Molecular Biosensors for medical diagnostics (MBx) Groepsleden Staff F-vleugel 1e verdieping Leo van IJzendoorn Arthur de Jong Menno Prins (DHL, Philips Research) Postdoc Asha Jacob AIO’s Francis Fahrni Xander Janssen Loes van Zijp Kim van Ommering (Philips) Andrea Ranzoni (Philips) + 5-10 studenten Master Track: Fysische Instrumentatie & Medische Fysica Inhoud • Voorbeeld van een biosensor: de glucose sensor ………..principes, voordelen, beperkingen • Immunologie is essentieel voor biosensing • Magnetische labels • Voorbeelden stages: Single molecule biophysics Voorbeeld van een biosensor: de glucosemeter voor diabetici wegwerp strip - een druppel bloed (microliter) - analyse resultaat na 5 seconden beschikbaar ! Enorme vooruitgang voor patiënten (sinds 1999 vergoed door ziektekostenverzekering): van rigide dieet en ziekenhuiscontroles naar zelfzorg verlaging van kans op shock (hyper) of sufheid verlaging ziektekosten Hoe werkt de glucosesensor? 1.druppel bloed wordt opgezogen 2. (bio)chemische reactie met enzym 3. redox reactie stroompje H2O2 + 2H+ +2e- 2H2O Alleen mogelijk vanwege hoge concentratie glucose Biologie / Biochemie: honderden eiwitten gevonden in zeer lage concentraties: (meer dan factor miljard lager dan glucose!) 1 fmol/l 1 pmol/l 1 nmol/l 1 mol/l 1 mmol/l hartfalen produktie eiwit “troponine” glucose tijdrovende analyse in chemisch lab. (bijv. Diagnostisch Centrum Eindhoven) Nodig: nieuwe concepten voor een gevoelige en snelle biosensor ! selectiviteit gebruik biologische herkennng Elektrisch gevoeligheid gereedschapkist natuurkunde Optisch signaal Magnetisch Biologische herkenning: gebruik immuunsysteem natuur eiwit 20 nm antilichaam celoppervlak sensoroppervlak herkenning van één soort eiwit Hoe bereiken we snelheid en gevoeligheid ? MBx onderzoekt gebruik magnetiseerbare deeltjes eiwit superparamagnetische deeltjes: detectie en fysieke manipulatie ! antilichaam sensoroppervlak Biologische moleculen van nature niet magnetisch: gevoelig! o.a. gebruik van GMR sensoren uit harde schijf van computer geschikt voor 1 staps minisensor zonder wasstappen een magnetische biosensor Prototype Philips Research 20 nm Au stroomdraad magneetveld sensor voelt magneetje stroom verandert MBx: nieuwe concepten voor de volgende generatie sensoren een functionele biosensor Meet interactie van proteïnes door aanleggen krachten: rotatie of translatie: single molecule biophysics in sensor ! Toepassingen: - immunogeniciteit nieuwe medicijnen - onderzoek naar allergie Meten van bindingsterkten door trekken (magnetische pincet) afstuderen Inge van Donkelaar Model systeem: Anti-Biotin - biotinylated-BSA 100 Number of beads [%] 90 ~ 0 pN 80 70 ~ 4 pN 60 50 40 ~ 18 pN 30 ~ 36pN 20 Fm ~ 53 pN 10 0 0 20 40 60 80 100 120 140 160 Time [s] dissociatie constante (zonder kracht): k0=0.025 s-1 positie energie barriere: 0.23 nm (komt overeen met MD calcs!) Torsiestijfheid van een moleculaire binding? Instrumentatie voor aanleggen roterend magneetveld image analysis ! balans hydrodynamische wrijving en magnetische kracht torque (Ben DeClerq) Studie van niet-specifieke interacties (BSc Alexander van Reenen) beads in solution 2000x diluted modify ionic strength or pH clean with IPA start timer Β Β deeltjes met streptavidine eiwit plakken aan glas eiwitten veranderen van lading bij verschillende pH afscherming door ionen Eiwit interacties ook met: (Benchmarking) - optisch pincet (BMT) - hydrodynamische actuatie met stroming - “tethered particle motion” Deeltje met protein-G op glas / IgG op deeltje in optisch pincet IgG coated Bas Cloin Gemiddelde kracht voor loskomen deeltjes gevonden! enkele binding dubbele binding Samenvattend MBx: jonge groep met uitdagend multidiciplinair onderzoeksveld biologie fysica electrotechniek chemie Stage/afstudeer onderwerpen op gebied van: - actuatie magnetische deeltjes - (bio)moleculaire interacties - diverse technieken voor meten van interacties “single molecular biophysics” Voor actuele projecten: [email protected] of kom langs in de F-vleugel !