Nummer PRB43 BONTE RIJ Datum 21-7-17 Versie 001 Opsteller Kun Bladzijde 1/7 ONDERWERP Determineren van gram negatieve staven. TOEPASSINGSGEBIED Het voorschrift is van toepassing bij het practicum behorende bij blokboek 4 van de laboratoriumopleiding. INLEIDING In de darmen van mens en dier komen grote aantallen bacteriën voor. Deze zijn onder normale omstandigheden, in de darm, niet ziekteverwekkend en worden daarom commensalen genoemd. Veel van deze darmbacteriën behoren tot de familie van de Enterobacteriaceae, het zijn gram negatieve staven (gr-st) Voor het determineren van deze Enterobacteriaceae worden een aantal biochemische testen uitgevoerd, die samen de zgn. BONTE RIJ vormen. De resultaten worden met een tabel vergeleken. Het principe van deze techniek is gebaseerd op de aanwezigheid van verschillende enzymen binnen diverse families van gram negatieve staven. Door de aanwezigheid of afwezigheid van een enzym zal een bepaalde biochemische reactie al dan niet verlopen. De bonte rij bestaat uit de volgende buizen: Fysiologisch zout: voor het maken van de bacteriesuspensie, om er andere (vloeibare) buizen mee te beënten. Ureum Deze buis is bedoeld voor het onderzoek op de aan of afwezigheid van het enzym urease. Urease is het enzym dat ureum splits in ammoniak waarbij een alkalisch milieu ontstaat. Hierdoor slaat de indicator fenolrood om van geel naar lila/rood De optimale pH voor de urease-activiteit is 7,0. NH2 C=O + 2 H2O CO2 + H2O + 2 NH3 NH2 Beoordeling: Roodpaarse kleur Kleur onveranderd geel Positief negatief (NH4)2CO3 Nummer PRB43 Versie 001 BONTE RIJ Datum 21-7-17 Opsteller Kun Bladzijde 2/7 Kligler-iron-agar In deze buis kunnen drie reacties aangetoond worden. De omzetting van glucose en de omzetting van lactose. De omzetting/reductie van zwavelhoudende moleculen (eiwit , thiosulfaat) onder vorming van sulfide. Bij aanwezigheid van Fe 2+ ionen wordt FeS gevormd, te zien als een zwarte neerslag in de buis. De buis bevat de koolhydraten lactose en glucose in een verhouding van 10:1, zeer veel pepton (eiwit) en andere nutriënten, zodat de meeste aërobe micro-organismen er goed op kunnen groeien. Het medium bevat geen remmende stoffen. Voor het ontdekken van H2S zijn ijzersulfaat en natriumthiosulfaat toegevoegd. Fenolrood dient als indicator. Deze slaat om bij pH 6,8. Het geheel is gebufferd bij pH 7,4. De voedingsbodem wordt in de buis gegoten en schuin gestold. Hierdoor ontstaan als het ware twee afdelingen: de eerste is de schuine bovenzijde, die wordt blootgesteld aan zuurstof uit de lucht en is aëroob; de tweede afdeling bestaat uit het diep onderliggende gedeelte en is min of meer afgesloten van de lucht en dus betrekkelijk anaëroob. Bij het beoordelen van de buis kunnen de volgende mogelijkheden zich voordoen: Gehele medium is rood Diepe deel is geel, het schuine deel is rood Gehele medium is geel Er zitten gasbelletjes of scheurtjes in het medium Er is zwarte neerslag aanwezig De suikers werden niet of zwak gefermenteerd, er werd een onvoldoende hoeveelheid zuur gevormd. Door de vorming van aminen op het schuine deel en de alkalische buffers ontstaat in het medium een rode kleur. Dit betekend dat een micro-organisme alleen glucose omzet en geen lactose, hierdoor ontstaat in het medium slechts een kleine hoeveelheid zuur. Door de groei van bacteriën op het schuin stuk en de aanwezigheid van zuurstof komen op het schuine deel aminen vrij die de pH doen stijgen, waardoor het schuine stuk rood wordt, onderin de buis is de afbraak van eiwitten onvoldoende om het zuur te neutraliseren en blijft het medium geel De micro-organismen zetten lactose om. De hoge concentratie aan lactose zorgt voor vrij veel zuur. De hoeveelheid zuur is voldoende om de basische reactie van het schuine deel te neutraliseren, zodat het medium de hele buis geel kleurt. Dit duidt op de vorming van gas bij de afbraak van de koolhydraten in het medium In de buis bevindt zich natriumthiosulfaat en ijzersulfaat. Natriumthiosulfaat levert zwavel en ijzersulfaat levert ijzer, dat met H2S reageert en het onoplosbare zware neerslag, ijzersulfide vormt. Nummer PRB43 Versie 001 BONTE RIJ Datum 21-7-17 Opsteller Kun Bladzijde 3/7 MI (motility/indol) In deze buis wordt gecontroleerd of een micro-organisme tryptofanase heeft. Dit is een enzym wat het aminozuur tryptofaan splitst waarbij indol ontstaat. De voedingsbodem bevat tryptofaan of pepton. De volgende reactie vindt plaats: L.tryptofaan indol + pyruvaat + ammoniak. De afbraak van pyruvaat levert de benodigde energie op voor de groeiende bacterie via de citroenzuuryclus. Uit de vrijgekomen ammoniak kan de bacterie, gebruikmakend van de vrijgekomen energie, nieuwe aminozuren opbouwen. Het gevormde indol kan worden aangetoond met Kovac’s reagens dat met indol een rood gekleurde verbinding vormt. Beoordeling: Na toevoegen Kovacs reagens een rode ring Na toevoegen Kovacs reagens geen rode ring, medium neemt de gele kleur van het reagens aan Soms ontstaat een oranje kleur Positief Negatief skatol aanwezig, voorloper van indol Tevens wordt gekeken naar de motility (beweeglijkheid) van de bacterie. Beoordeling: Alleen entstreep zichtbaar Bacterie bevindt rondom de entstreep. Bacterie bevindt zich door de gehele buis. Niet beweeglijk Beweeglijk Beweeglijk Nummer PRB43 BONTE RIJ Datum 21-7-17 Versie 001 Opsteller Kun Bladzijde 4/7 Citraat Deze test wordt gedaan om te kijken of een micro-organisme in staat is om citraat als enige koolstofbron te gebruiken. Het principe van de test is als volgt: Citraat wordt gesplitst door de werking van het enzym citratase. Om actief te kunnen zin heeft het enzym magnesium of mangaan nodig is hulpstof. De eindproducten die bij het citraatmetabolisme ontstaan, hebben invloed op de pH van het medium. De reactie verloopt als volgt: Citraat oxaalacetaat + acetaat Pyruvaat + CO2 Het pyruvaat wordt verder afgebroken. De indicator in dit medium is broomthymolblauw. Bij pH 6,0 is deze groen bij een pH van 7,6 wordt deze diepblauw. Beoordeling: Diepblauwe kleur Groene kleur Positief Negatief Glucose/gasbuis De afbraak van glucose gebeurt al of niet onder de vorming van gas (b.v. CO 2). Om te kijken of er gasvorming plaats vindt wordt een Durhambuisje in de glucose buis gedaan. Verder worden er organische zuren gevormd. Deze organische zuren zorgen er voor dat de indicator omslaat van groen naar geel. Beoordeling: Gele kleur Groene kleur Glucose positief Glucose negatief Luchtbel in Durhambuisje Geen luchtbel in Durnhambuisje Gas positief Gas negatief Nummer PRB43 Versie 001 BONTE RIJ Datum 21-7-17 Opsteller Kun Bladzijde 5/7 BENODIGDHEDEN 1. Reagentia voor gramkleuring (zie PRB31) 2. Buizen met fysiologisch zout 3. Buizen met ureum-medium 4. Buizen met Kligler-Fe-medium 5. Buizen met MI-medium 6. Buizen met citraat-medium 7. Buizen met glucose-medium met een Durnhambuisje. 8. Bloedplaat (indien afwezig gebruik bouillon-plaat) 9. objectglaasjes 10. dekglaasjes 11. steriele pasteurse pipetten 12. microscoop MEDIA BEREIDING De buizen met de verschillende media staan in de koelkast gereed voor gebruik. VOORBEREIDENDE HANDELINGEN 1. Beschrijf de verkregen plaat zoals is geleerd in bij blokboek 3 (voorschrift PRB31) 2. Zoek alle buizen voor een BONTE RIJ bij elkaar. WERKWIJZE 1. Zet de buizen in de volgende volgorde: 1. fysiologisch zout, 2. ureum, 3. Kligler , 4. MI, 5. citraat, 6. glucose 2. Leg een bloedplaat gereed. 3. Neem een uitgeflambeerde, afgekoelde öse (entnaald met oogje) en tip de kolonie, die je wilt onderzoeken op de originele plaat, aan 4. Ga met je “besmette” öse in de fysiologisch zout oplossing (werk steriel, dus dop eraf, buis flamberen, met öse in de buis, buis flamberen, dop erop). 5. Ga nu met de besmette öse voorzichtig zigzag van onder af over de schuine agar in de ureum buis. 6. Ga vervolgens met de besmette öse zigzag van boven naar onder over de schuine agar in de Kligler buis en steek de öse aan het eind door de agar tot onder in de buis. 7. Beënt nu de eerste sector van een bloedplaat, dit wordt de reinkweek van de onderzochte bacterie. 8. Flambeer de öse nu uit. 9. Pak een steriele entnaald (rechte naald) en tip de originele kolonie voorzichtig aan. Steek nu dwars door de MI buis naar de bodem, flambeer de entnaald uit. 10. Pak een steriele pasteurse pipet (werk steriel) en pipetteer hiermee in de citraat en glucose buis 2 druppels uit de fysiologisch zout oplossing. 11. Maak vanuit de fysiologisch zout oplossing een gram preparaat en beoordeel deze na de kleuring. Nummer PRB43 Versie 001 BONTE RIJ Datum 21-7-17 Opsteller Kun Bladzijde 6/7 SCHEMATISCHE OVERZICHT BONTE RIJ Naam van de buis Kleur dop Fysiologisch zwart Zout Vast/ Kleur Vloeibaar inhoud Vloeibaar Kleurloos Met öse vanaf plaat Vast Geel Met öse Schuin zigzag van onder af Vast Rood Met öse Schuin zigzag van bovenaf, dan doorsteken Ureum Rood Kligler (H2S) (glucose) (lactose) Zwart MI Motility (beweging) Indol Rood Citraat Zilver Vast Schuin Groen Vloeibaar Groen met Durnhambuisje Glucose/ Gas Wijze van beënten Halfvast Recht Aflezen: Positief als: Niet aflezen Lila/rood - H2S: zwart - Glucose: boven rood, onder geel - Lactose: totaal geel Gelig/ Met rechte Kleurloos entnaald beweeglijk: doorsteken helemaal troebel - Kovacs reagens toevoegen: rode ring Groen 2 druppels Blauw/groei 2 druppels Glucose: geel Gas: belletjes in buisje Streptococcus (Entrococcus faecalis: gram+coc, katalase negatief Aesculine Bruin Vast Bruin Met öse Zwart Gal Schuin zigzag van onderin bovenaf, dan doorsteken Nummer PRB43 Versie 001 BONTE RIJ Datum 21-7-17 Opsteller Kun Bladzijde 7/7 INTERPRETATIE G H U I C L G B L 2 R N I A A E U S E D T C S W C U O R T E O M L A O E S A S G E T E L. Enteroococcus faecalis Pseudomonas Citrobacter freundii Arizona Salmonella Serratia Enterobacter Klebsiella Providencia stuartii Providencia rettgeri Morganella morganii Proteus mirabilis Proteus vulgaris Shigella Escherichia coli # = * + : : : : : 20% pos. 20-40% pos 40-60 % pos 60-85% pos > 85% pos + + + + + + + + + + + + + + * + + + + - # = = * # + + + + - # # # # + + + + # + + * = = * * * + * = = - = * # + + + # * + + + = + = + + + * + + + + + + + + + + + = A OPM. E S C U L I N E + gr+coc gr-st/P gr-st/E