Trends in methoden voor voedingsmiddelenonderzoek Harm Janssens 5 oktober 2016 Rotterdam Inhoud Metaal-analyse Anorganisch en organometaalverbindingen Valentie analyses (Cr3+ /Cr6+ ) Ratio van vreemde aarden DNA/RNA –analyse DNA-analyse Foodborne pathogenen ‘Lab on chip’ Analysespectrum TLR Nutriënten; Mineralen; Zware metalen; Microscopisch onderzoek; Industriële contaminanten; Bestrijdingsmiddelen; Biotoxins; Phyto-toxins; DNA-diagnostiek Werkgebied van TLR/Peterson/Control Union Metaal-onderzoek: ontwikkeling AAS- instrumenten ICP-AES ICP- MS HPLC-ICP-MS Metaal-onderzoek : ICP-MS Vele metalen (mineralen en metalen) Kwik Interferenties Zeldzame aarden onderzoek (isotoop-ratio) (Scandium, yttrium, lanthaniden en actiniden) Vergelijkingsonderzoek Herkomstonderzoek Zeldzame aarden onderzoek (isotoop-ratio) - Vergelijkingsonderzoek - Verhouding tussen vreemde aarden (geografisch bepaald) afwijkend lot 3 lots 4 lots Ukraine zonnebloemschrootpellets Zeldzame aarden onderzoek (isotoop-ratio) - Herkomstonderzoek - Vergelijking van de verhouding tussen 18 zeldzame aarden. - Database met verhouding - Monsters van verschillende locaties - Algoritme voor dataprocessing - SIMCA (soft independent modeling of class analogy) Data processing: visual discrimination Braziliaanse mais Hongaarse mais Zeldzame aarden onderzoek (isotoop-ratio) - Database van sojabonen (>400 monsters) (Polen, Brazilië , Canada, Noord Amerika) - Met SIMCA-model - 98% Braziliaanse sojabonen correct geclassificeerd - 100% Poolse sojabonen correct geclassificeerd - 96% Noord-Amerikaanse sojabonen correct geclassificeerd - 86% Canadese sojabonen correct geclassificeerd HPLC-ICP-MS HPLC-ICP-MS: Regelgeving voeding Product Max. concentratie arseen (anorganisch)* mg/kg Niet voorgekookte volwitte rijst (gepolijste of witte rijst) 0,20 Voorgekookte en gedopte rijst 0,25 Rijstwafels, rijstvellen, rijstcrackers en rijstkoeken 0,30 Rijst bestemd voor de productie van voedingsmiddelen voor zuigelingen en peuters 0,10 HPLC-ICP-MS: Regelgeving non-food Product Max. concentratie chroom (VI) mg/kg 5. Lederwaren die in contact komen met de huid mogen niet in de handel worden gebracht indien het gehalte aan chroom(VI) gelijk is aan of groter is dan 3 mg/kg (0,0003 gewichtsprocenten) van het totale drooggewicht van het leer. 6. Voorwerpen met leren onderdelen die in contact komen met de huid mogen niet in de handel worden gebracht indien het gehalte aan chroom(VI) gelijk is aan of groter is dan 3 mg/kg (0,0003 gewichtsprocenten) van het totale drooggewicht van dat leren onderdeel. 7. De punten 5 en 6 zijn niet van toepassing op het in de handel brengen van tweedehandsvoorwerpen die voor 1 mei 2015 in eindgebruik waren in de Unie.”. Chroom analyse Arseen (As3+ en As5+) en DMA voedingsmiddelen Kwik en Methylkwik in visproducten DNA- en RNA-analyse voedingsmiddelen Ontwikkelingen bij PCR (polymerase chain reaction) 2004 : 1 signaal/amplificatie curve meten 2006: - 8 signalen/amplificatie curves te meten - Smeltcurve DNA voor identificatie DNA- en RNA-analyse voedingsmiddelen Detectie van: - Dier- en vis species - Plant species - GMO-analyse, Allergenen met PCR - Pathogenen en typering - Salmonella, STEC/EHEC, Vibrio spec. and Clostridium botulinum - Virussen - 6 virussen (e.g. Norovirus, Hepatitus A, Rotavirus) DNA- en RNA-analyse voedingsmiddelen PCR (polymerase chain reaction) DNA- en RNA-analyse voedingsmiddelen GMO/GGO genetically modified organisms Events (transformation event), Stacked events (meerdere events toegepast), Promotors (stukje DNA dat het proces start om nieuwe eiwitten te maken.) Terminator (stukje DNA dat de aanmaak van eiwitten weer uitschakelt) Ong. 3000 geregistreerde GMO’s, Soja, mais, raap, rijst, suikerbiet, katoen, aardappel, tomaat,…. Ong. 50 GMO’s hebben een toelating in de EU (incl stacked events) Regelgeving GMO Verordening (EG) nr. 1829/2003 Deze verordening heeft betrekking op genetisch gemodificeerde organismen in levensmiddelen en diervoeders. Verboden events niet aantoonbaar (<0,1%) Toegestane events Labelling > 0,9% GMO Som van alle GMO’s Stacked events?? Onvermijdbare contaminatie GMO-analyse (Screening op vreemd DNA) Inserted DNA = construct Inserted DNA = construct plant DNA Screening promotor GEN terminator Analyse van gemeenschappelijke stukjes DNA (promotor, terminators. ..) promotor GEN terminator plant DNA GMO-analyse (Screening) Screening: multi-analysis promotors/terminators (gemanipuleerd) - 35S-promotor (cauliflower mosaic virus promotor) - NOS-terminator (Nopalin Synthase Terminator (NOS) of Agrobacterium tumefaciens) - FMV promotor ( Figwort mosaic virus promoter) - BAR (gene of Streptomyces Hygroscopicus) - CTP2:CTP4 EPSPS (gene of Arabidopsis Thaliana and Agrobacterium spp) - PAT-gene (isolated soil-bacteria) - Nptll-gene (antibioticumresistentie-gen) - Cry 1Ac/Ab-gene (aanmaak van fusie-eiwit) GMO-analyse (Screening) - DNA sequenties (genomes) ,welke veelvuldig bij GMO’s worden toegepast. - Gevonden sequentie en CP’s geeft indicatie van welke events er inzitten - Als screening niet kan worden verklaard Niet toegelaten events (LL601,BT63,--) Bijmenging (voorgaande lading???) - Probleem: Toename non-target events Vals negatief GMO-analyse (event-analyse) Inserted DNA = construct plant DNA Screening promotor GEN terminator Analyse van gemeenschappelijke stukjes DNA (promotor, terminators. ..) Inserted DNA = construct promot or GEN terminator plant DNA GMO-analyse (event-analyse) Uitdrukking van analyseresultaat Resultaat wordt altijd relatief uitgedrukt ten aanzien van referentie gen van de plant . Soja lecthin-gen Raap cruciferin-gen Mais zea-gen % GMO-soya/ soya plantgen 0,1% soja in pasta kan 100% GMO (mogelijk onbedoelde bijmenging??) Soja-content is beste te bepalen met soja-eiwit met de ELISA-methode. Typification meltingpoint of DNA Typification meltingpoint of DNA - 8 STEC/EHEC species in meat and fruits - 3 Vibro species in fish - 4 Clostridium botulinum - …. Typification meltingpoint of DNA 8 STEC/EHEC species in meat and fruits Chip or array-analysis analysis Typification of Salmonella with Chip or array-analysis - Salmonella species (145) Technische ontwikkelingen PCR-systemen met nog meer informatie kanalen 16 en 32 analyses Whole-genome sequences met next generation sequencers Het gehele genome (DNA) wordt voor 30000 base-pairs bepaald. Panel analyse van genome fragmenten Fragmenten gezamenlijk voorkomen binnen een genome. Bedankt voor aandacht / vragen?