Mamaprint

Mamaprint
Mammaprint
• Mammaprint
genexpressieprofiel
• Heeft alleen zin als je weet wat de functie van het gen is!!
Tumordiagnostiek
Zoek relevante genen:
• Groei
• Deling
• Differentiatie
Bijvoorbeeld
Oncogenen:
• Regulatie van celgroei en celdeling
Tumorsuppressorgenen:
• Genen die coderen voor eiwitten die celdeling stoppen
Kanker
Ongecontroleerde deling
Ontregeling door mutaties
Kloon van abnormale cellen = tumor
• Goedaardig  lokaal
• Kwaadaardig  verspreiding (metastase)
Kanker
• Doodsoorzaak nr 2
• Doodsoorzaak nr 1?
• Hart en vaatziekten
DNA chip
• Micro array:
• Bekende genen in vaste volgorde op glasplaat
Genexpressieprofiel
• Welke actieve genen
• Info over:
• Welk celtype is gaan woekeren
• Tumorstadium
•  wat is de beste behandeling?
DNA sample
Micro array
• Iedere positie bevat enkelstrengs oligonucleotide
• Actieve genen produceren mRNA
Reverse transriptase
• Maakt cDNA copy
van mRNA
• cDNA = enkelstrengs
• Gelabeld met
fluorochroom
• Breek mRNA af
• Elke positie bevat
oligonucleotide
Representatief voor gen
Binding met
• cDNA van actief gen
maakt mRNA
Indentificatie
• Groen=
Actieve genen in
controleweefsel
Identificatie
• Rood=
Actieve genen in
tumorweefsel
Identificatie
• Genen die in beide
weefsels actief zijn
Interpretatie
• Vergelijken expressieprofiel controle + tumor weefsel