lingeman
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak
Het doel van deze cursus is om inzicht en praktische vaardigheden te
verwerven op het gebied van moleculaire spectroscopische technieken en
hun toepassingen voor de identificatie van verbindingen.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 48 van 88
Inhoud vak
Achtergronden van de verschillende spectroscopische technieken worden
behandeld, waarbij steeds verbanden worden gelegd met de structuur van
moleculen. De volgende technieken zullen aan bod komen: UV-Vis
absorptiespectroscopie, vibratiespectroscopie (infrarood en Raman),
fluorescentiespectroscopie, kernspin resonantie (NMR) en
massaspectrometrie. (Bio)analytische toepassingen van deze technieken
zullen aan bod komen. Spectroscopische berekeningen en interpretatie
van spectra zullen worden geoefend.
Onderwijsvorm
Hoorcollege, werkcollege en practicum.
Toetsvorm
¼ practicumverslagen + ¾ tentamen. Tussentoets voor bonuspunten.
Literatuur
Harris, D.C., Quantitative Chemical Analysis.
Collegedictaat.
Doelgroep
1F
Inleiding bioinformatica 1
Vakcode
X_401036 (401036)
Periode
Periode 3
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. J. Heringa
Docent(en)
prof. dr. J. Heringa
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak
We kunnen nu de DNA sequentie van ieder menselijk genoom aflezen, maar
begrijpen we eigenlijk wel hoe deze genen werken en samen een levend
organisme vormen? Bioinformatica richt zich op de vraag wat de
biologisch betekenis en functie van DNA (en eiwit) sequenties is, en
lost dit op met behulp van computationele technieken.
Het vak Inleiding Bioinformatica (I en II) geeft een overzicht van de
bioinformatica en de belangrijkste technieken op dit vakgebied. In
Inleiding Bioinformatica I worden de belangrijkste aspecten en methoden
op het gebied van genomics en sequentie analyse behandeld. Aan het eind
van deze cursus kunnen studenten de biologische en computationele
achtergrond van de technieken begrijpen en zelfstandig een genoom- en
sequentieanalyse uit te voeren.
Inhoud vak
De volgende onderwerpen komen aan bod:
Theorie:
- Genomics en sequentie databases (genoom, sequentie, afgeleide
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 49 van 88
databases, etc.)
- Genome sequencing technieken
- Gen voorspellingsalgoritmen
- Sequentie analyse (pairwise en multiple sequence alignment, dynamic
programming, sequence database searching)
- Clustering, fylogenie en fylogenetische methoden
- Comparative genomics
Praktijk opdrachten:
- Bioinformatica databases - hoe vind je een eiwit of een gen?
- Multiple Sequence Alignment - hoe vergelijk je meerdere eiwit
sequenties?
- BLAST - zoek naar homologe sequenties van eiwitten of DNA.
Onderwijsvorm
13 colleges, bestaande uit 10 hoorcolleges en 3 practica.
Literatuur
Xiong, J., Essential Bioinformatics, Cambridge University Press, 2006,
ISBN-13: 978-0521600828.
Vereiste voorkennis
Voor tweedejaars studenten van een biologisch of beta discipline is geen
extra voorkennis noodzakelijk.
Doelgroep
2MNW, 3F, 3S, 3-SBI, mBio, mi-Sc, mi-BI
Overige informatie
Verplicht voor 2MNW studenten.
Derdejaars Bachelor student in elke beta of life science discipline
(inclusief Medicijnen) mogen instromen.
Inleiding computergebruik
Vakcode
X_000004 ()
Periode
Periode 1
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Innovatieproject geneesmiddelen
Vakcode
X_435095 (435095)
Periode
Periode 3
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. C. de Graaf
Docent(en)
dr. C. de Graaf
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 50 van 88
Doel vak
Het verwerven van kennis en inzicht in het ontwikkelingstraject van
nieuwe geneesmiddelen, als voorbeeld van een innovatieproces.
Inhoud vak
Het ontwikkelen van een geneesmiddel is een lang en kostbaar proces
waarbij veel mensen betrokken zijn. Deze specialisten werken op
verschillende momenten aan het geneesmiddel: de ene groep heeft met
moleculair biologisch werk het doeleiwit gevonden (target identificatie
en validatie), een ander groep heeft met een efficiënte syntheseroute
veel verschillende liganden weten te maken (hit identificatie en
optimalisatie en lead optimalisatie), en weer een ander ontwikkelings
team heeft de biologische data vergeleken en komt tot nieuwe voorstellen
waarbij meteen rekening gehouden wordt met metabolische routes (hit
identificatie en optimalisatie en lead optimalisatie). De belangrijkste
basis principes van dit eerste deel van geneesmiddel ontwikkeling, het
drug discovery proces, komt in de cursussen Van Gen tot Geneesmiddel en
Van Molecuul tot Medicijn uitgebreid aan de orde. De huidige cursus,
Innovatieproject Geneesmiddelen, richt zich juist vooral op de
vervolgstappen die een biologisch actieve verbinding moet doorlopen om
een geregistreerd geneesmiddel te kunnen worden: octrooi aanvraag,
(pre-)klinische ontwikkeling, geneesmiddel registratie, marketing, en
geneesmiddel voorziening.
Onderwijsvorm
Dit project bestaat uit twee delen: 1) het ene deel bevat voornamelijk
hoorcolleges waarin de ontwikkeling van het geneesmiddel besproken
wordt. Docenten van de VU evenals externe deskundigen zullen hiervoor
(gast)colleges verzorgen. Tijdens de cursus zal de stof behandeld in de
hoorcolleges en bijbehorende literatuur (artikelen en E-book
hoofdstukken die evenals de college slides beschikbaar zullen komen op
blackboard) regelmatig wordt individuele kennis getoetst aan de hand van
webtoetsen op blackboard. Parallel aan de hoorcolleges loopt 2) een case
study waarin men in groepen van ca. 5 studenten aan de slag met de
ontwikkeling van een geneesmiddel voor een specifieke ziekte. Deze case
study groep zal een ontwikkelings strategie voor het geneesmiddel moeten
worden uitgewerkt. Een excursie naar een farmaceutische bedrijf en een
werkopdracht Public and Private Partnerships bieden de mogelijkheid om
het geneesmiddel ontwikkelingsplan aan de hand van case study opdrachten
verder uit te werken. Dit leidt uiteindelijk tot een groepsverslag dat
mondeling moet worden gepresenteerd en verdedigd.
Toetsvorm
De cases worden beoordeeld aan de hand van uitvoering, verslag en
presentatie. De theorie wordt getoetst door middel van individuele
webtoetsen en opdrachten.
Literatuur
Grit, R., ‘Projectmanagement’, 6e druk, Noordhoff Uitgevers B.V.,
Groningen/Houten, 2011 (ISBN 978-90-01-79093-6)
De te bestuderen stof en achtergrond informatie worden tijdens de cursus
via Blackboard ter beschikking gesteld.
Aanbevolen voorkennis
Levende Chemie
Van Gen tot Geneesmiddel
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 51 van 88
Doelgroep
1F, 1SBI
Overige informatie
Voor studenten 1-SBI: Het met een voldoende afronden van het
Innovatieproject Geneesmiddelen is alleen mogelijk indien Tutoraat Ia
naar behoren is afgerond.
Integrated Practical Course
Vakcode
X_430516 (430516)
Periode
Periode 5
Credits
12.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Docent(en)
dr. J.N.M. Commandeur, dr. J. Kool
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege, Practicum
Doel vak
Het verkrijgen van inzicht in de toepassing van biochemische,
moleculair biologische, farmacologische/toxicologische en
(bio)analytische technieken in (farmaco)chemisch onderzoek.
Het ontwikkelen van praktische vaardigheden om deze technieken toe te
passen in een geïntegreerd onderzoeksproject.
Het leren mondeling en schriftelijk presenteren van verkregen
onderzoeksresultaten.
Inhoud vak
Technieken die in dit practicum aan bod komen zijn:
- Site-directed en random mutagenese van genen van eiwitten die
centraal staan in het lopende onderzoek (m.n. GPCRs, Cyt P450s);
- Maken van DNA-constructen ten behoeve van (heterologe) expressie van
(menselijke) eiwitten in E. coli en/of S. cerevisiae;
- Identificatie, affiniteitszuivering en enzymkinetische
karakterisering van geëxpresseerde enzymen m.b.v. spectrofotometrische
en fluormetrische enzymbepalingen;
- Gelelectroforese van eiwitten en DNA, PCR, Western blotting;
- Karakterisering van geëxpresseerde receptoren en daaraan gekoppelde
signaaltransductie routes in (diverse) modelsystemen middels
farmacologische bindingsstudies, reportergen assays en/of second
messenger analyses;
- Opzetten van (bio)analytische methodes (HPLC, GC) ten behoeve van de
identificatie en kwantificatie van stabiele en reactieve metabolieten
die gevormd worden door geëxpresseerde mutante en wild-type vormen van
Cyt P450.
Onderwijsvorm
Dit practicum heeft de opzet van een geïntegreerd onderzoeksproject en
wordt afgesloten met een plenaire posterpresentatie.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 52 van 88
Toetsvorm
Verslagen, Meetrapporten en labjournaal
Literatuur
Practicumhandleiding en aangeleverde literatuur.
Aanbevolen voorkennis
Levende Chemie
Biochemie
Van Molecuul tot Medicijn
Innovatieproject Geneesmiddelen
Project Analytische Chemie
Farmaceutische Toxicologie
Doelgroep
2F, 2S
Introduction Entrepreneurship
Course code
S_INTROE ()
Period
Period 1
Credits
6.0
Language of tuition
English
Faculty
Faculteit der Sociale Wetenschappen
Coordinator
dr. I.A.M. Wakkee
Teaching staff
dr. I.A.M. Wakkee
Teaching method(s)
Lecture, Study Group
Course objective
After completing the course students will:
- Be familiar with the key concepts of the domain of entrepreneurship
research.
- Have developed knowledge and insight into the core processes of
entrepreneurship as the pursuit of opportunities.
- Have developed an understanding of the function and position of
entrepreneurs and entrepreneurship in society.
- Have developed an understanding of different theoretical perspectives
of entrepreneurship as a field of research.
In relation to the development of skills they have developed the ability
to:
- Formulate arguments in group discussions.
- Critically reflect on the literature.
- Meet with and discuss entrepreneurship related topics with
entrepreneurs in various sectors.
Course content
This course lies the theoretical foundation for the Minor programme.
Students are introduced to the basic concepts of entrepreneurship
(opportunities, entrepreneurial process, role of the entrepreneur in the
entrepreneurial process) and different theoretical visions (e.g.
Schumpeter, Kirzner, Hayek, Zahra, Venkateraman, Shane).
Form of tuition
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 53 van 88
Interactive lectures. Students prepare for the lectures by studying
selected reading materials and by preparing a number of individual
assignments or group based assignments such as preparing and analysing
interviews with entrepreneurs and professionals working with
entrepreneurs; analysing policy reports and conducting international
comparisons.
Type of assessment
Active participation, Completion of assignments, written exam
Course reading
To be announced
Target group
Students of the Minor Entrepreneurship, bijvakkers, exchange
Kernspinresonantie (NMR)
Vakcode
X_435012 (435012)
Periode
Periode 2
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F.J.J. de Kanter
Docent(en)
dr. F.J.J. de Kanter
Lesmethode(n)
Werkcollege
Doel vak
Het doel van deze cursus is om inzicht te verweven op het gebied van
kernspinresonantie.
Inhoud vak
Tijdens het college zal ingegaan worden op een aantal theoretische
aspecten van kernspinresonantie. Vanwege de belangrijke rol die NMR
speelt bij structuurbepalingen van vaak zeer complexe verbindingen,
staat dit aspect op de voorgrond. Interpretatie van NMR spectra zal
worden geoefend tijdens werkcolleges.
Onderwijsvorm
Hoorcollege en werkcollege
Toetsvorm
De theorie en spectrum interpretatie worden getoetst door middel van
een schriftelijk tentamen.
Literatuur
Collegedictaat.
Doelgroep
3F, 3S, mi-MC, mi-AMC
Keuzevak BioAnalytische massaspectrometrie
Vakcode
X_435026 (435026)
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 54 van 88
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het introduceren van massaspectrometrische technieken die gebruikt
kunnen worden voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.
Inhoud vak
Massaspectrometrie is tegenwoordig de meest gebruikte methode om
chemische verbindingen te karakteriseren, te identificeren en
kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen alle onderdelen van de
verschillende typen massaspectrometers worden besproken, van
massaspectometrie met de verschillende scheidingsmethoden. Tot slot
zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse,
metabolieten onderzoek, schreeningsmonitoringsprogramma's en
karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv.
eiwitten) systemen.
Onderwijsvorm
Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch
deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel
gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook
afzonderlijk worden gevolgd.
Literatuur
Basisliteratuur en informatie van het internet.
Aanbevolen voorkennis
Basiskennis analytische chemie.
Doelgroep
3F, 3S, 3MNW
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak BioAnalytische screeningstechnieken
Vakcode
X_435028 (435028)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het doel is het verwerven van van theoretisch en/of praktisch inzicht
aan de hand van een goed gedefinieerd bio-analytisch probleem.
Inhoud vak
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 55 van 88
De verschillende vormen van vloeistofchromatografie zijn tegenwooordig
de meest gebruikte methoden om chemische verbindingen kwalitatief en/of
kwantitatief te bepalen. Allereerst zullen de verschillende vormen van
vloeistofchromatografie en de hierbij horende detectietechnieken worden
besproken. Vervolgens zal uitgebreid worden inggegaan op de
monstervoorbewerkingstechnieken die gebruikt kunnen worden. Tot slot
zullen toepassingen aan de orde komen op het gebied van de bio-analyse,
metabolieten onderzoek, screeningsmonitoringsprogramma's en
karakteriseren en identificatie van complexe macro-moleculaire (bijv.
eiwitten) systemen.
Onderwijsvorm
Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch
deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel
gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook
afzonderlijk worden gevolgd.
Toetsvorm
Mondeling tentamen
Literatuur
Basisliteratuur en informatie van het internet.
Aanbevolen voorkennis
Basiskennis analytische chemie.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology
Vakcode
X_430546 (430546)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Doel vak
Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in
computersimulaties aan eiwitten.
Inhoud vak
Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om
biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen
zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met
eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen
jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger
print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds
efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy
methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 56 van 88
Onderwijsvorm
Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte
literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van
bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart
worden gebracht.
Toetsvorm
Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats.
Literatuur
Wordt beschikbaar gesteld door de docent.
Aanbevolen voorkennis
Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als
Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational
(Pharmaco)Chemistry (3F en 3S).
Doelgroep
3F
Overige informatie
Studenten die het vak wensen te doen, wordt geadviseerd zich twee weken
van tevoren aan te melden bij genoemde docent. Het vak kan in
voorkomende gevallen dienen als voorbereiding op een bachelorproject.
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430546) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430547).
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak Computational Medicinal Chemistry and Toxicology
Vakcode
X_430547 (430547)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.N.M. Commandeur
Doel vak
Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in
computersimulaties aan eiwitten.
Inhoud vak
Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om
biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen
zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met
eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen
jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger
print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds
efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy
methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen.
Onderwijsvorm
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 57 van 88
Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte
literatuur, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van
bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart
worden gebracht.
Toetsvorm
Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats.
Literatuur
Wordt beschikbaar gesteld door de docent.
Aanbevolen voorkennis
Dit vak bouwt verder op theorie die is behandeld in vakken als
Moleculaire Modeling voor Farmacochemici (2F), en Computational
(Pharmaco)Chemistry (3F en 3S).
Doelgroep
3F
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Studenten die het vak wensen te doen, wordt geadviseerd zich twee weken
van tevoren aan te melden bij genoemde docent. Het vak kan in
voorkomende gevallen dienen als voorbereiding op een bachelorproject.
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430546) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430547).
Keuzevak Farmacochemie - Medicinal Chemistry, DDTF
Vakcode
X_430544 (430544)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. I.J.P. de Esch
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430544) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430545).
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak Fysische Chemie
Vakcode
X_430540 (430540)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 58 van 88
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. M.H.M. Janssen
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430540) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430541).
Keuzevak Fysische Chemie
Vakcode
X_430541 (430541)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. M.H.M. Janssen
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430540) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430541).
Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction
Vakcode
X_435032 (435032)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Doel vak
Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden
voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.
Inhoud vak
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 59 van 88
De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van
fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie,
chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden
besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de
luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden
van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken
zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal
bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als
laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden.
Onderwijsvorm
Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch
gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de
opmerking bij deze vakomschrijving).
Aanbevolen voorkennis
Basiskennis analytische en fysische chemie.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
De variant van dit vak van 6 studiepunten (vakcode 435033) behandelt
beide gedeeltes; de variant van 3 studiepunten (vakcode 435032)
behandelt alleen het theoretische gedeelte.
Keuzevak Luminescence Spectr. and Mol-Mol interaction
Vakcode
X_435033 (435033)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Doel vak
Het introduceren van luminescentietechnieken die gebruikt kunnen worden
voor de analyse van biologisch actieve verbindingen.
Inhoud vak
De onderwerpen die aan de orde komen omvatten de principes van
fluorescentie, fosforescentie, lang-levende luminescentie,
chemiluminescentie en bioluminescentie. Verder zal er aandacht worden
besteed aan 'energy-transfer' mechanismen en andere processen die de
luminescentie van organische processen beinvloeden. De mogelijkheden
van het invoeren van luminescentie 'probes' en hoge resolutietechnieken
zullen eveneens aan de orde komen. Tot slot zullen een aantal
bio-analytische toepassingen worden besproken waarbij technieken als
laser fluorescentie en tijd-opgelost meten niet vergeten zullen worden.
Onderwijsvorm
Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch
gedeelte. Het theoretisch deel kan afzonderlijk gevolgd worden (zie de
opmerking bij deze vakomschrijving).
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 60 van 88
Aanbevolen voorkennis
Basiskennis analytische en fysische chemie.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
De variant van dit vak van 6 studiepunten (vakcode 435033) behandelt
beide gedeeltes; de variant van 3 studiepunten (vakcode 435032)
behandelt alleen het theoretische gedeelte.
Keuzevak Med. Chem., Drug Disc. & Target Find.
Vakcode
X_430545 (430545)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. I.J.P. de Esch
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430544) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430545).
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak Multidimensionale scheidingstechnieken
Vakcode
X_435037 (435037)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Doel vak
Het doel is het verwerven van theoretisch en/of praktisch inzicht aan
de hand van een goed gedefinieerd complex analytisch probleem.
Inhoud vak
Het primaire doel is het introduceren van complexe analytische systemen
waarmee zowel de selectiviteit als de gevoeligheid verbeterd kan
worden. Met name de ontwikkeling en optimalisering van geautomatiseerde
multidimensionale systemen en 'high-throughput' systemen zullen aan de
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 61 van 88
orde komen. Het gaat hierbij om de koppeling van gaschromatografische
of vloeistofchromatografische systemen met elkaar en met verschillende
detectiesystemen (bijv. massaspectrometrie).
Onderwijsvorm
Het studieonderdeel bestaat uit twee onderdelen waarvan het theoretisch
deel (hoorcollege, werkcollege) voorafgaande aan het praktisch deel
gevolgd moet worden. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook
afzonderlijk worden gevolgd.
Toetsvorm
Mondeling tentamen
Literatuur
Basisliteratuur en informatie van het internet.
Aanbevolen voorkennis
Basiskennis analytische chemie.
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek
Vakcode
X_435039 (435039)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Doel vak
Het doel is het verwerven van praktisch en theoretisch inzicht omtrent
een bepaald thema uit het grote aanbod van spectroscopische detectieen identificatietechnieken.
Inhoud vak
Het ontwikkelen en testen van nieuwe spectroscopische technieken die
voor analytische toepassingen kunnen worden gebruikt. Het gaat hier met
name om laser detectiesystemen voor chromatografie of electroforese en
om Raman spectroscopische en hoge-resolutie spectroscopie sytemen voor
de specifieke en gevoelige detectie van organische verbindingen.
Onderwijsvorm
Het studieonderdeel bestaat uit een theoretisch en een praktisch
gedeelte. Het theoretisch deel (3 studiepunten) kan ook afzonderlijk
worden gevolgd. Het volgen van zowel het theoretisch deel als het
praktisch deel levert 3 extra studiepunten op voor een totaal van 6
studiepunten.
Aanbevolen voorkennis
Basiskennis analytische en fysische chemie.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 62 van 88
Doelgroep
3F, 3MNW, 3S
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak Spectroscopische detectie- en identificatietechniek
Vakcode
X_430568 ()
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. F. Ariese
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Keuzevak Theoretische Chemie
Vakcode
X_430538 (430538)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. L. Visscher
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430538) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430539).
Keuzevak Theoretische Chemie
Vakcode
X_430539 (430539)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. L. Visscher
Inhoud vak
De inhoud van het keuzevak wordt in overleg met de docent bepaald. Dit
geldt ook voor het aantal contacturen en te gebruiken studiemateriaal.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 63 van 88
Neem tijdig contact op met de docent.
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Dit keuzevak bestaat in twee varianten. De basisvariant van 3
studiepunten (vakcode 430538) kan in overleg met de coordinator worden
uitgebreid naar 6 studiepunten (vakcode 430539).
Levende chemie
Vakcode
X_430569 ()
Periode
Periode 2
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. M.H. Siderius
Docent(en)
dr. M.H. Siderius, J.C. Vos
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Het hoorcollege dient om inzicht te geven in de basisprincipes van de
bouw van levende cellen, de chemische structuur van de bestanddelen van deze ce
gebruiken voor groei en deling, als ook basisprincipes van de
moleculaire biologie van de levende cel, de manier waarop genetische informatie
belangrijkste aspecten van recombinant DNA technologie worden behandeld.
Inhoud vak
Er wordt begonnen met het bespreken van de structurele en functionele
opbouw van de levende cel, waarna de verschillende soorten
(macro)moleculen die in de cel aanwezig zijn worden behandeld.
Aandacht voor eiwitstructuur en functie, met name in het metabolisme
(Enzym activiteit, Michaelis-Menten kinetiek, Allostere effecten). De
afbraakroutes van de belangrijkste voedingsstoffen
(koolhydraten en vetten) worden rudimentair besproken. Tevens de
behandeling van de
structuur en functie van DNA en de manier waarop DNA in de celkern is
opgevouwen tot chromosomen en de aspecten van DNA replicatie en herstel.
Onderwijsvorm
Hoorcollege. Op de de Blackboard site behorend bij dit vak worden
vragen aangeboden aan de hand waarvan de studenten zichzelf kunnen
Toetsvorm
Biochemie zal worden getoetst aan de hand van twee deeltentamens, Het
eerste deel zal gaan over de hoofdstukken waarin cellen, celbouw,
bouwstenen van biochemisch belangrijke macromoleculen, DNA, eiwit
alsmede enzymfunctie wordt behandeld. Het tweede deeltentamen zal de
hoofdstukken toetsen waarin DNA repair, transcriptie en translatie,
genomes, moleculair biologische technieken en cellulair metabolisme en
energiehuishouding aan de orde komen.
Literatuur
Alberts, B. e.a., Essential Cell Biology 3rd ed, 2009. Hoofdstukken 1
t/m 6, aangevuld met delen zoals aangegeven in de studiehandleiding
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 64 van 88
Doelgroep
1F, 1MNW, 1S, 1-SBI, 1W-B, mBio
Maatschappelijke aspecten van de natuurwetenschappen
Vakcode
X_420153 (420153)
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen
Docent(en)
prof. dr. J.G.F. Bunders-Aelen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
De student beschikt over kennis en inzicht in de interacties tussen
wetenschap en maatschappij.
De student beschikt over kennis en inzicht in de dynamiek van
wetenschap- en technologie ontwikkeling en de rol van sociale processen
daarbij.
De student beschikt over kennis en inzicht in moderne instrumenten
zoals, technology assessment en interactief beleid etc om wetenschap in
maatschappelijk gewenste richtingen te sturen.
De student is in staat om een gefundeerd oordeel geven over
maatschappelijke en ethische aspecten van wetenschap.
De student is instaat om kritisch te reflecteren op zijn
maatschappelijke verantwoordelijkheid als wetenschapper.
Inhoud vak
De cursus gaat in op de wisselwerking tussen wetenschap, technologie en
samenleving. Aan de hand van concrete, actuele vraagstukken wordt eerst
ingegaan op recente knelpunten, dilemma's en controverses in de relatie
wetenschap-maatschappij. Daarna gaat de cursus in op diverse inzichten
en instrumenten (`Technology Assessment'), ethische aspecten,
interactief beleid en maatschappelijk verantwoord ondernemen, die van
belang zijn bij het tot stand brengen van een pro-actieve oordeels en
besluitvorming over W&S ontwikkelingen. Na het theoretische gedeelte van
de cursus, schrijf je samen met een groepje studenten een essay. In dit
essay reflecteer je op een actuele natuurwetenschappelijke ontwikkeling
die belangrijke maatschappelijke consequenties met zich meebrengt.
Onderwijsvorm
Hoorcollege
Toetsvorm
Schrijven van een adviesrapport –groepswerk en individuele beoordeling
Literatuur
Syllabus.
Doelgroep
2F, 2MNW, 2N, 2S
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 65 van 88
Overige informatie
Alle studenten N, S, F en MNW moeten kiezen tussen Geschiedenis van de
natuurwetenschappen en Maatschappelijke aspecten van de
natuurwetenschappen.
Inlichtingen bij Joske Bunders kamer U-552 de Boelelaan 1081, tel. (020)
598 7030.
Macromoleculen en katalyse
Vakcode
X_435450 (435450)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.C. Slootweg
Doel vak
Het kennisnemen van en inzicht verkrijgen in enkele belangrijke
aspecten (synthese, eigenschappen, toepassingen) van synthetische
macromoleculen.
Inhoud vak
In deze cursus wordt kort stilgestaan bij natuurlijk voorkomende
macromoleculen, maar de nadruk ligt op synthetische polymeren. Er wordt
een overzicht gegeven van de syntheseroutes, eigenschappen, en
toepassingen van verschillende klassen polymeren. Aan de orde komen
begrippen als: additie-polymeren, condensatie-polymeren, radicaal
polymerisaties, ionische polymerisaties, gekatalyseerde polymerisaties
(Ziegler-Natta), cross-linking, thermoplastics, fibers, elastomeren,
thermohardende harsen, kunststof recycling.
Onderwijsvorm
Na een beperkte introductie waarbij ook twee experimenten zullen worden
uitgevoerd (polymerisatie en depolymerisatie) zullen de studenten zich
de stof vooral eigen maken door een speciale studie te maken van een
industrieel belangrijk polymeer, daarover een korte scriptie te
schrijven en de inhoud hiervan te presenteren.
Literatuur
Clayden e.a., Organic Chemistry. Oxford: Oxford University Press, 2001.
hoofdstuk 52 en aanvullend materiaal.
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie I en II
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Mathematische methoden
Vakcode
X_401022 (401022)
Periode
Periode 4
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 66 van 88
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
M.M. Zaal MSc
Docent(en)
dr. F. Heinloth, prof. dr. R.C.A.M. van der Vorst
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
1. Leren omgaan met vectoren en matrices.
2. Kunnen toepassen van meer geavanceerde calculustechnieken.
Inhoud vak
1. Stelsels lineaire vergelijkingen, inproduct en uitproduct,
matrices, determinanten, eigenwaarden en eigenvectoren
2. Functies van meer veranderlijken: partiële afgeleiden, gradiënt,
extreme waarden, impliciete functies.
Onderwijsvorm
Per week 2 x 2 uur hoorcollege en 1 x 2 uur werkcollege.
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen (80%) en actieve deelname aan werkcollege blijkend
uit beoordeeld werk (20%). Schriftelijke herkansing. Details zullen in
de studiehandleiding en op Blackboard worden gegeven.
Literatuur
• Adams, Calculus: A Complete Course, 7th Edition. Pearson, 2009
• Aanvullend dictaat over vectoren en matrices (beschikbaar via
Blackboard)
Doelgroep
2F
Medische (patho)fysiologie 2
Vakcode
X_436503 (436503)
Periode
Periode 2
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. G.J.M. Stienen
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak
Het doel van de cursus is het verwerven van kennis van en inzicht in de
endocriene functies in het menselijk lichaam: hormonale controle, de
nierfunctie, voeding en spijsvertering, de voortplanting, groei en
veroudering, de afweer en het bloed.
Inhoud vak
De cursus is opgebouwd uit de volgende delen met de bijbehorende
onderwerpen:
- hormonale controle
- de nierfunctie
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 67 van 88
- voeding en spijsvertering
- de voortplanting, groei en veroudering
- bloed(stelping), afweer.
Onderwijsvorm
Patiëntdemonstraties, hoorcolleges, werkgroepen met casussen, practica
en presentaties. In de hoorcolleges zullen de bovengenoemde
cursusonderwerpen in verband gebracht worden met klinische problemen.
Hierbij zal een relatie gelegd worden tussen de ziektebeelden en de
bouw, functie en werking van de nieren, de spijsverteringsorganen en de
geslachtsorganen. Een belangrijke plaats wordt ingenomen door de
hormonale controle van de processen die optreden en de effecten van
veroudering. Bovendien zal aandacht worden besteed aan bloedstelping en
de rol van het bloed binnen het afweersysteem. De werkgroepen en
practica zijn erop gericht de zelfwerkzaamheid te bevorderen. In de
werkgroepen zullen bovengenoemde onderwerpen uitgediept worden aan de
hand van concrete klinisch georiënteerde vragen en opdrachten. De
practica vormen een illustratie en demonstratie van behandelde
principes. Hierbij komen de volgende onderwerpen aan bod:
- nierfunctie
- metabolisme en inspanning
- veroudering.
De cursus wordt afgesloten met presentaties van groepjes van 3 studenten
over een zelfgekozen onderwerp met als thema veroudering.
Toetsvorm
Inleveren van de antwoorden op de werkgroepvragen, van de
practicumverslagen en het houden van de presentatie is verplicht. De
cijfers hiervan tellen mee in de eindbeoordeling. De cursus wordt
afgesloten met een tentamen met 40 meerkeuze en 8 open vragen.
Literatuur
Human Physiology van Vander, Sherman en Luciano (MacGrawHill, 12e
editie). Daarnaast wordt een syllabus beschikbaar gesteld met daarin
opgenomen een uitgewerkt rooster, de werkgroep vragen/opdrachten en de
practicumhandleiding.
Doelgroep
2F, 2LI, 2MNW, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI
Medische fysiologie 1
Vakcode
X_430059 (430059)
Periode
Periode 1
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. P. Koolwijk
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege, Practicum
Doel vak
Het verwerven van kennis van en inzicht in het membraantransport, de
bouw en functie van het zenuwstelsel, het hart en de bloedsomloop onder
normale omstandigheden en tijdens ziekte.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 68 van 88
Inhoud vak
De volgende onderwerpen komen aan bod:
- Transport van stoffen over het celmembraan.
- Bouw van zenuwvezels, neuronale schakelingen, meten van de
voortplantingsnelheid van de actiepotentiaal.
- Bouw en functie van het hart, ECG, bloeddrukmeting.
- Centrale en perifere zenuwstelsel: neuronale paden en reflexen.
- Sensorische en motorische functie.
- Bewustzijn en gedrag: EEG, evoked potentials.
Onderwijsvorm
Patiëntdemonstraties, hoorcolleges, werkgroepen met casussen, practica
en presentaties. Onderwerpen patiëntdemonstraties: rugklachten, het
carpaal tunnel syndroom en dwarslaesie. In de hoorcolleges zullen de
klinische problemen in verband gebracht worden met bovengenoemde
cursusonderwerpen. Hierbij zal een relatie gelegd worden tussen de
ziektebeelden, de bouw, functie en werking van het zenuwstelsel, de
zintuigen, het hart en de bloedsomloop. Een belangrijke plaats wordt
ingenomen door het elektromyogram (EMG), de mechanische eigenschappen
van botten en spieren, het elektrocardiogram (ECG) en het
elektro-encefalogram (EEG). De werkgroepen en practica zijn erop
gericht de zelfwerkzaamheid van de studenten te stimuleren. In de
werkgroepen zullen bovengenoemde onderwerpen uitgediept worden aan de
hand van concrete klinisch georiënteerde vragen en opdrachten. De
practica vormen een illustratie en demonstratie van behandelde
principes. Hierbij komen de volgende onderwerpen aan bod:
- Zenuwgeleiding en Rugklachten
- Elektrische activiteit van het hart
- Bloeddruk meting
- Bewustzijn en Gedrag.
Toetsvorm
Inleveren van de antwoorden op de werkgroepvragen en van de
practicumverslagen is verplicht. De cijfers hiervan tellen mee in de
eindbeoordeling. De periode wordt afgesloten met een tentamen bestaande
uit 30 meerkeuze en 8 open vragen.
Literatuur
Vander, Sherman, and Luciano, Human Physiology 11th ed. MacGrawHill.
Daarnaast wordt een syllabus beschikbaar gesteld met daarin opgenomen
de werkgroep vragen/opdrachten en de practicumhandleiding.
Doelgroep
1F, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI
Mentoraat / Tutoraat
Vakcode
X_000008 ()
Periode
Semester 1
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Overige informatie
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 69 van 88
Iedere eerstejaars student Business Analytics is verplicht deel te nemen
aan het Eerstejaars mentoraat in periodes 1 en 2. Het met een voldoende
afronden van het vak Wiskunde wereldwijd is alleen mogelijk indien is
deelgenomen aan het Eerstejaars mentoraat.
Modern Developments in Pharmacochemistry
Vakcode
X_430515 (430515)
Periode
Periode 6
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. N.P.E. Vermeulen
Docent(en)
prof. dr. N.P.E. Vermeulen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Het doel van dit college is de student kennis van en inzicht te laten
verwerven in het onderzoek naar de ontdekking (discovery) en de
ontwikkeling (development) van nieuwe geneesmiddelen, met name in de
nieuwste ontwikkelingen daarin. Ook zal kennis verworven worden in het
succes/falen van deze processen.
Inhoud vak
In dit studieonderdeel zullen diverse moderne ontwikkelingen in het
'discovery' en 'development' proces van de ontwikkeling van nieuwe
geneesmiddelen. De nadruk ligt op verdieping van eerder in de BSc-FAR
behandelde stof, dit aan de hand van recente onderzoeksartikelen.
Onderwerpen die aan de orde komen zijn: drug design en synthese,
moleculaire farmacologie ('target finding and validation'), cellulaire
'stress and signaling', moleculaire toxicologie ('ADME and drug
safety'), 'computational medicinal chemistry and toxicology' en
bioanalyse van geneesmiddelen. Ook zullen systeem en netwerk analysie
en biomarkers aan de orde komen.
Onderwijsvorm
Er wordt gebruik gemaakt van Blackboard, en de stof wordt behandeld in
de vorm van 'journal clubs' over recente onderzoeksartikelen,
discussie-sessies en mondelinge presentaties door de studenten in
aanwezigheid van deskundige onderzoekers/docenten.
Toetsvorm
60% bijdrage Journal Clubs, 40% schriftelijk tentamen
Literatuur
Het studiemateriaal zal bestaan uit recente researchartikelen uit de
verschillende specialisatie-gebieden in MSc-opleiding Drug Discovery
and Safety.
Aanbevolen voorkennis
Innovatieproject Geneesmiddelen
Farmacokinetiek & ADME processen
Farmaceutische Toxicologie
Moleculaire Modelling
Organische Chemie 2
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 70 van 88
Doelgroep
3F
Moleculaire Modeling voor Farmacochemici
Vakcode
X_435103 (435103)
Periode
Periode 6
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. C. de Graaf
Docent(en)
dr. I.J.P. de Esch, dr. C. de Graaf, dr. D.P. Geerke
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak
Het leren van verschillende rekenkundige benaderingen om de biologische
activiteit van nieuwe medicijnmoleculen te begrijpen en te voorspellen.
Verschillende technieken die worden gebruikt in de moderne
farmacochemie zullen behandeld worden en de student zal de voor- en
nadelen van de individuele methoden leren inschatten.
Inhoud vak
De computer wordt in toenemende mate gebruikt voor het vinden en
ontwerpen van nieuwe stoffen met gewenste biologische activiteit. Deze
'in silico' methoden stellen de farmacochemicus in staat om efficiënter
nieuwe geneesmiddelen te ontwikkelen. Verder dragen de verschillende
technologieën bij aan een beter begrip van de werking van liganden en
biologische targets. In dit vak zal aandacht worden besteed aan het nut
van moleculaire modeling en hoe moleculen beschreven kunnen worden door
de computer (2D descriptoren, 3D descriptoren, atomair, quantum
chemisch). De eigenschappen van liganden die verantwoordelijk zijn voor
de activiteit worden geïdentificeerd door middel van (3D)QSAR,
farmacofoor modeling, en molecular docking. Het berekenen van de
conformaties van moleculen zal worden behandeld met behulp van
moleculaire mechanica, waarbij ook verschillende sampling methodes
worden behandeld (systematisch, Monte Carlo, moleculaire dynamica). Ook
zal kort worden ingegaan op quantum mechanische manieren om moleculen
te beschrijven. Vervolgens zullen de toepassing van deze methodes in
rationele drug discovery besproken worden zoals virtual screening en
'de novo' design benaderingen.
Onderwijsvorm
Hoorcolleges, werkcollege, practica.
Toetsvorm
De beoordeling zal plaatsvinden op basis van schriftelijke tentamens en
tussentijdse opdrachten.
Literatuur
Collegedictaat.
Aanbevolen voorkennis
Geïntegreerd Practicum
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 71 van 88
Doelgroep
2F
Overige informatie
Het met een voldoende afronden van het vak Moleculaire Modelling
(435103) is alleen dan mogelijk, indien het “tutoraat FAR 2” naar
behoren is afgerond.
Natuurstoffen
Vakcode
X_435440 (435440)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. E. Ruijter
Doel vak
Doel van deze cursus is het verkrijgen van een overzicht over de
structuur, eigenschappen en biosynthese van de verschillende klassen van
natuurstoffen.
Inhoud vak
Aansluitend op de basiskennis organische chemie van het eerste en tweede
studiejaar worden in deze cursus een aantal aspecten van de
natuurstofchemie behandeld. De biologische activiteit van vele
natuurstoffen hangt nauw samen met hun structurele kenmerken. De
structurele kenmerken van met name vetzuren, suikers, aminozuren,
terpenen en steroïden, alkaloïden en flavonoïden komen aan de orde. Hun
specifieke rol in de natuur en een aantal specifieke fysische en
chemische eigenschappen komen aan bod. In de cursus ligt een sterke
nadruk op de biosynthese van natuurstoffen.
Onderwijsvorm
De student bestudeert zelfstandig meerdere hoofdstukken uit het
cursusboek, waarbij de docent steeds beschikbaar is voor vragen.
Toetsvorm
Mondeling tentamen
Literatuur
Medicinal Natural Products, P.M. Dewick, 3rd Ed., Wiley (2009). ISBN:
978-0-470-74167-2
Aanbevolen voorkennis
Organische Chemie 1, 2 en 3
en
Biochemie
Doelgroep
3F, 3S
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 72 van 88
Organische chemie 1
Vakcode
X_435091 (435091)
Periode
Periode 5
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. ir. R.V.A. Orru
Docent(en)
prof. dr. K. Lammertsma, prof. dr. ir. R.V.A. Orru
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
Het college beoogt het bijbrengen van kennis van de organische chemie
waarmee men in staat moet zijn:
a) te voorspellen hoe een bepaalde functionele groep of een
combinatie van verschillende functies onder gegeven omstandigheden zal
reageren.
b) het verloop van een reactie te beschrijven aan de hand van het
mechanisme
c) de volgorde van de verschillende reacties in een eerstapssynthese
te begrijpen
Inhoud vak
Dit college concentreert zich op de driedimensionale structuur van
diverse functionele groepen en op de relatie tussen structuur en
reactiviteit. Voortbouwend op de kennis van atoom en molecuulbouw en de
MO-theorie komen aspecten van structuur aan de orde: de structuur van
alkanen, cycloalkanen, alkenen en alkynen, hybridisatie, conformatieanalyse, reactieve deeltjes, nomenclatuur, stereochemie, chiraliteit,
resonantie, aromaticiteit, reactietypen.
In het college is ruim plaats (10 uur) voor het verwerken van de
leerstof door het maken van vraagstukken en het oefenen met
molecuulmodellen. Deze vraagstukken vormen zowel de intermezzo's in het
hoorcollege als het hoofdbestanddeel van opdrachten uit de
studiehandleiding, die tijdens werkcollege-uren worden besproken.
Onderwijsvorm
Hoorcollege 16 uur; werkcollege 9 uur.
Toetsvorm
De stof wordt schriftelijk getentamineerd.
Literatuur
"Organic Chemistry" Clayden, Greeves, Warren & Wothers, Oxford
University press (ISBN 019850346).
Aanbevolen voorkennis
Bij de behandeling van de leerstof wordt ervan uitgegaan dat de stof uit
de hoofdstukken 1, 2, 4, 5, 7, 8, 12, 14 en 16 uit “Clayden” bekend is
uit de eerdere eerste jaars colleges.
Doelgroep
1F
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 73 van 88
Organische chemie 2
Vakcode
X_435007 (435007)
Periode
Periode 1
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. ir. R.V.A. Orru
Docent(en)
prof. dr. ir. R.V.A. Orru
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
Het college beoogt het aanleren van basiskennis organische chemie.
Inhoud vak
Dit college vormt één geheel met het eerstejaarscollege. Het zet voort
met de presentatie van specifieke reactietypen, nu eens niet
georganiseerd naar functionele groepen, maar rondom een
gemeenschappelijk mechanisme: nucleofiele substituties, eliminaties,
addities aan meervoudige koolstof-koolstofbindingen, electrofiele
aromatische substituties, addities en substitutie aan carbonylgroepen,
omleggingen.
Eveneens wordt aandacht besteed aan syntheseplanning.
Onderwijsvorm
Hoorcollege 16 uur; werkcollege 9 uur.
Toetsvorm
De stof wordt schriftelijk getentamineerd.
Literatuur
"Organic Chemistry" Clayden, Greeves, Warren & Wothers, Oxford
University press (ISBN 019850346).
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie I
Doelgroep
2S, 2F
Organische chemie 3
Vakcode
X_435109 (435109)
Periode
Periode 1
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. E. Ruijter
Docent(en)
dr. E. Ruijter
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 74 van 88
Doel vak
Doel van deze cursus is het verdiepen en verbreden van de kennis van
organische reacties en hun toepassing in de synthese van complexe
moleculen.
Inhoud vak
De basiskennis organische chemie van het eerste en tweede studiejaar
wordt in deze cursus verbreed en verdiept. De structuur en reactiviteit
van organische verbindingen wordt nader belicht en nieuwe reacties
worden geïntroduceerd aan de hand van toepassingen in de synthese van
complexe moleculen. Bijzondere aandacht wordt in deze cursus besteed aan
het beschrijven en begrijpen van reactiemechanismes en de beginselen van
syntheseplanning.
Onderwijsvorm
Om optimaal te profiteren van de werkcolleges wordt van de deelnemende
studenten actief studiegedrag verwacht. De docent behandelt in
hoorcolleges niet de volledige stof, maar slechts de samenvatting en
eventuele vragen. De hierdoor vrijgekomen tijd wordt gebruikt om met de
nieuw verworven kennis aan de slag te gaan en aan de hand van chemische
puzzels te leren hoe de nieuwe reacties daadwerkelijk worden toegepast.
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen
Literatuur
Organic Chemistry, J.P. Clayden, N. Greeves, S. Warren & P.D. Wothers,
1st Ed., Oxford University Press (2001). ISBN: 978-0-19-850346-0
Aanbevolen voorkennis
Organische Chemie 1 en 2
Doelgroep
3F, 3S, mi-MC, mi-AMC
Organometaalchemie
Vakcode
X_435018 (435018)
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. A.W. Ehlers
Doel vak
Het doel van dit college is het verdiepen van de basiskennis op het
gebied van coordinatiechemie en de organometaalchemie.
Inhoud vak
Er wordt aandacht besteed aan de volgende onderwerpen:
- organometaalchemie van overgangsmetalen
- organometaalcomplexen en organische synthese
- homogene katalyse
- bio-anorganische chemie (metallo-enzymen, biomimetica).
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 75 van 88
Onderwijsvorm
Zelfstudie.
Toetsvorm
Mondeling tentamen
Literatuur
Elschenbroich, C., Organometallics 3rd ed. Weinheim: Wiley-VCH. of in
overleg met de docent.
Aanbevolen voorkennis
Anorganische Chemie 2
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Oriëntatie op de M-variant
Vakcode
X_400375 (400375)
Periode
Periode 4
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
A. van Luijn MSc
Docent(en)
A. van Luijn MSc
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
- Het verwerven van kennis en inzicht in de met name in
beleidsprocessen, beleidstheorie en beleidsanalyse;
- Het verwerven van kennis en inzicht in de structuur en het beleid van
de Nederlandse overheid met name op het gebied van wetenschap;
- Het verwerven van kennis en inzicht in managementprocessen en
-theorieën, met specifieke aandacht voor kennismanagement en
projectmanagement;
- De student is instaat om beleid te analyseren en beleidsopties te
identificeren;
- De student is instaat tot projectmatig werken in teamverband;
- De student beschikt over vaardigheden, zoals onderzoeksopzet maken,
literatuurstudie, kritisch analyseren, argumenteren, en schriftelijk en
mondeling presenteren;
- Oriëntatie op de M-variant, dan wel de masters Management,
Policy-Analysis and Entrepreneurship.
Inhoud vak
Beleid speelt op vele manieren en niveaus een rol in onze samenleving.
Ook binnen de wetenschap heb je eigenlijk altijd met beleid te maken.
Enerzijds speelt beleid een rol bij het stimuleren en/of reguleren van
wetenschappelijk onderzoek. Anderzijds wordt wetenschap ingezet om
beleid rondom een maatschappelijk probleem te ondersteunen of te
adviseren.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 76 van 88
Ook management speelt in allerlei situaties en op allerlei niveaus een
rol. Zo wordt wetenschappelijk onderzoek altijd intern aangestuurd door
het management of direct door het hoofd van de afdeling, maar ook meer
indirect door het faculteitsbestuur en College van Bestuur.
Ook al lijken beleid en management veelal ad hoc vorm gegeven te
worden, toch zijn er structurele processen en ordenende principes aan
te wijzen. Inzicht in deze processen en principes maakt dat je begrijpt
waarom bepaalde keuzes gemaakt worden en bijvoorbeeld waarom beleid er
uitziet zoals het in een beleidsnota geformuleerd wordt.
In het eerste deel van deze cursus krijg je colleges over diverse
beleids- en managementaspecten geïllustreerd aan de hand van praktische
casussen. Dit deel wordt afgesloten met een tentamen.
Het tweede deel van de cursus bestaat uit een projectopdracht waarin de
analyse van een actueel, maatschappelijk en natuurwetenschappelijk
vraagstuk in relatie tot (overheids)beleid centraal staat. Voorbeelden
zijn nanotechnologie, Q- koorts, orgaandonatie of biobrandstof. De
nadruk ligt hierbij op zelfwerkzaamheid, eigen initiatief en
oordeelsvorming en op het werken in teamverband. Wij willen daarmee een
leersituatie creëren die nauw aansluit bij de praktijk van beleidsmatig
onderzoek en projectmatig werken. De problematiek en de verschillende
beleidsopties rond dit vraagstuk worden kritisch geanalyseerd. De
resultaten, conclusies en aanbevelingen worden weergegeven in een
beleidsadviesrapport dat aan het eind van de cursus mondeling
gepresenteerd wordt.
Onderwijsvorm
De eerste helft van de cursus zal bestaan uit werkcolleges, de tweede
helft uit het uitvoeren van een projectopdracht in teamverband.
Literatuur
Informatie over literatuur wordt via Blackboard verstrekt.
Doelgroep
Derdejaars FEW-studenten.
Overige informatie
Onderdeel van de M-oriëntatie.
Oriëntatie science educatie
Vakcode
O_ORIBETA (991010)
Periode
Semester 2
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Coördinator
ir. J.G. Schoonhoven
Docent(en)
ir. J.G. Schoonhoven
Lesmethode(n)
Werkcollege
Doel vak
Voor een student die deze cursus heeft doorlopen geldt:
de student is bereid en in staat te reflecteren op zijn/haar
functioneren,
de student is in staat om aan te geven wat het betekent om een goede
docent in de bovenbouw te zijn,
de student is in staat om zijn eigen geschiktheid voor het beroep van
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 77 van 88
docent te beoordelen,
de student kan aangeven of het beroep van docent iets voor hem/haar is,
de student verwerft een aantal communicatieve en didactische
vaardigheden.
Inhoud vak
De cursus bestaat de eerste week uit diverse werkcolleges, de volgende
drie weken uit een stage op een school voor voortgezet onderwijs. elke
week is er een praktijkbespreking en verdieping op de VU. De stage is
het belangrijkste onderdeel van de cursus, deze voer je uit samen met
een medestudent. In totaal zal de stage ongeveer twaalf dagen in beslag
nemen.
Tijdens de werkcolleges komen de volgende onderwerpen aan de orde:
Hoe bouw je een presentatie op, hoe kom je over.
Hoe vertaal je (wetenschappelijke) informatie naar het niveau van je
doelgroep.
Wat doet een (goede) leraar allemaal.
Wat is het verschil tussen presenteren en onderwijzen.
Welke kenmerken heeft de doelgroep en hoe kun je daar rekening mee
houden.
Hoe ontwerp je een (activerende) les.
Hoe krijg je je doelgroep actief.
Met welke communicatieve aspecten in de klas moet je rekening houden.
Tijdens de stage onderneem je de volgende activiteiten:
observeren van lessen;
zelf minimaal vier lessen geven, in zowel onderbouw als bovenbouw;
uitvoeren van een klein onderzoek;
zo veel mogelijk deelnemen aan alle activiteiten op school en zo
(hernieuwd) kennis maken met het voortgezet onderwijs vanuit het
docenten perspectief.
Onderwijsvorm
Je levert aan het eind van de cursus een verslag in. Het verslag is een
samenhangend verhaal dat een beeld geeft van jouw leerproces tijdens de
cursus. Met je verslag laat je zien waar je staat als mogelijk
toekomstig docent. Het gaat primair om het zichtbaar maken van je
ontwikkeling, niet noodzakelijk om te bewijzen dat je een goede docent
bent. Werkcolleges en stage vormen samen een voltijds programma, het
is niet mogelijk gelijktijdig andere colleges te volgen.
Doelgroep
Deelname aan de cursus staat open voor derdejaars bachelorstudenten van
de faculteiten Exacte Wetenschappen en Aard- en Levenswetenschappen. De
cursus wordt aangeraden voor studenten die overwegen de
lerarenopleiding te gaan volgen binnen de masteropleiding (E- variant)
of aansluitend op hun masteropleiding. Ook voor studenten die
vaardigheden op willen doen in het verzorgen van wetenschappelijke
presentaties is de cursus interessant.
Overige informatie
Meer informatie is te verkrijgbaar bij Arjan Schooonhoven:
a.schoonhoven@ond. vu. nl, of te vinden op www.onderwijscentrum.vu.nl
Practicum Moderne synthetische methoden
Vakcode
X_435016 (435016)
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 78 van 88
Periode
Ac. Jaar (september)
Credits
9.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. E. Ruijter
Doel vak
Kennismaken met nieuwste experimentele ontwikkelingen in de organische
synthese.
Inhoud vak
In dit vak maak je kennis met de nieuwste experimentele technieken in
de organische synthese. Je gaat werken aan een project dat direct met
lopend onderzoek verknoopt is. Parallelle synthese methodiek met behulp
van semi-automatische apparatuur wordt toegepast in combinatie met
parallelle opwerkingstechnieken m.b.v. indampmodules en automatische
kolomchromatografie. Ook leer je syntheses en zuiveringen absoluut
water- en zuurstofvrij uitvoeren d.m.v. Schlenk-technieken en het
werken met een glovebox.
Onderwijsvorm
Practicumproject
Literatuur
Clayden e.a., Organic Chemistry, Oxford: Oxford University Press (ISBN
019850346).
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie I & II, practicum organische synthese,
kernspinresonantie (NMR).
Doelgroep
3S, 3F
Overige informatie
Dit vak wordt op individuele basis aangeboden in overleg met de docent.
Project Bio-analytische chemie
Vakcode
X_430577 ()
Periode
Periode 6
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. H. Lingeman
Docent(en)
dr. H. Lingeman, dr. J. Kool
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Het verwerven van kennis en het opzetten en uitvoeren van analytische
technieken die gebruikt kunnen worden bij de (kwantitatieve) bepaling
van geneesmiddelen en endogene componenten in biologische systemen.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 79 van 88
Inhoud vak
In een geïntegreerd hoor-/werkcollege en practicum komen de technieken
aan de orde die gebruikt kunnen worden voor zowel de kwalitatieve als
kwantitatieve bepaling van geneesmiddelen, met de hierbij horende
metabolieten en/of ontledingsproducten in een biologische matrix. Dit
betekent dat aan de hand van de fysisch-chemische eigenschappen van de
te onderzoeken verbinding een protocol wordt opgesteld, waarmee deze
verbinding bepaald kan worden. Vervolgens wordt de bepaling uitgevoerd
en worden de resultaten in een verslag weergegeven.
Onderwijsvorm
Geïntegreerd hoor- /werkcollege en projectmatig onderwijs, waarbij de
student aan de hand van opdrachten zelf alle noodzakelijke gegevens,
theoretische achtergrond en de voorschriften moet opzoeken en het
experiment zelf vorm moet geven.
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen en beoordeling van de praktische activiteiten
(inclusief voorbereiding, experimentele vaardigheden, schriftelijke
verslaglegging). Beide onderdelen tellen gelijkwaardig mee in
eindbeoordeling en geen van beide onderdelen mag lager dan een 5 zijn.
Literatuur
Materiaal beschikbaar gesteld door de docenten. Uitgebreide informatie
over de behandelde stof kan worden gevonden in D.C. Harris, Quantitative
Chemical Analysis, Eighth Edition, W.H. Freeman and Company, New York,
2010.
Doelgroep
1F (periode 6), 1MNW (periode 5)
Voor studenten MNW begonnen in 2011/2012: Project Bio-analytische chemie
(6 ec) vervangt Bio-analytische chemie (X_430094)+ Practicum bioanalyse
(X_430511)
Overige informatie
Slagingseis 1F:
Het met een voldoende afronden van het vak Bio-Analytische Chemie is
alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van tutoraat FAR 1B naar
behoren zijn afgerond.
Statistiek
Vakcode
X_420223 (420223)
Periode
Periode 1+2
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. C.M. Quant
Docent(en)
dr. C.M. Quant
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
In dit college worden basisbegrippen uit de kansrekening en statistiek
behandeld. De student is na dit college in staat om statistische
analyses te interpreteren en kan ook zelf eenvoudige statistische
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 80 van 88
analyses uitvoeren met behulp van Excel en SPSS.
Inhoud vak
We beginnen met beschrijvende statistiek. Daarna behandelen we een
aantal basisbegrippen uit de kansrekening. Hierbij komen in ieder geval
stochasten, verwachting, variantie, covariantie, onafhankelijkheid, de
regel van Bayes, belangrijke kansverdelingen en de centrale
limietstelling aan bod. Vervolgens houden we ons bezig met statistische
technieken zoals schatten en toetsen,
betrouwbaarheidsintervallen en lineaire regressie. We analyseren
datasets met behulp van de computerprogramma's SPSS en Excel.
Onderwijsvorm
Hoorcollege, werkcollege en computerpracticum.
Toetsvorm
Schriftelijke deeltentamens en verplichte computeropdrachten.
Literatuur
Berenson, Levine and Krehbiel: Basic Business Statistics, Concepts and
applications, 12th edition.
Doelgroep
2SBI en 2F
Studie en loopbaan
Vakcode
X_000018 ()
Periode
Periode 4
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
drs. M. Touwen
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doelgroep
2F, 3F, 2S, 3S
Synthese practicum
Vakcode
X_435192 (435192)
Periode
Periode 2, Periode 3
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. J.C. Slootweg
Docent(en)
dr. J.C. Slootweg
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Practicum
Doel vak
Het doel van het practicum is de student vaardigheid bij te brengen in
de preparatieve organische en (in mindere mate) anorganische chemie,
alsook een beeld te geven hoe de (an)organisch chemicus zijn
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 81 van 88
experimentele resultaten verkrijgt.
Inhoud vak
Tijdens dit practicum ligt aanvankelijk het accent op het aanleren van
een aantal basale isolatie- en zuiveringstechnieken zoals
kristalliseren, destilleren, sublimeren, extraheren, chromatografie
(GLC, kolomchromatografie). Deze technieken worden geleerd tijdens een
aantal eenstapssyntheses, die tevens de collegestof illustreren. De
syntheses worden deels op macroschaal (2-10 g) en deels op microschaal
(50-100 mg) uitgevoerd. In de eerste periode wordt tevens het
werkcollege spectroscopische technieken gegeven, ten behoeve van de
interpretatie van de in de loop van het practicum op te nemen IR, UV,
NMR, en ook massaspectra. Later worden enkele meerstapssyntheses
uitgevoerd, waarbij het van belang is elk tussenproduct goed te
zuiveren en te karakteriseren. De meeste experimenten kennen een
'probleem-oplossende' aanpak, waarbij aandacht wordt besteed aan
onderzoeksmethodiek.
Toetsvorm
Experimentele vaardigheid, zelfstandigheid, voorbereiding, mondelinge en
schriftelijke communicatie
Literatuur
Lehman, J.W., Multiscale Operational Organic Chemistry 2nd ed, New
Jersey: Prentice Hall, 2009.
Aanbevolen voorkennis
Organische chemie 1 en 2.
Doelgroep
2F
Overige informatie
Studenten 2S volgen dit vak in periode 2.
Studenten 2F volgen dit vak in periode 3.
Thermodynamics for SBI and F
Vakcode
X_430513 (430513)
Periode
Periode 2
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. G. van der Zwan
Docent(en)
dr. G. van der Zwan
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
Leren toepassen van thermodynamica op chemische processen.
Inhoud vak
Het eerste deel van het college zal bestaan uit het bestuderen van
warmte en arbeid, de afleiding van de grootheid entropie en het bepalen
van de richting van spontane processen. Nieuwe grootheden als enthalpie
en vrije energie zullen worden ingevoerd, en de toepassing van de twee
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 82 van 88
hoofdwetten van de thermodynamica (je kan geen energie uit niets maken,
en warmte stroomt spontaan van warm naar koud) op chemische processen
zal vervolgens aan de orde komen.
Chemisch evenwicht, en effecten van druk en temperatuur daarop kunnen
dan effectief worden bestudeerd. Toepassing van de thermodynamica op
redox reacties, de wet van Nernst en de electrochemische cel vormen het
laatste onderdeel van dit college.
Onderwijsvorm
Hoor- en werkcolleges.
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen
Literatuur
Thomas Engel en Philip Reid: "Thermodynamics, Statistical
Thermodynamics, and Kinetics, Pearson, ISBN 978-0-321-64311-7.
Aanbevolen voorkennis
Basiswiskunde en Calculus 1
Doelgroep
2F
Van atoom tot (bio)molecuul
Vakcode
X_430580 ()
Periode
Periode 1+2
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. F. Bickelhaupt
Docent(en)
dr. M. Wijtmans
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Dit vak beoogt de bouwstenen aan te dragen waarop alle chemische
disciplines rusten en zodoende een solide fundament voor de gehele
hierop volgende studie te leggen. Tegelijkertijd wordt ernaar gestreefd
de scheikunde in de context van andere natuurwetenschappen te plaatsen
(thema "Van Atoom tot Biomolecuul") alsmede haar relevantie voor het
verschijnsel leven duidelijk te maken (thema "Levende Chemie").
Inhoud vak
Chemie is de wetenschap van stoffen, hun structuur en eigenschappen, en
met name hun omzetting via chemische reacties. Binnen de
natuurwetenschappen neemt de chemie een centrale plaats in en heeft vele
raakvlakken met de andere disciplines, van de fysica tot en met de
biologie.
Binnen het thema "Van Atoom tot Biomolecuul" (periode 1) wordt het
multidisciplinaire karakter geaccentueerd door het behandelen van
fundamentele scheikundige begrippen die relevant zijn in de context van
de verschillende natuurwetenschappen. In dit kader zullen o.a. aan bod
komen: “evenwichten”, “pH berekeningen”, “oplosbaarheid”,
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 83 van 88
“oxidatietoestand” en “redoxchemie”.
Bij de overgang naar het thema "Levende Chemie" (periode 2) verschuift
het zwaartepunt van het vak "Van Atoom tot Biomolecuul" naar complexere
aspecten van de scheikunde, beginnend bij de fysische en anorganische
chemie via de (metaal)organische chemie tot aan de biologische chemie.
De volgende onderwerpen worden in dit kader behandeld: "alles is
chemie", "atomen en het periodieke systeem", "moleculaire structuur",
"electronische structuur en chemische binding", "chemische reacties",
"thermodynamica", "kinetiek", "inleiding organische chemie", "inleiding
biochemie", "zelf gegevens opzoeken in de chemische literatuur".
Onderwijsvorm
hoorcollege en werkcollege.
Toetsvorm
tentamen
Literatuur
Steven S. Zumdahl, Chemical Principles, 6th Ed., Houghton Mifflin
Company: Boston, New York, 2009
Doelgroep
1F, 1S, 3-SBI, mi-Sc, mi-BI
Overige informatie
Voor studenten 1S: Het met een voldoende afronden van het vak Van atoom
tot (bio)molecuul is alleen dan mogelijk, indien de onderdelen van
Tutoraat SK 1A naar behoren zijn afgerond.
Deze slagingseis geldt alleen voor 1S, niet voorde andere doelgroepen.
Van gen tot geneesmiddel
Vakcode
X_435107 (435107)
Periode
Periode 2
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. M.J. Smit
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Het college heeft tot doel studenten inzicht te geven op de wijze
waarop signalering in en tussen cellen plaatsvindt en hoe chemische
signaalstoffen en geneesmiddelen hierop kunnen aangrijpen.
Inhoud vak
Met het de ontrafeling van het menselijk genoom en de vooruitgang
binnen de levenswetenschappen komen we steeds meer te weten over de rol
van verschillende biomoleculen in belangrijke cellulaire processen. In
dit deel van het vak Van gen tot geneesmiddel wordt aandacht besteed
aan de klassen van eiwitmoleculen die betrokken zijn bij belangrijke
cellulaire processen zoals bijvoorbeeld cellulaire communicatie,
membraantransport, celdeling en apoptosis. Hierbij zal daar waar
mogelijk aandacht besteed worden aan de wijze waarop verstoring van deze
processen kan leiden tot het ontstaan van belangrijke ziektes (o.a.
kanker, asthma/COPD, Parkinson). In het bijzonder worden de klasse van
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 84 van 88
G-eiwit gekoppelde receptoren, ionkanalen en tyrosine kinase receptoren
besproken, aangezien deze receptoren belangrijke aangrijpingspunten zijn
voor geneesmiddelen.
Onderwijsvorm
Hoorcolleges, werkcollege (gebruik CD Roms, opdracht) en zelfstudie.
Literatuur
Patrick, G., An Introduction to Medicinal Chemistry 4th ed. Oxford:
Oxford University Press, 2009 (ISBN 978-0-19-923447-9).
Alberts e.a., Essential Cell Biology 2nd ed, 2004. aangevuld met
relevante literatuur.
Doelgroep
1F, 1MNW, 1-SBI, 1W-B, 2-SBI
Veiligheidsinstructie S, F, MNW en SBI 30min
Vakcode
X_000019 ()
Periode
Periode 1
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Voorlichting door studentendecanen en CSL
Vakcode
X_000007 ()
Periode
Periode 1
Credits
0.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Wetenschapscommunicatie voor Bèta-onderzoekers
Vakcode
AB_470185 ()
Periode
Periode 5
Credits
6.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Fac. der Aard- en Levenswetenschappen
Coördinator
dr. J.F.H. Kupper
Docent(en)
prof. dr. J.E.W. Broerse, R.C. van Koten MSc, dr. M.J.W.
Bos
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkgroep
Doel vak
- Verwerven van kennis en inzicht in de rol van communicatie rondom
nieuwe
ontwikkelingen in wetenschap en technologie
- Verwerven van kennis en inzicht in de verschillende modellen van
wetenschapscommunicatie (deficiet, context, interactie en participatie),
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 85 van 88
haar parameters en gebruikelijke applicatiedomeinen.
- Verwerven van kennis en inzicht van de beperkingen en
mogelijkheden van de verschillende media waarin de modellen tot
uitdrukking kunnen komen (journalistiek, TV en film, het Internet, musea
en science centra).
- Verkrijgen van vaardigheid in het ontwerpen van een
doelgroepgerichte communicatie
- Het opdoen van leerervaring met het werken in een
multidisciplinaire
Inhoud vak
Wetenschap heeft verstrekkende gevolgen voor de maatschappij (bv.
biotechnologie, neurowetenschappen, farmacie). Maar hoe kijkt de
maatschappij eigenlijk naar wetenschappelijke ontwikkelingen? Wat vindt
de industrie van wat we uitgevonden hebben en wat denken andere
wetenschappers van onze kennis? De visie van deze mensen over ons en ons
werk is van groot belang voor de richting die het onderzoek in de nabije
toekomst gaat nemen. Daarom is communicatie over wetenschap van cruciaal
belang. In deze cursus raak je vertrouwt met een aantal modellen van
wetenschapscommunicatie, het herkennen van hun toepassingen in de
praktijk en de verschillende soorten publiek die men ermee kan
aanspreken (populariseren voor leken, informatieoverdracht voor de
industrie, faciliteren van interdisciplinair onderzoek in de wetenschap,
participatie van burgers en patiënten in onderzoek). Door middel van
opdrachten raak je bekend met de praktische kant van
wetenschapscommunicatie, bijvoorbeeld wetenschapsjournalistiek,
voorlichting, dialogen en debatten, etc. De opdrachten worden deels
individueel uitgevoerd en deels in een groep.
Niveau cursus: 2 (verdieping)
Onderwijsvorm
Colleges, opdracht, zelfstudie
Toetsvorm
Schriftelijk tentamen (50%), groepsopdr. (25%), individuele opdr. 25%)
Literatuur
(Online) syllabus
Doelgroep
Keuzecursus voor tweedejaars BSc Biomedische Wetenschappen en Biologie
en BSc. Gezondheid en Leven. Speciaal aanbevolen voor studenten die
overwegen de C-variant (wetenschapscommunicatie) of M-variant (beleid en
management) in hun masterprogramma op te nemen.
Overige informatie
Voor meer informatie: [email protected]
Why Chemical Reactions Happen
Vakcode
X_435088 (435088)
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
prof. dr. K. Lammertsma
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 86 van 88
Docent(en)
prof. dr. K. Lammertsma
Lesmethode(n)
Hoorcollege
Doel vak
Het doel van het college is - in nauwe aansluiting met het voorafgaande
college Chemische Binding - nader in te gaan op de quantummechanische
beschrijving van moleculen en de basis te leggen voor de beantwoording
van de vraag waarom en wanneer chemische reacties plaatsvinden. Veel
aandacht wordt besteed aan evenwichtsconstanten in relatie tot de
tweede hoofdwet van de thermodynamice.
Inhoud vak
Molecular orbitals voor homo- en hetero-tweeatomige moleculen;
elektronenverdeling in grotere moleculen; een aantal basale chemische
reacties; chemische evenwichten; reactiesnelheden; binding in
geconjugeerde systemen.
Onderwijsvorm
Gecombineerd hoorcollege en werkcollege
Literatuur
Keeler, J., and Wothers, P., Why Chemical Reactions Happen, New York:
Oxford University Press, 2003 (ISBN 0-19-924-9733).
Doelgroep
1S, 1F
Wijsgerige vorming 2: Wetenschapsfilosofie
Vakcode
X_428002 (428002)
Periode
Periode 4
Credits
3.0
Voertaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit der Exacte Wetenschappen
Coördinator
dr. G.C. Eigner
Lesmethode(n)
Hoorcollege, Werkcollege
Doel vak
De leerdoelen van de cursus bestaan uit het opdoen van wetenschapsfilosofische kennis, het kunnen toepassen van deze kennis op je
eigen vakgebied, en aan de hand hiervan reflecteren op je vak. De kennis
die aan bod komt in de cursus bestaat uit verschil-lende visies op
wetenschapsfilosofische onderwerpen, zoals de wetenschappelijke methode,
realisme, empirisme, reductionisme, het doel van de wetenschap,
wetenschappelijke verklaringen, en de grenzen van wetenschap. Het
hoofddoel van de cursus is dat je door toepassing van deze
wetenschapsfilosofische kennis op situ-aties uit de praktijk van je
vakgebied een onderbouwde en genu-anceerde visie ontwikkelt over de
waarde van de kennis die je in je studie aangeboden krijgt, over de
status van wetenschap in on-ze samenleving, en over je toekomstige
verantwoordelijkheid in de beroepspraktijk. Een nevendoel van de cursus
is dat je vaar-digheden ontwikkelt op het gebied van tekstanalyse en
kritische discussie.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 87 van 88
Inhoud vak
Het college behandelt moderne opvattingen met betrekking tot aard en
methode van de natuurwetenschappen; hun ontwikkeling; hun relatie met
praktijk; en de normatieve en ethische aspecten van wetenschapsbeoefening. Deze thema’s worden steeds behandeld aan de hand van
concrete voorbeelden uit de natuurwetenschappen.
Toetsvorm
Het eindcijfer voor de cursus is een gewogen gemiddelde van drie
deelcijfers: het cijfer behaald voor tussentijdse toetsen die worden
afgenomen tijdens het tweede en derde werkcollege (20%), het cijfer
behaald voor een verslag dat wordt geschreven in groepen van drie
studenten (30%) en het cijfer behaald voor een individu-eel geschreven
afsluitend essay (50%).
Literatuur
Peter Godfrey-Smith, Theory and Reality: An Introduction to the
Philosophy of Science (Chicago University Press, 2003). Aanvullende
literatuur wordt bekendgemaakt in de studiehandleiding en via
Blackboard.
Doelgroep
3F, 3S, 3-SBI
Overige informatie
Inlichtingen bij de docent, dr. K. Eigner, HG-13A30, [email protected].
Inschrijving verplicht via Blackboard.
Vrije Universiteit Amsterdam - Faculteit der Exacte Wetenschappen - B Farmaceutische Wetenschappen - 2011-2012
6-3-2013 - Pagina 88 van 88