bacteriele diversiteit
advertisement
MICROBIOLOGIE - DEEL III - Prof. Dr. ir. J. Swings « Biology of Microorganisms », 9de ed. (2000) BACTERIELE DIVERSITEIT 1 BACTERIA & ARCHAEA • < 10 000 species • 99% niet kweekbaar • 10% identificeerbaar • 45 000 16S rDNA sequenties • meer dan 100 bacteriele genomen gesequeneerd of onderweg K. I. Proteobacteria • 13.11 Vibrio • 13.12 Rickettsias • 13.13 Spirillen • 13.14 Schedevormende bacteriën • 13.15 Steeltjes- en knopvormende bacteriën 2 K. I. Proteobacteria Vibrio en Photobacterium • Gram – • Facultatief aeroob • Polair geflagelleerd • Vibrio cholerae • Vibrio parahemolyticus • Photobacterium 3 ‘Flashlight fish’ en Photobacterium phosphoreum Photobacterium palpebratus 4 Opkomende infecties Aziatische Cholera en ‘the broad street pump’ 5 Rickettsias • • Rickettsia R. rickettsii vlekkoorts teek R. prowazeki tyfus luis R. typhi tyfus vlo loopgravenkoorts luis Q koorts teek ehrlichiosis teek Rochalimaea R. quintana • Coxiella C. burnetii • Ehrlichia Rickettsia typhi 6 Uitslag van ‘Rocky Mountain spotted fever’ 7 Obligaat intracellulaire parasieten Rocky mountain spotted fever 8 Voornaamste ziekten veroorzaakt door intracellulaire pathogenen • Rocky mountain spotted fever Rickettsia rickettsii • Typhus Rickettsia prowazekii • Chlamydia venereal syndromes Chlamydia trachomatis • Trachoma Chlamydia trachomatis • Brucellosis Brucella abortus • Tuberculosis Mycobacterium tuberculosis • Leprosy Mycobacterium leprae • Listeriosis Listeria monocytogenes • Typhoid fever Salmonella typhi Coxiella burnetii 9 Infectie cyclus van Coxiella burnetii Spirillen • Spirillum, Aquaspirillum, Oceanospirillum en Azospirillum Magnetotaxis en magnetosomen • Campylobacter en Helicobacter • Bdellovibrio een obligaat parasiet bdelloplast levenscyclus 10 Spirillum volutans Magnetospirillum magnetotacticum 11 Aanhechting en penetratie van Bdellovibrio Ontwikkelingscyclus van Bdellovibrio bacteriovorus 12 Schedevormende Proteobacteria • Sphaerotilus • Leptothrix Sphaerotilus natans 13 Sphaerotilus natans Lepthothrix 14 Steeltjes- en knopvormende bacteriën • Inleiding cytoplasmatische extrusies, prosthecae polaire groei Plantomyces en Pirella • Bacteriën met steeltjes Caulobacter, Gallionella • Bacteriën met knoppen Hyphomicrobium Asticcacaulis biprosthecum 15 Ancalomicrobium adetum Ancalochloris perfilievii 16 Stella Celdeling 17 Hyphomicrobium celcylcus Hyphomicrobium 18 Hyphomicrobium facilis Caulobacter 19 Caulobacter celcyclus Gallionella ferruginea 20 Gallionella ferruginea K. IV. Chlamydia 21 Chlamydia 22 Delende cel van Chlamydia psittaci 23 K. V. Planctomyces / Pirella Plantomyces maris 24 K. VI. Bacteroides / Flavobacteria Bacteroides • Obligaat anaeroben • Intestinaal • Sfingolipiden 1010 – 1011 25 Sfingolipiden glycerol sfingosine vetzuur choline/ suikers Flavobacterium • Aquatisch / voedsel • Geel 26 Cytophaga / Sporocytophaga • Glijdend • Microcysten • Cellulolytisch • Geel – oranje • Aeroob • Vispathogenen: C. columnaris C. psychrophila K. VIII. Spirocheten 27 Spirocheten • Spirochaeta • Treponema syphilis • Borrelia lyme disease • Leptospira leptospirosis • Critispira Spirochaeta stenostrepta Spirochaeta plicatilis 28 Spirochaeta zuelzerae Cristispira 29 Treponema saccharophilum Tickborne Relapsing Fever Borrelia recurrentis 30 Tickborne Relapsing Fever Borrelia recurrentis Tickborne Relapsing Fever Borrelia recurrentis 31 Borrelia burgdorferi Levenscyclus van ‘Lyme disease’ K. IX. Deinococcus / Thermus 32 Deinococcus • Gram + • Outer membraan-lipid A • Rood-rose: carotenoïden • Resistent aan UV en ioniserende stralen • Reparatie mechanismen • Resistent aan mutagenen • Bodemorganisme Deinococcus radiodurans 33 Thermus • Aeroob • Gram – • Taq DNA polymerase K. XI. XII. XIII. Hypothermofielen 34 Thermotoga • Hyperthermofiel • Gram – • Anaeroob (80°C) Thermotoga maritima 35 Thermodesulfobacterium • Sulfaatreductie • Ether lipiden Aquifex • Chemolithotroof • 85°C optimum • Aeroob • O2 of NO3- als ε acceptor • Nooit chemoorganotroof 36 Aquifex pyrophilus 37