Klinische Biologie KHB/L22, versie: 8.3 , 17.07.2012 TOEPASSINGSGEBIED: MOLECULAIRE DIAGNOSTIEK MICROBIOLOGIE Parameters aangeduid met (A) zijn geaccrediteerd door Belac overeenkomstig de criteria van de norm ISO 15189:2007. Accreditatiecertificaat Nr. 204-MED. Parameter Opsporen van varicella zoster virus door PCR(A) Opsporen van Epstein –Barr virus door PCR Opsporen van cytomegalovirus door PCR (A) Opsporen van Mycoplasma pneumoniae door PCR (A) Opsporen van Herpes simplex virus door PCR(A) Opsporen van Bordetella pertussis door PCR Opsporen van Chlamydia pneumoniae door PCR Opsporen van Legionella pneumophila Goossens, H Matrix Testmethode Meetprincipe Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Huidvegers,vegers van blaasjesvocht, oculaire vegers, neus- en keelvegers: droge wissers of wissers in transport medium. Oculaire vochten: afgenomen door punctie Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Biopten: niet gefixeerd Bloed afgenomen in EDTA tubes Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Biopten: niet gefixeerd Bloed afgenomen in EDTA tubes Respiratoire monsters bij transplant patiënten Vruchtwater afgenomen door punctie Oogvoorkamervochten: afgenomen door punctie Cornea schraapsel Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Biopten: niet gefixeerd Respiratoire monsters Lumbaal vochten: afgenomen door punctie BAL bij transplant patiënten Oculaire vochten afgenomen door punctie Huidvegers,vegers van blaasjesvocht, gynecologische en oculaire vegers, neus- en keelvegers: droge wissers of wissers in transport medium Respiratoire monsters Respiratoire monsters Biopten: niet gefixeerd Respiratoire monsters Biopten: niet gefixeerd Extractie van viraal DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR TM Argene HSV1, HSV2,VZV R-gene Quantification Assay Apparatuur Nuclisens easyMAG Lightcycler 480 Extractie van viraal DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Nuclisens easyMAG Lightcycler 1.2 of 1.5 Extractie van viraal DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Voor plasma afgezonderd uit EDTA bloed wordt een kwantificatie uitgevoerd via een standaardkurve. Nuclisens easyMAG Lightcycler 480 Extractie van bacteriëel DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Nuclisens easyMAG Lightcycler 480 Extractie van viraal DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR TM Argene HSV1, HSV2,VZV R-gene Quantification Assay Nuclisens easyMAG Lightcycler 480 Extractie van bacteriëel DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Extractie van bacteriëel DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Extractie van bacteriëel DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Nuclisens easyMAG Lightcycler 1.2 of 1.5 Nuclisens easyMAG Lightcycler 1.2 of 1.5 Nuclisens easyMAG Lightcycler 1.2 of 1.5 ONBEHEERDE KOPIE GELDIG pag.: 1/3 Klinische Biologie Parameter KHB/L22, versie: 8.3 , 17.07.2012 Matrix Testmethode Meetprincipe Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Oculaire vochten afgenomen door punctie Vruchtwater afgenomen door punctie Extractie van parasitair DNA Apparatuur Nuclisens easyMAG Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Lightcycler 1.2 of 1.5 Opsporen van enterovirussen door PCR(A) Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Opsporen van Mycobacterium tuberculosis door PCR Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Biopten: niet gefixeerd Respiratoire monsters Lumbaal vochten: afgenomen door punctie Biopten: niet gefixeerd Respiratoire monsters Respiratoire monsters Extractie van viraal RNA Aanmaak van cDNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Extractie van bacteriëel DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Nuclisens easyMAG PTC thermal cycler Lightcycler 480 Nuclisens easyMAG Lightcycler 1.2 of 1.5 Extractie van bacteriëel DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Nuclisens easyMAG Lightcycler 1.2 of 1.5 Extractie van viraal RNA Aanmaak van cDNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Extractie van viraal RNA Aanmaak van cDNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Abbott real-time HCV Extractie van viraal RNA Aanmaak van cDNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Versant Innolipa II Extractie van viraal DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Abbott real-time HBV Extractie bacteriëel DNA Amplificatie en detectie van geamplifieerd DNA door Real-time PCR Nuclisens easyMAG PTC thermal cycler Lightcycler 480 Nuclisens easyMAG Abbott m2000 Opsporen van Toxoplasma gondii via PCR(A) Opsporen van Streptococcus pneumoniae door PCR Opsporen van influenza virus door PCR Opsporen van Hepatitis C virus door PCR(A) Bloed afgenomen in gestolde tube Genotypering Hepatitis C virus (A) Bloed afgenomen in gestolde tube Opsporen van Hepatitis B virus door PCR(A) Bloed afgenomen in gestolde tube Opsporen van MecA-Nuc genen bij Staphylokokken Petriplaat met opgegroeide stam Goossens, H ONBEHEERDE KOPIE GELDIG Nuclisens easyMAG Abbott m2000 Nuclisens easyMAG Abbott m2000 Nuclisens easyMAG Lightcycler 480 pag.: 2/3 Klinische Biologie KHB/L22, versie: 8.3 , 17.07.2012 TOEPASSINGSGEBIED: MOLECULAIRE DIAGNOSTIEK HEMATOLOGIE Parameter IgH clonaliteitstest, immunoglobuline genherschikking(A) TCRgamma clonaliteitstest, TCRG genherschikking(A) Matrix BCR-ABL p210 fusiegentranscript(A) bloed beenmergaspiraat, biopt bloed beenmergaspiraat biopt bloed beenmergaspiraat BCR-ABL p190 fusiegentranscript(A) bloed beenmergaspiraat WT1 genexpressie(A) bloed beenmergaspiraat PML-RARA fusiegentranscript (A) bloed beenmergaspiraat Opsporen van JAK2 V617F mutatie(A) Screening translocaties (A) bloed beenmergaspiraat bloed beenmergaspiraat bloed beenmergaspiraat CBFB-MYH11 (A) RUNX1-RUNX1T1 (A) Goossens, H bloed beenmergaspiraat Testmethode Meetprincipe Extractie van DNA: QIAamp DNA mini kit (QIAgen) PCR met BIOMED 2 primers: IdentiClone IGH Gene Clonality Assay (Invivoscribe) Detectie d.m.v. capillaire electroforese Extractie van DNA: QIAamp DNA mini kit (QIAgen) PCR met BIOMED 2 primers: IdentiClone TCRG Gene Clonality Assay (Invivoscribe) Detectie d.m.v. capillaire gelelectroforese Extractie van RNA: RNeasy Mini kit (QIAgen) Aanmaak van cDNA: in-house M-MLV RT protocol Detectie d.m.v. kwantitatieve real-time PCR: BCR-ABL Mbcr Fusionquant Kit (Ipsogen) Extractie van RNA: RNeasy Mini kit (QIAgen) Aanmaak van cDNA: in-house M-MLV RT protocol Detectie d.m.v. kwantitatieve real-time PCR: BCR-ABL mbcr Fusionquant Kit (Ipsogen) Extractie van RNA: RNeasy Mini kit (QIAgen) Aanmaak van cDNA: in-house M-MLV RT protocol Detectie d.m.v. kwantitatieve real-time PCR: WT1 ProfileQuant Kit (Ipsogen) Extractie van RNA: RNeasy Mini kit (QIAgen) Aanmaak van cDNA: in-house M-MLV RT protocol Detectie d.m.v. kwantitatieve real-time PCR: PML-RARA Fusionquant Kit (Ipsogen) Extractie DNA: QIAamp DNA mini kit (QIAgen) Detectie d.m.v. allel-specifieke real-time PCR: JAK2 Mutscreen Ez Kit (Ipsogen) Extractie van RNA: RNeasy Mini kit (QIAgen) Hemavision: Multiplex RT-PCR system for typing/subtyping of leukemia Extractie van RNA: RNeasy Mini kit (QIAgen) Aanmaak van cDNA: in-house M-MLV RT protocol Detectie d.m.v. real-time PCR (kwantitatief) Extractie van RNA: RNeasy Mini kit (QIAgen) Aanmaak van cDNA: in-house M-MLV RT protocol Detectie d.m.v. real-time PCR (kwantitatief) ONBEHEERDE KOPIE GELDIG Apparatuur PTC thermal cycler ABI3130 genetic analyzer PTC thermal cycler ABI3130 genetic analyzer Veriti thermal cycler Lightcycler 480 Veriti thermal cycler Lightcycler 480 Veriti thermal cycler Lightcycler 480 Veriti thermal cycler Lightcycler 480 Lightcycler 480 PTC thermal cycler Veriti thermal cycler Lightcycler 480 Veriti thermal cycler Lightcycler 480 pag.: 3/3