Interacties: de volgende generatie sensoren

advertisement
Magnetische deeltjes
in biosensoren
Leo van IJzendoorn
Moleculaire Biosensoren
voor medische diagnostiek
Faculteit Technische Natuurkunde
Inhoud
Introductie
•Point-of-Care biosensoren
Immunoassay’s
• antilichamen en de zwangerschaptest
• problemen bij lage concentraties
NLT module
biosensoren
Superparamagnetische deeltjes
Detectieprincipes
• magnetisch of optisch
Het meten van interacties: een nieuwe generatie sensoren
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 1
Point of Care Biosensors
Snelle en gevoelige detectie van biomarkers
in een druppel lichaamsvloeistof
glucose
mM
μM
hormonen
eiwitten
nM
pM
fM
M = mol/L
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 2
Point of Care Biosensors
Biologische herkenning: van elektrochemie naar immunoassays
Glucosemeter:
incubatie
OH
meetprocedure
O
H
OH
H
H
O
+ 2H++2e-
2 Fe(CN6)3+ 2e-
HO
H
OH
D-glucono-1,5-lactone
enzym
glucose
oxidase
OH
O OH
H
OH
oxidatie
ferrocyanide
(meting stroom)
H
H
HO
H
H
OH
-D-glucose
2 Fe(CN6)4ferrocyanide
biologische herkenning
alleen voor hoge concentraties
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 3
Immunoassays
Biologische herkenning: van elektrochemie naar immunoassays
sensor oppervlak
1
sample
met biomarker
15 nm
sensor oppervlak
antilichaam / antistof
 450 aminoacids
artificial production
in lab
Nobelprijs 1984
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
2
detectie
sensor oppervlak
3
PAGE 4
Immunoassays: zwangerschapstest
meten van human Chorionic Hormone (concentratie in nM regime)
- deel: 92 aminozuren; ook in:
- Thyroid Stimulating Hormone (TSH)
- Luteinizing Hormone (LH)
- Follicle Stimulating Hormone (FSH)
- deel: 145 aminozuren is uniek for hCG

Ab*

Ab
sandwich
test principe gebruikt beiden:
urine
muis antilichaam - 
dye conjugate
bind aan -subunit
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
transport
test line
gebonden
muis antilichaam
tegen -deel
control line
gebonden
muis antilichaam
tegen Ab*
PAGE 5
Immunoassays
na hoeveel tijd meet ik een betrouwbaar signaal?
reactie-evenwicht
Ag  sAb
k on
sAgAb
k off
tijdsafhankelijkheid bezetting
d
 k on Ag1    k of f
dt
Ag
koff
kon
sAb
sensor oppervlak
1-

leeg
bezet
aannames:
- diffusie speelt geen rol
- geen uitputting van de concentratie
oplossing voor bezettingsgraad: (t)
 optimistische schatting voor lage concentraties
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 6
Immunoassays
na hoeveel tijd meet ik een betrouwbaar signaal?
oplossing simpele differentiaalvergelijking is uitdaging voor scholieren
(altijd verificatie oplossing mogelijk door invullen)
herschrijf:
d
 (k on Ag  k of f )   k on Ag  p  q
dt
d( p  q)
d
 p
 p p  q 
dt
dt
oplossing: ln p  q  pt  A
hoe vinden we C?
invullen:


t00
d p  q
 pdt
 p  q
 p  q  Cept
Cq


q
1  e pt
p

k on Ag
1  exp  k on Ag  k of f  t 
k on Ag  k of f
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 7
Immunoassays
na hoeveel tijd meet ik een betrouwbaar signaal?
k on Ag
1  exp  k on Ag  k of f  t 

k on Ag  k of f
t 12 
0.693
k on Ag  k of f
typische waarden: kon = 104 - 107 M-1s-1
koff = 10-4 - 10-6 s-1
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
conc
(pM)

t 12 (uur )
100
0.5
9.6
10
0.091
17.5
1
0.01
19.1
0.1
0.001
19.2
?
PAGE 8
Uitdagingen voor POC eiwit sensor
met pM gevoeligheid
- technologie die gevoeligheid verbeterd
- kwantitatieve uitlezing (niet alleen drempelwaarde)
- bereiken van stabiel signaal in minuten
pM conc en typische k’s  t½~ hours !!
- overwinnen van diffusie limitering (typically 10-20 minutes)
- onderdrukken van niet-specifieke absorptie
Magnetic particle labels can meet this challenge !
- magneetveld om deeltjes naar sensor te trekken
- magnetische of optische detectie van deeltjes
- voorkom vorming aggregaten
24-7-2017
PAGE 9
Superparamagnetische deeltjes
Wat is paramagnetisme?
geisoleerde spins die uitlijnen in magnetisch veld:
Langevin:
 = susceptibiliteit (helling)
n 2 0H
M
 H
3kT
ideaal paramagnetisch materiaal:
 niet-magnetisch zonder veld
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 10
Superparamagnetische deeltjes
 KVgrain 

 kT 
kunstmatig paramagnetische deeltje: m  0 exp
plastic matrix
ijzeroxyde
nanodeeltjes
grain size
5-15 nm
bead diameter
100 nm - 3μm
  2
superparamagnetisch
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 11
Magnetische actuatie in een immunoassay
antistof
magnetisch deeltje
biomarker
Mogelijkheden:
1. antistoffen eerst verzamelen op deeltjes
sensor oppervlak
2. reactie versnellen door aantrekken
([Ag] + diffusie beperking opheffen)
3. niet specifiek gebonden deeltjes lostrekken
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 12
Magnetische detectie
Magnetische momenten:
300 nm bead:  3 10-17 Am2
ferritine:  3 10-21 Am2
Zeer lage achtergrond (1 deeltje meetbaar !)
20 nm
Au
chip met stroomdraad
genereert lokaal magnetisch veld
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
GMR (giant magneto resistance)
magnetoweerstand
PAGE 13
Magnetische detectie
prototype sensor
100m
wire
GMR
1mm
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
chip in cartridge
PAGE 14
Magnetische detectie
voorbeeld magnetisch “wassen”
Parathyroid Hormone (PTH) assay
GMR signal ( % )
1 uur
incubatie
50
4 nM
40
30
20
0.5 nM
10
0 nM
0
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9 10
time ( min )
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 15
Magnetische detectie
voorbeeld verhoging gevoeligheid
PTH sandwich assay in 4 minuten (!) :
ruim 2 orden gevoeliger
door magnetische actuatie
100.0%
met magnetische aantrekking
GMR signal
10.0%
blank
1.0%
blank
zonder
magnetische
krachten
0.1%
1
10
100
1000
10000
PTH concentration ( pmol/L )
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 16
Optische detectie
uitkoppeling licht door deeltjes bij totale interne reflectie
lokale verandering brekingsindex door aanwezigheid deeltjes bij oppervlak
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 17
Optische detectie
frustrated total internal reflection
groter detectie oppervlak en goedkopere technologie
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 18
Optische detectie
voorbeeld cadiac troponine sandwich assay
signal change (%)
50
40
30
10 pM
20
10
0 pM
0
0
1
2
3
4
5
t (min)
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 19
Interacties: de volgende generatie sensoren
trekkrachten
Magnetische krachten  bindingssterkte te meten
dissociatie zonder kracht
k of f 
1
t of f

1
t attempt
exp  Eb / kT 
dissociatie met kracht
k of f 
1
t of f

1
t attempt
exp  (Eb  Fx) / kT 
meet dissociatie als functie van de kracht:
en plot logaritme van k tegen de kracht
 x positie energiebarriere
 k(0) biologische relevante k
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 20
Interacties: de volgende generatie sensoren
trekkrachten
Microscope
Sample Holder
Force up to 100 pN
Magnetic system
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
Force uniform within 2%
over 150 m x 150 m
24-7-2017
PAGE 21
Interacties: de volgende generatie sensoren
trekkrachten
dissociatie snelheid hangt van dichtheid
antistof op de bead af !
100
Number of beads [%]
90
80
70
60
50
40
Fm
30
20
10
0
0
50
100
150
200
Time [s]
250
biotin – anti-biotin system
blocking with caseine
alle metingen gedaan kracht van 30 pN
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 22
Interacties: de volgende generatie sensoren
trekkrachten
meten als functie van de kracht:
kracht [pN]
0
10
20
30
40
50
60
0
-0,5
ln(koff)
-1
-1,5
-2
-2,5
-3
-3,5
-4
ln(koff)=ln(k0)+(x/kT).F
Quantificeren van
binding en dissociatie
mechanismen
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
4
k of f (0)  1 10 s
1
PAGE 23
x  0.88 nm
PAGE 23
Interacties: de volgende generatie sensoren
het uitoefenen van een draaimoment
Roterende
magneet
• DNA uncoiling by topoisomerase
• Number of rotations
Magnetic
bead
• Distance between bead and surface
Enzym
DNA
molecuul
Oorzaak bead rotatie ??
Objective
Koster et. al. Nature 2007
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 24
Interacties: de volgende generatie sensoren
het uitoefenen van een draaimoment
uniform roterend magnetisch veld
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 25
Interacties: de volgende generatie sensoren
torsie door middel van een draaimoment
niet gebonden deeltje in roterend magnetisch veld
rotatie veld 2 Hz
rotatie deeltje 2 Hz
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 26
Interacties: de volgende generatie sensoren
het uitoefenen van een draaimoment
niet gebonden deeltje in roterend magnetisch veld
rotatie veld 6 Hz
gemiddelde rotatie
frequentie deeltje 1.2Hz
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 27
Interacties: de volgende generatie sensoren
het uitoefenen van een draaimoment
model: balans tussen magnetische and hydrodynamische torque
d
B sinf ieldt    8R
dt
3
max
12
Break down frequency
8
Break down frequency [Hz]
Bead Frequency [Hz]
10
8
6
4
2
6
Field-independent
moment
4
max=  B
2
0
0
0
5
10
15
20
25
30
35
40
0.4
Field frequency [Hz]


magnetic torque:  =  B sin
B
0.8
1.2
1.6
2.0
B [mT]
Janssen, Bios.Bioel. 2008
torque: 2.10-18 Nm over 10° ~ 180 kJ/mol
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 28
Interacties: de volgende generatie sensoren
het uitoefenen van een draaimoment
torderen van moleculair antistof – eiwit complex met bekende torque
spanning in molecuul loopt op en veert weer terug
vergelijkbaar met het opdraaien van een veer
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 29
Interacties: de volgende generatie sensoren
het uitoefenen van een draaimoment
een eenvoudig fysisch model:
verhouding torsie moduli
DNA/eiwit  100 – 200
gemeten verhouding 150
momenteel onderzoek aan
verschillende complexen
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 30
Samenvatting
• Magnetische deeltjes maken snelle gevoelige sensors mogelijk
- deeltjes actuatie
 verkorte tijd tot evenwicht
 diffusie beperkingen opgeheven
- magnetisch wassen geeft lage achtergrond
• Onderzoek naar interactie voor volgende generatie sensoren
zowel trekkrachten als draaimomenten geven informatie
 multifunctionele biosensoren
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 31
Acknowledgement
Menno Prins (Philips Research)
Arthur de Jong
Asha Jacob
Xander Janssen
Joost van Noorloos
Ben de Clerq
Alexander van Reenen
TUe / Applied Physics / Molecular Biosensors
PAGE 32
Download