Laboratoria Stichting PAMM

advertisement
Laboratoria Stichting PAMM
Pathologie en Medische Microbiologie
Na Lunchtijd
Na Lunchtijd
Locatie
• Adherentie gebied van de PAMM
voor medische microbiologie
800.000 mensen Zuid-Oost Brabant
• Onderzoeken voor 4 ziekenhuizen,
verzorgingstehuizen en 400
huisartsen, GGD, verloskundigen
• 100.000 real-time PCR testen in
2012
MMC
Medische Microbiologie
Bacteriën
Parasieten
Schimmels
Virussen
Antibiogram
Medische Microbiologie
DNA Strand
Double Helix
DNA Strand
Supercoiled
DNA Strand
Chromosome
Medisch Microbiologisch Analist
Moleculaire Biologie
• SOA - pakket:
• Chlamydia trachomatis
• Neisseria gonorrhoeae
• Trichomonas vaginalis
• Mycoplasma genitalum
•Feces – pakket:
• Salmonella
• Shigella
• Yersinia
• Campylobacter
• Giardia lamblia
• Cryptosporidium parvum/hominis
• Entamoeba histolytica
• Dientamoeba fragilis
• STEC
• Norovirus GI / GII
• Clostridium difficile (BD MAXTM)
•Luchtweg – pakket
•Bacterieel
• Chlamydophila pneumoniae
• Mycoplasma pneumoniae
• Legionella pneumophilla
• Chlamydophila psittaci
•Viraal
• Respiratory syncytial virus (RSV)
• Rhinovirus
• Influenza A / B / H1N1
•Liquor - pakket
• Herpes simplex virus 1 / 2
• Varicella zoster virus
• Enterovirus
• Parechovirus
•Overig
• Actinobaculum schaalii
• Coxiella burnetii
• Chlamydia trachomatis LGV
• Streptococcus pneumoniae
• Mycobacterium tuberculosis
• MTB typering
• MTB resistentie
• Bordetella pertussis
• Bordetella parapertussis
• PCP
• Dermatophyten
• ESBL (extended spectrum ß-lactamases)
• Carbapenemases
• MRSA
• VRE
• Hepatitis B (kwantitatief)
• Hepatitis C (kwantitatief/genotypering)
• CMV (kwantitatief)
• EBV (kwantitatief)
Laboratorium automatisering en de
implementatie hiervan in de moleculaire
diagnostiek; robottisering en middle-ware
1982
Automatisering moleculaire biologie “past” (1993)
Boom extractie
Automatisering moleculaire biologie “past” (1993)
Automatisering ?
Detectie van de amplicon m.b.v. E.I.A.
Automatisering moleculaire biologie “past” (1997)
Commerciële testen SOA komen beschikbaar
Echter nog vele handmatige pipetteerstappen
Automatisering moleculaire biologie “past” (1997)
En vele administratieve
handelingen
Automatisering moleculaire biologie “past” (1997)
LIMS
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Schrijven van de werklijst
Voorbehandeling van de materialen
Pipetteren van de materialen in de easy-mag
Handmatig invoeren van de laboratoriumnummer in de easy-mag
Pipetteren van de mastermix
Pipetteren van DNA uit de easy-mag
Pipetteren van DNA bij mastermix
Handmatig invoeren van de laboratoriumnummers in ABI 7500 fast
Resultaten noteren op de werklijst
Handmatig invoeren van de resultaten in LIMS
Handmatig CQ waarden invoeren in excellijst voor Levy Jennings curves
Automatisering moleculaire biologie “past” (2010)
Automatisering moleculaire biologie “past” (2010)
• Sexueel Overdraagbare Aandoening
• Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae
• TOP 1: 17.000 onderzoeken per jaar
• Geen pipetteerhandelingen bij SOA
Automatisering moleculaire biologie “past” (2010)
?
Automatisering moleculaire biologie “past” (2010)
Automatisering moleculaire biologie “past” (2010)
Huidige werkwijze CT/NG/TV
Aanvraag
Neg resultaat
Pos resultaat
Automatisering moleculaire biologie “past” (2012)
• Verder terugdringen van handmatige pipetteerhandelingenbij met name feces PCR
• Installatie pipetteerrobot EVO 150, firma TECAN
• Validatie op een 5-tal criteria
• 48 van de 50 monsters minimaal 190 ul pipetteren (vettige laag)
• nauwkeurigheid/reproduceerbaarheid; 12 dispense stappen 10 ul en
gepipetteerde vloeistof wegen
• CQ waarde 75 pos en 25 neg monsters vergelijken handmatig / robot
• Controle contaminatie 48 pos en 48 neg “schaakbord-model”
• Twee weken alle fecesmonsters huidige manier en met EVO 150; 100%
correlatie
Automatisering moleculaire biologie “past” (2012)
Opstelling materialen in de EVO150
Patiëntenmateriaal
Easy-mag bootjes
Patiëntenmateriaal na
ophopingskweek
Opstelling materialen in de EVO150
ABI platen, pcr setup
Mastermix
Geëxtraheerd
patiëntenmateriaal
(DNA/RNA)
Prolongatie EVO150
Evaluatie EVO150
Huidige werkwijze feces PCR
Aanvraag
Neg resultaat
Pos resultaat
Automatisering moleculaire biologie
Automatisering moleculaire biologie
• We think, we’re on the right track!
Track and Trace
Materiaal arriveert bij AKL
Materiaal arriveert Med. Micro.
Materiaal op desbetreffende afd.
Automatisering moleculaire biologie toekomst
• BD-Max, firma Becton-Dickinson
– één apparaat waarin extractie, amplificatie en
detectie plaatsvindt
• NGS, Next Generation Sequencing
– Ziekenhuisuitbraken met resistentie bacteriën
– Typeren
– Stroomlijnen van alle data en gegevens
Bedankt voor jullie aandacht!
Download
Random flashcards
fff

2 Cards Rick Jimenez

Rekenen

3 Cards Patricia van Oirschot

Test

2 Cards oauth2_google_0682e24b-4e3a-44be-9bca-59ad7a2e66a4

kinderdagverblijf Wiekwijs

2 Cards oauth2_google_7b80f232-43ab-4a38-be6e-61287e4cdb0a

hoofdstuk 2 cellen

5 Cards oauth2_google_c110ae80-d7f3-4403-b521-4d3d8bb0f63c

Create flashcards