Tourette disorder spectrum maps to chromosome 14q31.1 in an

advertisement
Tourette disorder spectrum maps to chromosome 14q31.1 in an Italian kindred
Neurogenetics
Guido J. Breedveld, Giovanni Fabbrini, Ben A. Oostra, Alfredo Berardelli, and Vincenzo Bonifati
Corresponding Author: Dr. V. Bonifati, Dept. Clinical Genetics, Erasmus MC, Rotterdam, The Netherlands
E-mail: [email protected]
Online Resource 4
Results of sequence analysis
Nucleotide variants detected in four affected family members by sequencing analysis. For each variant the reference
dbSNP-ID code, the position in the gene, the nucleotide and the predicted amino acid change are listed.
location
DNA
protein
dbSNP reference
GENOTYPE ID
V-1
V-3
III-8
IV-14
STON2 (NM_033104.2)
exon4
t919c
S307P
rs3813535
hom
hom
hom
hom
exon5
t2551g
S851A
rs2241621
hom
hom
hom
hom
promoter
intron1
intron5
5utr-133 g->t
IVS1+44 ins t
IVS5+69 t->c
untranslated
untranslated
untranslated
rs3742722
rs3832963
rs8016507
hom
hom
hom
hom
hom
hom
het
het
het
het
het
het
intron13
exon13
IVS13+26 c->t
t1410a
untranslated
A470A
rs4523859
rs45535733
wt
het
wt
wt
het
wt
wt
wt
exon14
intron18
a2195g
IVS18-51 del aactcgt
H732R
untranslated
rs327463
rs66617390
hom
het
hom
wt
het
wt
het
wt
3utr
3utr+438 ins gc
untranslated
rs33941291
het
het
het
wt
untranslated
rs8019633
hom
hom
hom
hom
C14ORF145 (NM_152446)
SEL1L (NM_005065)
no variants detected
GTF2A1 (NM_201595)
intron4
IVS4+86 t->a
SNORA79 (NR_003021)
no variants detected
DIO2 (NM_001007023)
intron1
exon3
3utr
3utr
3utr
3utr
3utr
IVS1-30 t->c
a382g
3utr+760 g->a
3utr+1453 c->t
3utr+1523 a->t
3utr+1806 t->a
3utr+3917 t->c
untranslated
T128A
untranslated
untranslated
untranslated
untranslated
untranslated
rs56033314
rs225014
rs7140952
rs225015
rs225016
rs225017
rs225018
wt
wt
wt
wt
wt
wt
wt
wt
wt
wt
wt
het
het
wt
het
het
het
wt
het
het
het
wt
wt
wt
het
het
het
het
intron1
intron7
intron8
intron8
intron8
intron8
exon10
3utr
3utr
3utr
3utr
3utr
IVS1+63 g->c
IVS7-31 del tctc
IVS8+48 t->a
IVS8+57 -/ctttttactttttt
IVS8+163 a->g
IVS8+209 c->a
g2181c
3utr+172 c->a
3utr+245 c->t
3utr+431 t->c
ins a 3utr+1151
3utr+1152 ins t
untranslated
untranslated
untranslated
untranslated
untranslated
untranslated
E727D
untranslated
untranslated
untranslated
untranslated
untranslated
rs2239610
rs56751666
rs28516678
rs35438589
rs3783942
rs3783941
rs1991517
rs2268477
rs7144481
rs17630128
rs35197772
rs3214569
het
het
het
het
het
het
hom
wt
hom
het
hom
hom
wt
het
het
het
het
het
hom
wt
hom
het
hom
hom
wt
het
het
het
het
het
hom
wt
het
het
het
het
wt
het
het
het
het
het
hom
het
hom
het
hom
Hom
TSHR (NM_000369)
Download