Green Life-Science Hub Origin Tracer

Kansen voor
de tuinbouw
Michel Ebskamp
1 november 2012
Nederlandse Algemene Kwaliteitsdienst Tuinbouw
Wat doet Naktuinbouw:
• Keuringen en inspecties van teeltmateriaal
• Diensten die kwaliteit verhogen
• Rassenonderzoek ten behoeve van
kwekersrecht en registratie
Rassenonderzoek
Criteria voor het verlenen van kwekersrecht:
• Distinction - Onderscheidbaarheid
• Uniformity - Homogeniteit
• Stability
- Stabiliteit
• Kunnen we met moleculaire technieken het
rassenonderzoek ondersteunen?
Variety Tracer
Genetische analyses bij
inbreuk op kwekersrecht
Het ‘Sherlock Holmes’
concept in inbreuk zaken
Praktijk Voorbeeld - Freesia
Achtergrondinformatie en Probleembeschrijving:
• Zowel ras A (1991) als ras B (2007) hebben kwekersrecht
• Rasbeschrijvingen zijn vergelijkbaar
Onderzoeksvraag:
• Is ras B identiek of in essentie afgeleid van ras A?
Praktijk Voorbeeld
B
A
A
A
B
B
B
refs
clustering analyse – Jaccard
bloemkleur
Praktijk Voorbeeld - Freesia
Conclusies
•
Genetische variatie in de gehele dataset was hoog
•
De DNA profielen van alle monsters van Ras A en Ras B
waren identiek (100%) met de gebruikte reactiecondities
•
De resultaten kunnen verklaard worden doordat:
– Ras A en Ras B identiek zijn, of
– Ras B in essentie afgeleid is van Ras A
Pathogen Tracer
Forensisch onderzoek bij
uitbraken van plantenziektes
Het ‘Track and Trace’
concept bij uitbraken
Database met pathogenen
H py 00M01_bm_z y g+H py 00M02_bm_z y g+H py 00M03_bm_z y g+H py 00M04_bm_z y g
100
99
98
97
96
95
94
93
92
91
90
89
88
87
86
85
84
83
82
81
80
79
78
77
76
75
74
73
72
71
70
69
68
67
66
65
64
63
62
61
60
59
58
57
56
55
54
53
52
51
50
49
48
47
46
45
44
43
42
41
40
39
38
37
36
35
34
33
32
31
30
29
28
27
26
25
24
23
22
21
20
19
18
17
16
15
14
13
12
11
10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
Character Data
81
138
255
59
65
463
424
464
473
513
75
75
32
33
202
55
53
56
24
201
25
26
45
35
51
36
4
34
37
4
42
41
52
38
40
434
441
439
457
440
469
472
348
350
143
435
521
522
526
532
462
71
186
368
372
223
442
502
430
431
164
254
129
129
61
179
191
61
7
11
20
494
495
21
9
191
191
453
515
516
517
515
516
517
527
528
57
39
49
70
491
490
432
455
253
503
461
5
436
8
196
182
433
451
454
518
519
520
518
519
520
10
114
3
6
452
215
28
28
27
17
12
437
523
524
66
429
83
278
62
16
19
506
195
401
401
60
103
438
216
204
220
217
210
207
206
205
211
474
111
483
484
218
470
471
422
112
360
187
213
478
165
68
288
246
73
488
489
128
144
374
110
92
98
109
110
113
118
119
306
308
310
316
334
336
338
342
344
352
354
356
358
239
240
241
242
243
244
245
247
248
249
250
106
106
212
67
69
192
194
192
194
192
194
251
177
508
509
510
514
504
511
512
458
507
459
123
125
124
125
362
364
446
477
447
152
153
154
159
161
162
163
137
146
370
378
384
382
388
391
390
393
394
396
397
398
399
403
404
409
410
411
412
413
418
134
136
139
142
145
149
150
151
131
370
378
384
382
388
131
132
134
135
147
133
498
499
500
501
380
386
392
395
405
407
408
417
421
380
386
148
444
445
492
493
183
456
224
168
184
480
485
482
487
497
481
496
486
531
169
107
108
104
105
312
324
326
328
330
423
443
443
23
47
140
141
30
44
46
181
22
219
479
13
13
14
2
400
197
198
200
203
178
178
199
448
166
406
126
130
76
77
78
79
80
82
84
85
86
87
88
89
90
91
93
94
95
96
97
100
101
102
117
256
258
260
262
264
266
268
270
272
274
276
280
282
284
286
290
292
294
296
298
300
302
304
314
318
320
322
340
366
525
466
467
465
346
475
476
155
156
157
158
160
170
171
414
415
416
419
420
222
221
530
167
450
529
172
332
252
193
193
193
214
505
180
208
15
460
74
127
127
376
72
473
176
235
120
228
425
185
231
236
237
175
232
234
238
50
50
188
189
209
173
227
115
116
229
427
428
225
190
233
48
426
468
29
31
230
174
1
43
121
122
226
63
58
64
54
18
64
463
81
99
18
54
Ontwikkeling/Toekomst DNA
• Genetische verwantschap op basis van de
volledige DNA sequentie informatie
• Meer voor minder
• Grotere zekerheid
• Ook kleine verschillen detecteren
(mutanten?)
• Koppeling DNA profiel aan raskenmerken
Universiteit van Amsterdam
• Nieuwe technologische doorbraak DNA:
Volledige DNA sequentie bepaling van een
organisme is mogelijk
• Hoe kunnen we deze technologie
implementeren?
Green Life-Science Hub
• Samenwerking UvA en Naktuinbouw
met Green Forensics als onderdelen:
• DNA: nieuwe sequentie technologiën
• Studenten: Master Forenscis Science
• Isotopen: Herkomstbepaling
Origin Tracer
Forensisch onderzoek naar
herkomst van materiaal
Herkomstbepaling
• Vanuit het Keuringswerk werd de vraag
gesteld: kunnen we aantonen waar
uitgangsmateriaal vandaan komt?
• Waar zijn Esdoorns geproduceerd?
• Italië of China
• Consequenties voor fytosanitaire inspectie
• Komen (Nederlandse) eikels voor de
opkweek van bosplantsoen echt uit officiële
opstanden of zijn ze elders ingezameld?
• Komen Convallaria knollen echt uit
Nederland (importeis VS)?
Praktijkcase paprika
• Supermarkt twijfelt aan herkomst geleverde
paprika’s (Israel/Egypte vs. Spanje)
• Leverancier wil onafhankelijke
herkomstbepaling laten uitvoeren om
wantrouwen leveranciers weg te nemen.
• Perfecte praktijkcase voor ontwikkeling
ORIGIN tracer
Origin Tracer voor bomen
Origin Tracer voor herkomstbepaling
• Locatie
– Geografisch
• Uniformiteit
– Bijmengen vanuit andere (productie)locaties
• Preventie
– Belangrijk dat er een techniek is voor bewijs
• Betrouwbare informatie voor de consument
– Aantoonbare herkomst van producten
Green Forensics
Variety Tracer
Genetische
analyses bij
inbreuk op
kwekersrecht
DNA
Forensisch
onderzoek
naar herkomst
van materiaal
Origin Tracer
Isotopen
DNA
Forensisch
onderzoek bij
uitbraken van
plantenziektes
Pathogen Tracer
Kansen en Crossovers
• ..