Ionizing radiation induced transcriptional changes in the developing mouse brain Verheyde Joris Abstract The brain is the final result of a series of well timed consecutive waves of cellular proliferation, migration, and differentiation. Acute irradiation during pregnancy could selectively disturb these events to result in various forms of malformations. In this work we concentrated on the transcriptional alterations induced by ionising radiation in the mouse developing brain and its different cell-types. We analysed the modulated gene expression profile after 50 cGy X-ray exposure in embryonic mouse total brains at developmental stages E13, E15 and E18. A decreasing expression profile could be identified at later development, which suggests a reduction in radiosensitivity. Functional grouping of the modulated mRNA transcripts revealed that the main activated pathways in irradiated wild type embryos are involved in the induction of Trp53 dependent programmed cell death and intracellular signalling cascades. Trp53 null mutants showed a decreased expression profile for the Cyclins and Cdk's, involved in the G2 cell cycle phase. To determine possible regional differences we evaluated the radiation induced transcriptional response in three different regions of the telencepehalon. Further analysis showed that the strongest radiation induced effect was observed in the cerebral cortex. Since cell type dependent differences can be observed after radiation exposure, we evaluated the neural cell-type and differentiation-stage dependent radiation induced transcriptional and cellular responses. Detailed analysis of short-term cultured and irradiated neural cell types indicated that the expression of the Trp53inp1/Hipk2 and Ccng1/Mdm2 signalling pathways are activated in a celltype dependent matter. Interestingly, long term cultured neurons show also an induction of apoptosis irradiation, but they were not characterized by an increased expression of Cdkn1a. To conclude, we demonstrate also that ionising radiation does not only influence cell survival, but induces also the impairment of neural differentiation may contribute to an incorrect formation of the neural network. Samenvatting De ontwikkeling van de hersenen verloopt via de aaneenschakeling van verschillende fasen waarbij neurale cellen zich vermenigvuldigen, migreren en differentiëren. Een acute blootstelling aan ioniserende straling kan deze cellulaire processen verstoren en aanleiding geven tot hersenmalformaties. De focus van dit werk ligt op de analyse van transcriptionele veranderingen in de ontwikkelende hersenen en de neurale cellen na de blootstelling aan ioniserende straling. De gemoduleerde genexpressie in embryonale muizenhersenen werd drie uur na de blootstelling aan 50 cGy X-stralen en op ontwikkelingsdag E13, E15 en E18 bepaald. Dalende expressieniveaus op latere ontwikkelingsstadia suggereren een verminderende stralingsgevoeligheid van de embryonale hersenen. Een functionele groepering van deze gemoduleerde genen toonde aan dat de belangrijkste geïnduceerde mechanismen na blootstelling behoren tot de Trp53 afhankelijke intracellulaire signaal-transductie en de inductie van apoptosis. Bij Trp53 deficiënte embryo’s werd een verlaagd expressieprofiel voor verschillende cyclines en cycline-afhankelijke kinasen teruggevonden, wat duidt op een arrest in the G2 fase van de cel-cyclus. Analyse van hersenweefsel laat echter niet toe om de transcriptionele veranderingen van verschillende neurale cellen aan te tonen. De genexpressie resultaten van bestraalde en gecultiveerde (24u) primaire neuronen en astrocyten toonde aan dat de genen betrokken bij zowel de Trp53inp1/Hipk2 als de Ccng1/Mdm2 signaal-transductie mechanismen een modulatie vertoonden. Anderzijds vertonen ook neuronen die voor lange termijn gecultiveerd werden apoptosis, zonder dat er een expressie van Cdkn1a kon geregistreerd worden. Analyse van verschillende neurale celtypes na blootstelling aan een lage dosis ioniserende straling suggereert dat verschillende mechanismen verantwoordelijk zijn voor de activatie van P53 en dat deze mechanismen verschillen naargelang het celtype en het differentiatiestadium